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TOM-酰胺在RNA合成中的亮點:1,2
ChemGenes 根據GMP準則生產2' - O-三異丙基甲硅烷基-氧基甲基(TOM)酰胺。ChemGenes擁有完善的技術,可以以優(yōu)惠的價格生產大量(千克級批次)TOM酰胺。
TOM酰胺非常適合大規(guī)模治療級RNA合成,長RNA序列,適體,siRNA和生物學上重要的RNA分子。
以下品質使TOM酰胺成為治療性寡核苷酸生產的理想選擇。
像DNA酰胺一樣,TOM酰胺具有更高的偶聯效率。觀察到的每步耦合效率始終> 98%。
較高的耦合效率歸因于TOM組的較低位阻。
快速的偶聯時??間(對于不同規(guī)模的合成,需要2-4分鐘),并且*沒有3'雜質。
N保護基團的脫保護時間短,取決于鏈長和大量的水,時間為4-6小時。
使用的不穩(wěn)定的堿保護基是(N -Ac-A;N -Ac-C和N -Ac-G)。
在溫和條件下和大量過量的水中可輕松去除TOM保護基,而*。
對使用TOM酰胺合成的寡核苷酸質量的研究表明,使用TOM酰胺合成的RNA寡核苷酸經過單次離子交換純化并通過CE(圖1)和ESI / MS分析進行分析后,其質量遠遠優(yōu)于其他寡核苷酸。
使用TOM酰胺化學法可整體上減少時間。所有步驟,即。,堿基脫保護,TOM脫保護和易于純化。除了高產率之外,該方法還導致高純度。
圖1:使用2'- O- TOM酰胺的HPLC純化的12-mer RNA(12μmol 規(guī)模)的毛細管凝膠電泳(CE)。
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確認沒有甲醛加合物形成的研究:
在甲硅烷基的損失和甲醛的產生期間,不會導致核苷堿基的C-5甲酰化或N-甲酰化。這是由于存在aq。TRIS緩沖液(pH 7.4),可捕獲所有產生的甲醛并防止任何堿修飾(方案1)。從ESI / MS分析光譜數據可以明顯看出這些結果。質譜數據均未顯示對應于羥甲基加合物(CH2-OH)的任何峰,無論是單個單元(M + 30)還是多個M + 30單元(圖2a和圖2b)。這些結果說明了使用TOM酰胺的清潔RNA合成。
方案1: TOM脫保護和捕獲甲醛的示意圖。
圖2: ESI MS分析確認沒有M + 30或M + 30加合物的倍數;目標MS為3715.3(實測值為3715.3)。
RNA合成:
RNA的重要性早已在細胞過程中得到認可。關注的主要領域是反義RNA 1和催化RNA在剪接和連接中的作用。2定義序列的化學合成RNA是開發(fā)和了解RNA的作用和應用的基礎。使用RNA聚合酶的酶促方法是模板依賴性的,因此不是受控序列合成。3 RNA的化學合成已經完善到一定程度,可以有效地產生長序列,例如具有生物活性的76-mer tRNA和多毫克量。4
小干擾RNA:
自線蟲秀麗隱桿線蟲5的描述以來RNAi已成為一種功能強大且廣泛使用的基因下調工具,Andrew Fire和Craig Mello榮獲2006年諾貝爾醫(yī)學獎,以表彰RNAi機制的發(fā)展。RNAi途徑由稱為Dicer的內源性核糖核酸酶啟動,該酶將長dsRNA分子加工成21-23個核苷酸的長siRNA分子的短片段,兩個核苷酸3'突出端。siRNA分子整合到RNA誘導的沉默復合體(RISC)中,兩條siRNA鏈之一解開。在RISC中關聯的單鏈反義分子序列選擇性結合特定的mRNA轉錄物,并且來自該復合物的內切核酸酶切割目標mRNA。從近幾年開始6
RNAi提供了在細胞水平上了解和處理人類疾病的天文潛力。在廣闊且迅速發(fā)展的siRNA領域中,該領域的一些重要進展是對細胞生物學和功能基因組學領域的自然調控機制的預測。預期這將導致基于基因的藥物發(fā)現。目前,*許多研究人員都極力主張進行基因控制,基因敲除和靶標驗證。短dsRNA 通過化學合成獲得。ChemGenes專業(yè)生產高純度的RNA單體,用于該領域的研究和進一步開發(fā)。
乙硫基四唑(ETT)和苯硫基四唑(BMT)的用途:
已證明在合成中使用ETT或BTT作為激活劑可提高每個步驟的偶聯效率。
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產品貨號 產品名稱 品牌 規(guī)格
Macosko-2011-10(V+) Barcoded microparticles Chemgenes 10umol
DMT-1972 Extra large Drying Traps ChemGenes pack 10
DMT-1973 Large Drying Traps ChemGenes pack 10
"DMT-1975" Small Drying Traps ChemGenes pack 10
N-4000-03 "Universal UnyLinker Support ChemGenes
N-4000-05 Universal UnyLinker Support 500 ChemGenes 1g
N-4000-20 Universal UnyLinker Support 2000 ChemGenes 1g
N-4000-10 Universal UnyLinker Support 1000 ChemGenes 1g
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