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QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備試劑盒，用于Illumina

在QuantSeq文庫制備過程中節(jié)省成本并簡化了球蛋白mRNA的消耗

全基因組基因表達分析

具有成本效益的微陣列和標準RNA-Seq替代品

總RNA輸入低100 pg

適用于低質量和FFPE樣品

在Bluebee的免費數(shù)據(jù)分析管道®基因組學分析平臺

單讀數(shù)測序，多達9,216個樣品/泳道

提供雙重索引和唯yi分子標識符（UMI）

QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備試劑盒，用于Illumina

QuantSeq FWD試劑盒是一種文庫制備方案，旨在生成與聚腺苷酸化RNA的3'末端接近的Illumina兼容文庫。

QuantSeq FWD在第二條鏈合成引物中包含Illumina Read 1接頭序列，因此朝poly（A）尾部生成NGS讀數(shù)，直接反映了mRNA序列（請參見工作流程）。此版本是基因表達分析的推薦標準。Lexogen進一步提供了具有可選雙索引（i5和i7索引）的高通量版本，允許在一個通道中多路復用多達9,216個樣本。

 

低投入低質量樣品分析

總RNA的所需輸入量低100pg。QuantSeq適合從低質量的RNA（包括FFPE樣品）可重復生成文庫。相同樣品的兩種不同RNA品質（FFPE和新鮮冷凍冷凍塊）的比較

QuantSeq文庫制備過程中耗盡球蛋白mRNA

新！ 用于QuantSeq的Globin塊模塊可從全血中僅50 ng的總RNA中生成缺失珠蛋白的，易于測序的3'mRNA-Seq文庫。無需其他協(xié)議步驟。該模塊中的RS-Globin Block解決方案僅取代了QuantSeq試劑盒中的標準RNA去除解決方案。使用Globin Block進行QuantSeq，可將映射到球蛋白mRNA的讀圖從50％到80％降低到5％（圖4），并且基因檢測顯著增加（圖5）。

*對于附圖：輸入RNA（50 ng或250 ng）的提取方法如下：1個 SPLIT RNA提取試劑盒，2個其他試劑盒（包括紅細胞裂解液）或3個其他試劑盒沒有紅細胞裂解液

 

快速周轉

QuantSeq的簡單工作流程允許僅在4.5小時內（包括不到2小時的動手時間）生成即可測序的NGS庫。

基因表達定量的直接計數(shù)

每個轉錄本僅產生一個片段；因此，不需要長度標準化。這樣可以更準確地確定基因表達值，并使QuantSeq成為基因表達研究中微陣列和常規(guī)RNA-Seq的佳替代品。

 

簡單的生物信息學分析

通過跳過結檢測，可以簡化讀取映射。在轉錄物的3'末端幾乎沒有連接處產生讀數(shù)。因此可以加速數(shù)據(jù)處理。

 

QuantSeq數(shù)據(jù)分析管道還集成在Bluebee基因組學分析平臺上，即使沒有生物信息學背景，任何用戶也可以使用。訪問代碼包含在QuantSeq套件中。可以在網上商店購買其他代碼。*：直到2019年12月31日，免費提供高達1.5 GB輸入的附加代碼。

 

高鏈特異性

QuantSeq保持> 99.9％的異常鏈特異性，并允許將讀數(shù)映射到基因組上的相應鏈，從而能夠發(fā)現(xiàn)和定量反義轉錄本和重疊基因。

 

節(jié)省成本的復用

QuantSeq庫旨在用于高度復用。單個索引套件（目錄號015）中多包括96個i7索引。還可以使用Lexogen i5 6 nt雙索引附加組件（目錄號047或015.384）引入其他i5索引。一起使用，Lexogen的96 i7和96 i5 6 nt索引可為測序提供多達9,216種不同的索引組合。

 

新！QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備物現(xiàn)在也可提供多達384種預混合的*雙索引（目錄號113、114、115）。Lexogen的新型12 nt UDI具有出色的糾錯功能，可大程度地輸出測序數(shù)據(jù)，也可作為獨立的附加套件（目錄號107 – 111）與其他文庫制備工具一起使用。

 

這種高水平的多路復用可以節(jié)省成本，因為QuantSeq中的長度限制可以節(jié)省測序空間。QuantSeq還設計用于產生短測序讀段（SR50，SR100）的插入片段大小。

 

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