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12206ES08Fast Tagment 轉座酶法建庫試劑盒
參考價: 面議
具體成交價以合同協議為準
  • 12206ES08 產品型號
  • Yeasen/翌圣生物 品牌
  • 生產商 廠商性質
  • 上海市 所在地

訪問次數:1768更新時間:2022-03-21 14:53:45

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上海市浦東新區天雄路166弄1號3樓
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www.yeasen.com

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產品簡介
供貨周期 現貨 規格 8 libraries
貨號 12206ES08 應用領域 生物產業
主要用途 dna建庫
采用新型轉座酶和優化的緩沖體系,僅需10 min即可完成DNApian段化、末端修復和接頭連接過程,顯著縮短建庫時間至1.5小時以內,并獲得優異的測序質量。此外,本試劑盒已經不同GC含量DNA樣本的驗證,無偏好性或僅具有極低的偏好性。
產品介紹

產品信息


產品名稱

產品編號

規格

儲存

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng)

12206ES08

8 T

-20℃

12206ES24

24 T

-20℃

12206ES96

96 T

-20℃


產品描述


Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng)是針對lllumina®高通量測序平臺專業開發設計的轉座酶法建庫試劑盒,適用于1 ng的基因組DNA、cDNA、擴增子(>500 bp)等樣本的建庫。與常規分步法建庫相比,Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®采用新型轉座酶和優化的緩沖體系,僅需10 min即可完成DNApian段化、末端修復和接頭連接過程,顯著縮短建庫時間至1.5小時以內,并獲得優異的測序質量。此外,本試劑盒已經不同GC含量DNA樣本的驗證,無偏好性或僅具有極低的偏好性。本試劑盒提供的所有試劑盒組分,都經過嚴格的質量與功能驗證,zui高程度保障產品優異性能與批間穩定性。


產品組分


組分編號

組分名稱

8 libraies

24 libraies

96 libraies

12206-A

5×Reaction Buffer

32 μL

96 μL

384 μL

12206-B

Transposome Mix V1

40 μL

120 μL

480 μL

12206-C

PCR Primer Mix

24 μL

72 μL

288 μL

12206-D

Ultima Amplification Mix

200 μL

600 μL

2×1200 μL

12206-E

N5 (N501)*

8 μL

——

——

12206-F

N7 (N701)*

4 μL

——

——

12206-G

N7 (N702)*

4 μL

——

——

注意:*測序時Index序列N501-TAGATCGC,N701-TAAGGCGA,N702-CGTACTAG


運輸與保存方法


冰袋運輸。所有組分-20°C保存,有效期1年。


注意事項


一、關于操作

1. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

2. 請于使用前將試劑盒各組分置于室溫解凍。解凍后上下顛倒數次充分混勻,短暫離心后置于冰上待用。

3. 配制各步驟反應液時推薦使用移液器吹打或輕輕振蕩混勻,劇烈振蕩可能會造成文庫產出下降。

4. 為避免樣品交叉污染,推薦使用帶濾芯的槍頭,吸取不同樣品時請更換槍頭。試劑吸取時應保證槍頭適當深入液體,排出時應確認槍頭無殘留。

5. 推薦在帶熱蓋的PCR儀中進行各步驟反應,使用前應預熱PCR儀至反應溫度附近。

6. PCR產物因操作不當極容易產生氣溶膠污染,進而影響實驗結果準確性。推薦將PCR反應體系配制區和PCR產物純化檢測區進行強制性的物理隔離;使用的移液器等設備;并定時對各實驗區域進行清潔(使用0.5%次氯酸鈉或10%漂白劑進行擦拭清理),以保證實驗環境的潔凈度。


二、關于產品原理

本產品基于轉座酶法開發,其核心原理是轉座酶及其轉zuo機制。在Transposome Mix中包含由轉座酶和兩種等摩爾的接頭Adapter 1和Adapter 2構成一個完整的轉座子。轉座發生時,該轉座子將Adapter 1和Adapter 2接頭序列插入靶基因中,形成一端帶有Adapter 1,一端帶有Adapter 2的DNA,之后利用DNA聚合酶將轉座形成的切口補齊。這種產物經N5(N5XX)和N7(N7XX)以及P5和P7(PCR Primer Mix)兩對引物擴增,產物經分選和純化后即為可測序文庫。

圖1  Fast Tagment DNA建庫試劑盒原理

三、關于DNA pian段化(DNA Tagment)

1. 本試劑盒使用轉座酶進行DNA pian段化。如DNA樣品為PCR產物,應保證其長度>500 bp。因轉座酶無法作用于DNA末端,因此PCR產物末端50 bp測序覆蓋度可能會有所降低。我們推薦您在制備PCR產物時將待測區域兩末端各延長50-100 bp,以避免末端測序覆蓋度降低的情況。

2. 本試劑盒適用1 ng Input DNA。在Input DNA投入前,應將其純化并溶于滅菌蒸餾水中,A260/A280 = 1.8-2.0,并使用基于雙鏈DNA熒光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等進行定量。【注意:因Transposome Mix對DNA濃度非常敏感,所以準確的DNA濃度測定對實驗成功與否至關重要。】

四、關于磁珠純化與分選(Bead-based Clean Up and Size Selection)

1. 磁珠使用前應先平衡至室溫,否則會導致得率下降、分選效果不佳。

2. 磁珠每次使用前都應充分振蕩混勻或使用移液器上下吹打充分混勻。

3. 轉移上清時,請勿吸取磁珠,即使微量殘留都將影響后續文庫質量。

4. 磁珠漂洗使用的80%乙醇應現用現配,否則將影響回收效率。

5. 磁珠使用過程中,應保證移液準確性。

6. 產物洗脫前應將磁珠置于室溫干燥。干燥不充分容易造成無水乙醇殘留影響后續反應;過分干燥又會導致磁珠開裂進而降低純化得率。通常情況下,室溫干燥3-5 min足以讓磁珠充分干燥。

7. DNA純化或長度分選產物如需保存,可使用0.1×TE Buffer洗脫,產物于4°C可保存1周,-20°C可保存1個月。

五、關于文庫擴增(Library Amplification)

1. 使用本試劑盒必須進行文庫擴增步驟。因轉座反應產物并非完整的雙鏈DNA文庫,必須通過PCR反應生成完整的DNA文庫。

2. 當Input DNA量為1 ng時,推薦使用8-15個擴增循環,13個循環的文庫產出約為600 ng

六、關于文庫質檢(Library Quality Analysis)

1. 通常情況下,構建好的文庫可通過長度分布檢測和濃度檢測來進行質量評價。

2. 文庫濃度檢測可使用:基于雙鏈DNA熒光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等;基于qPCR定量的方法。

3. 推薦使用qPCR方法進行文庫濃度檢測:Qubit®、PicoGreen®等基于雙鏈DNA熒光染料的濃度測定方法時,無法有效區分單端連接Adapter的產物、兩端均未連接Adapter的產物以及其他不完整雙鏈結構產物;qPCR定量基于PCR擴增原理,僅定量樣品中兩端Adapter完整的文庫(即可測序的文庫),可排除單端或雙端都不連接Adapter的不可測序文庫的干擾。

4. 文庫濃度檢測不可使用:基于光譜檢測的方法,如NanoDrop®等。

5. 文庫長度分布檢測,可通過Agilent Bioanalyzer 2100等基于毛細管電泳或微控流原理的設備進行檢測。


使用方法


一、自備材料

1. 純化磁珠:Cat#12601,Hieff NGS® DNA Selection Beads或Cat#A63880,AMPure XP Beads或其他等效產品。

2. 文庫質控:Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer或其他等效產品。

3. N5(N5XX)和N7(N7XX)Index引物: Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina® (96 Index)(Cat#12610ES96)。

4. 其他材料:無水乙醇、滅菌超純水、TE Buffer(10 mM Tris-HCl,pH 8.0-8.5+0.1 mM EDTA)、低吸附EP管、PCR管、磁力架、PCR儀等。

、操作流程

圖2  Fast Tagment DNA建庫試劑盒操作流程

、操作步驟

3.1 DNA pian段化(DNA Tagment)

1. 準備工作:將Hieff NGSTM DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡至少30 min。配制80%乙醇。將5×Reaction Buffer室溫解凍后,顛倒混勻,置于冰上備用。

2. 于無菌PCR管中配制表1所示反應體系。

表1  片段化反應體系

名稱

體積(μL)

1 ng Input DNA

x

5×Reaction Buffer

4

Transposome Mix V1

5

ddH2O

Up to 20 μL

3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應液離心至管底。

4. 將上述PCR管置于PCR儀,設置表2所示反應程序,進行片段化反應。


表2  片段化反應程序

溫度

時間

熱蓋105°C

On

55°C

10 min

4°C

Hold

3.2 文庫擴增(Library Amplification)

1. 提前將表3中的試劑解凍混勻,置于冰上備用

2. 片段化程序結束后立即將PCR管置于冰上配制表3中PCR反應體系

3  PCR擴增反應體系

名稱

體積(μL)

片段化產物

20

PCR Primer Mix

3

N5XX*

1

N7XX*

1

Ultima Amplification Mix

25

ddH2O

To 50 μL

注意*Hieff NGSTM Tagment Index Kit for Illumina® (96 Index)(Cat#12610ES96)中提供8種N5XX和12種N7XX,可根據樣品數量和Index選擇策略自行選擇。

3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應液收集至管底。

4. 將PCR管置于PCR儀中,設置表4所示反應程序,進行PCR擴增

4  PCR擴增反應程序

溫度

時間

循環數

熱蓋105°C

On

——

72°C

3 min*

——

95°C

30 sec

——

95°C

10 sec

n cycles**

55°C

30 sec

72°C

30 sec

72°C

5 min

——

4°C

Hold

——

注意:*此步不可省略。轉座反應產物并非完整的雙鏈DNA,72℃孵育3 min用于生成成熟的PCR模板。

**循環數請根據測序需要進行選擇。起始DNA量為1 ng時,推薦8-15個擴增循環。

3.3 文庫純化或分選(Library Clean UP/Size Selection)

如對文庫長度分布無特殊要求,可直接使用1.0×磁珠純化擴增產物,而不進行片段分選如需進行片段分選,則進行以下步驟,推薦使用Cat#12601 DNA Selection Beads進行產物片段分選,為防止接頭或大片段殘留,可進行兩次片段分選,或先使用1.0×磁珠純化擴增產物后再進行分選。

1. 將平衡至室溫的Hieff NGSTM DNA Selection Beads磁珠,振蕩或上下顛倒混勻。

2. 根據DNA pian段長度要求,進行雙輪分選時,需將初始DNA樣本用滅菌蒸餾水補齊至100 μL參考表5推薦比例向文庫上清中加入第—輪分選磁珠,渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫孵育5 min。【注意:因PCR過程中樣品揮發會導致產物體積不足50 μL,進行下面操作之前必須使用滅菌蒸餾水將體積補齊至100 μL,否則分選長度會與預期不*。】

5  磁珠文庫分選推薦比例

文庫平均總長度

~300 bp

~400 bp

~500 bp

~800 bp

第—輪磁珠用量

80 μL (0.8×)

70 μL (0.7×)

60 μL (0.6×)

50 μL (0.5×)

第二輪磁珠用量

20 μL (0.2×)

20 μL (0.2×)

20 μL (0.2×)

15 μL (0.15×)

注意:“×"數均根據PCR產物體積補齊至100 μL計算而得,如“0.6×"表示0.6×100 μL = 60 μL。

3. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心轉移上清到干凈的離心管中。

4. 參考表5向上清中加入第二輪分選磁珠。

7. 渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫靜置5 min。

8. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。

9. 保持PCR管始終處于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec,小心移除上清。

10. 重復步驟9,總計漂洗兩次。

11. 保持PCR管始終處于磁力架中,開蓋干燥磁珠至剛剛出現龜裂(約5 min)。

12. 將PCR管從磁力架中取出,加入適量21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打充分混勻,室溫靜置5 min。

13. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體。待溶液澄清后(約5 min),小心轉移20 μL上清至干凈的管中,于-20℃保存。此外,如需獲得長度分布更集中的文庫擴增產物,可使用膠回收方式進行長度分選和純化;如對文庫長度分布范圍等無特殊要求,擴增產物也可不進行長度分選,直接使用磁珠或柱純化試劑盒進行純化。

3.4 文庫質量控制

通常情況下,構建好的文庫可通過濃度檢測和長度分布檢測來進行質量評價,具體請參見注意事項六。

3.5 參考實例

使用Hieff NGSTM Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®對1 ng嗜鹽桿菌gDNA樣本建庫分別使用1.0×磁珠進行純化,0.8×/0.2×、0.7×/0.2×、0.5×/0.15×磁珠比例進行長度分選,結果使用Agilent 2100 Bioanalyzer進行檢測。

3  Agilent 2100 Bioanalyzer文庫質量分析


相關產品


建庫試劑盒

產品編號

規格

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina

12199ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina®

12200ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® MaxUp DNA Library Prep Kit for Illumina®

12201ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® OnePot DNA Library Prep Kit for Illumina®

12203ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina

12204ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® MaxUp Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina®

12301ES24/96

24/96 T

文庫構建磁珠

產品編號

規格

Hieff NGS® cfDNA Clean Beads(100~200 bp)

12599ES08/56

5/60 mL

Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (50 bp以上)

12600ES08/56/75

5/60/450 mL

Hieff NGS® DNA Selection Beads(Superior AMPure XP alternative)

12601ES08/56/75

5/60/450 mL

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES08/56/75

5/60/450 mL

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit

12603ES24/96

24/96 T

建庫接頭

產品編號

規格

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1

12615ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 2

12616ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 3

12617ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 4

12618ES04/16

12×4/12×16 T

Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®, (96 Index)

12610ES96

96 T

建庫模塊

產品編號

規格

Hieff NGS® Fast-Pace DNA Fragmentation Reagent

12609ES50

50 T

Hieff NGS® Fast-Pace End Repair/dA-Tailing Module

12608ES24/96

24/96 T

2×Super Canace® High-Fidelity Mix for Library Amplification

12620ES24/96

24/96 T

Hieff NGS® Dual-Mode cDNA Synthesis Kit

12250ES24/96

24/96 T

文庫定量

產品編號

規格

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, qPCR Master Mix

12302ES05

500 T

Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, DNA Standard (1-6)

12307ES09

6×96 μL

dsDNA HS Assay Kit for Qubit®

12640ES60/76

100/500 T

多重PCR

產品編號

規格

Hieff® Multiplex PCR Kit

12279ES50/76

100/500 T

Hieff® Multiplex PCR Master Mix

12280ES50/76

50 /200 T


HB191010




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