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CelGreen(10000*)核酸染料
貨號:CG001
儲存條件: 常溫避光可保存2年。
CelGreen核酸染料特點
●無毒性:CelGreendu特的油性和大分子量特點使其不能穿透細胞膜進入細胞內,艾姆斯氏試驗結果也表明,該染料的誘變性遠遠小于EB。
●靈敏度高:適用于各種大小片段的電泳染色,對核酸遷移的影響小于SYBR Green I。
●穩定性高:適用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠;室溫下在酸或堿緩沖液中極其穩定,耐光性強。
●信噪比高:樣品熒光信號強,背景信號低。
●操作簡單:與EB一樣,在預制膠和電泳過程中染料不降解;而電泳后染色過程也只需30分鐘且無需脫色或沖洗 ,即可直接用紫外凝膠透射儀觀察。
●適用范圍廣:可選擇電泳前染色(膠染法)或電泳后染色(泡染法);適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于 dsDNA、ssDNA 或 RNA 染色。
●在254nm可見光附近可得到最佳激發。
CelGreen使用方法簡介
1.膠染法(用法同EB)(推薦方法)
(1)制膠時加入CelGreen 核酸染料(例如:每50mL 瓊脂糖溶液中加入5μL CelGreen 10,000× 儲液,以此比例類推)。
(2)按照常規方法進行電泳。
注意事項:
u此方法染色染料用量相對較少。500 μL染料大約可以做100塊 50mL的膠。
u由于CelGreen具有良好的熱穩定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉以保證染料充分混勻。也可以選擇將CelGreen儲液加到瓊脂糖粉末 和電泳緩沖液中,然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。CelGreen兼容所有常用的電泳緩沖溶液。
u如果總是看到條帶彌散或分離不理想,建議使用泡染法染色以確認問題是否與染料有關。如果染色后問題依舊存在,則說明問題與染料無關,請嘗試:降低瓊脂糖濃度;選用更長的凝膠;延長凝膠時間以保證邊緣清晰;改進上樣技巧或選擇泡染法染色。
u此方法不適合預制聚丙烯酰胺凝膠,對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。
2.泡染法
(1)按照常規方法進行電泳。
(2)用H2O將CelGreen 10,000× 儲液稀釋約3,300倍到0.1M NaCl中,制成3× 染色液(例如將15μL CelGreen 10,000× 儲液和5mL 1M NaCl加到45mL H2O中)。
(3)將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3× 染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右,最佳染色時間根據凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對 于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時間通常介于30min到1h,并隨丙烯酰胺含量增加而延長。
(4)用 480nm 可見光系統觀察結果。
注意事項:
u用泡染法染色時,染料用量較多。單次使用的染色液可重復使用3次左右。
u3 × CelGreen染色液可以大量制備,在室溫下避光保存直至用完。
3.核酸電泳的PAGE步驟:
(1)將TBE制備的凝膠放入電泳槽中,用夾子夾住邊緣。
(2)用配置凝膠溶液同一批次的5×TBE灌滿緩沖液槽。用注射器排除凝膠底部的氣泡。
(3)用注射器吸取1×TBE沖洗加樣孔。將DNA樣品和適量的6×凝膠上樣緩沖液混合,用微量移液管加入加樣孔。
(4)將電極與電源相連(正極接下槽),打開電源一般90V;1~8V/cm。進行電泳9h。
(5)電泳至標準參照染料遷移至所需位置(一般是電泳到二甲苯wan全遷出,溴酚藍距底邊2~3cm停止)。關閉電源,拔掉插頭,棄去電泳槽中的電泳液。
(6)將凝膠取下來放入,染色皿中,加3XCelGreen的1X緩沖液中的振蕩染色30-60分,放置在紫外檢測即可。
注意事項:
PAGE膠與瓊酯糖凝膠不同,不能用預染或點染的方法;只能用泡染的方法顯色,由于聚丙
烯酰胺比較致密,染料不容易深入,顯色效果沒有瓊酯糖凝膠好。
特別提醒:
u如果您使用的是紫外成像儀,請選擇CelRed;如果您使用激光成像儀或希望在可見光下觀測,請選擇CelGreen。
u在極少數情況下,質粒經某些酶切后的DNA樣品會出現拖尾和分辨率降低,此時建議同時嘗試兩種染色方法以決定哪種方法更加合適。
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