一、按所需離心力進行選擇：
離心機是利用離心沉降原理，使溶液中密度不同的細胞（粒子）現分離、濃縮或提純的。將裝有等量試液的離心管對稱放置在轉子（試管）內，啟動儀器后，電機帶動轉子高速旋轉所產生的相對離心力（RCF）使試液中密度不同的細胞（粒子）分離，相對離心力的大小取決于試樣所處的位置至軸心的水平距離即旋轉半徑r和轉速n。
其計算公式如下：
RCF＝1.118×10-6n2r×g
n------------轉速（轉/分）
r------------旋轉半徑（毫米）
二、根據分離工作量和研究需要進行選擇：
1.一般進行研究和小批量制備時多選用臺式離心機；
2.進行大批量制備時多選用大型落地式離心機；
3.縣級二以上化驗室多選用帶冷凍系統，臺式高速冷凍離心機或落地式低速冷凍離心機，鄉鎮醫療單位多選用臺式高速冷凍離心機；
4.具有大型血庫醫療單位應選用血液離心機。
 三、按樣品所需溫度進行選擇：
1. 分離樣品可在常溫+15的環境下存放，而不改變其特性的，可以選用常溫離心機。
2.如分離樣品會受溫度的影響而改變其特性的，（如蛋白質，細胞等）在高溫環境下會破壞，這就要選擇冷凍離心機，冷凍離心機都有額定的溫度范圍。
3.有些樣品按試驗要求，需要加熱的，（如石油，乳脂）就需選用加熱離心機。
 
四、按品牌商選擇：
（1）留意產地：國產離心機主要生產集散地有北京、湖南長沙、安徽、上海等地，其中尤以湖南長沙為zui多。
（2）留意品牌：主要生產集散地也會有很多不同品牌的廠家，很多廠家都熱衷掛證彰顯虛擬實力：延續國營老廠輝煌，雙高技術人員等等。
（3）留意造型：很多廠家其實就是三五股東的小型組裝廠，既無研發能力，又無控制技術，且自身實力不足，使用公共模具走同質化生產路線，從而造成市面上的產品都是帶來千篇一律的外殼造型。
五、轉頭的選擇
轉子：離心機的轉子主要分為兩種。
水平轉子：運轉時吊藍處于水平狀態，與轉軸成直角，樣品將沉淀集中于離心管的底部。
角轉子：離心容器與轉軸成一固定角度，樣品將沉淀集中于離心管底部及靠近底部的側壁。如果希望分離的樣品集中于離心管的底部就選擇水平轉子，如果希望樣品集中于離心管的底部和靠近底部的側壁上就要選擇角轉子。
還有一些特殊試驗或特殊樣本需要特殊的轉子如：大容量吊籃、酶標板轉子、載玻片轉子、PCR轉子、試管架轉子和毛細管轉子等。轉子都有固定的規格，它是和離心機的容量結合起來的，如36×5 ml的角轉子，既決定了轉子的類型也決定了離心機的容量，所以轉子的選擇非常重要。