根據分析樣品，色譜柱的類型，GC的檔次和具體檢測器，若使用不合要求的低純度氣體，不良影響有以下幾種可能： 

　　1、樣品失真或消失：如氣體含水量多可使氯硅樣品水解; 

　　2、H2O，CO2使分子篩柱失去活性，H2O氣使聚脂類固定液分解，O2使PEG固定液斷鏈; 造成色譜柱失效。

　　3、有時某些氣體雜質和固定液相互作用而產生假峰; 

　　4、對柱保留特性的影響：如H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保留指數會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或是非極性固定液柱的保留特性，都會產生變化，使用時間越長影響越大; 

　　5、檢測器：TCD：信噪比減小，無法調零，線性變窄，文獻中的校正因子不能使用，氧含量過大，使元件在高溫時加速老化，減少壽命;FID：特別是在Dt≤1×10-11/S下操作時，CH4等有機雜質會使基流激增，噪聲加大不能進行微量分析; 

　　6、在做程序升溫操作時，載氣中的某些雜質，在低溫時保留在色譜柱中，當柱溫升高時不但引起基線漂移，還可能在譜圖上出現比較寬的“假峰”。