鉬酸銨廣泛用作生產高純度鉬制品的基本原料。比如，熱解離鉬酸銨生產高純三氧化鉬、用硫化氫硫化鉬酸銨溶液生產高純二硫化鉬，通過鉬酸銨生產各種含鉬的化學試劑等。鉬酸銨也常用作生產鉬催化劑、鉬顏料等鉬的化工產品的基本原料。

1、用作石油工業的催化劑，冶金工業中用于制取鉬，是制造陶瓷釉彩、顏料及其他鉬化合物的原料。

2、本品為添加型阻燃劑，具有阻燃和抑煙雙重功能，與其他阻燃劑復配可降低成本，提高阻燃性，減小發煙量。三氧化鉬亦有阻燃和抑煙的雙重作用，它與三水合氫氧化鋁和氧化銻都顯示出了一定的協同效果。

3、用作分析試劑，用于光度法或薄層色譜法測定磷酸鹽、亞磷酸鹽、青霉素類物質。還用于照相業、陶器釉彩。

4、用于配制鋼鐵粘接用的除油、除銹、磷化、鈍化四合一表面處理劑。也用作石油脫氫、脫硫催化劑的原料。還可用于制金屬鉬、顏料、農用微量元素肥料中的鉬肥用。

5、鉬酸銨用作鍍鋅層的黑色鈍化溶液，化學鍍鎳中用作穩定劑，也用作鋼鐵磷化液的氧化劑等