MBR具有以下主要優點：

（1）出水水質優質穩定由于膜的高效分離作用，分離效果遠好于傳統沉淀池，處理出水極其清澈，懸浮物和濁度接近于零，細菌和病毒被大幅去除。同時，膜分離也使微生物被完quan被截流在生物反應器內，使得系統內能夠維持較高的微生物濃度，不但提高了反應裝置對污染物的整體去除效率，保證了良好的出水水質，同時反應器對進水負荷(水質及水量)的各種變化具有很好的適應性，耐沖擊負荷，能夠穩定獲得優質的出水水質。

（2）剩余污泥產量少 該工藝可以在高容積負荷、低污泥負荷下運行，剩余污泥產量低(理論上可以實現零污泥排放)，降低了污泥處理費用。

（3）占地面積小，不受設置場合限制生物反應器內能維持高濃度的微生物量，處理裝置容積負荷高，占地面積大大節省；該工藝流程簡單、結構緊湊、占地面積省，不受設置場所限制，適合于任何場合，可做成地面式、半地下式和地下式。

（4）可去除氨氮及難降解有機物由于微生物被完quan截流在生物反應器內，從而有利于增殖緩慢的微生物如硝化細菌的截留生長，系統硝化效率得以提高。同時，可增長一些難降解的有機物在系統中的水力停留時間，有利于難降解有機物降解效率的提高。

（5）操作管理方便，易于實現自動控制該工藝實現了水力停留時間(HRT)與污泥停留時間(SRT)的完quan分離，運行控制更加靈活穩定，是污水處理中容易實現裝備化的新技術，可實現微機自動控制，從而使操作管理更為方便。

（6）易于從傳統工藝進行改造該工藝可以作為傳統污水處理工藝的深度處理單元，在城市二級污水處理廠出水深度處理(從而實現城市污水的大量回用)等領域有著廣闊應用。

（7）運行管理人員專業技術要求低傳統活性污泥法對進水水質較為敏感，容易出現因進水水質的變化而引起的出水不達標等情況，因此需要運行管理的人員具備較高的專業技術知識儲備，通過不斷調整運行參數來適應的不同的水力負荷，而MBR天生的適應性強、耐沖擊負荷等特點，因此對運行管理人員的專業技術知識要求也相對較低。