精品推薦 | 這款酶在多重PCR擴(kuò)增體系里表現(xiàn)佳!
DNA聚合酶是PCR反應(yīng)的核心組分,廣泛應(yīng)用于生物及醫(yī)學(xué)研究等領(lǐng)域。對(duì)于普通PCR,常規(guī)熱穩(wěn)定DNA聚合酶(如Taq DNA聚合酶)即可滿足需求。但對(duì)于高通量測(cè)序,擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性非常關(guān)鍵,優(yōu)選高保真酶進(jìn)行擴(kuò)增。常規(guī)的高保真擴(kuò)增酶無(wú)法讀取和擴(kuò)增含有尿嘧啶和次黃嘌呤的模板,翌圣生物通過(guò)定向改造,推出Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase,該聚合酶可兼容含U堿基模板和常規(guī)模板,擴(kuò)增效率高保真性好,而且酶本身各項(xiàng)殘留均很低,滿足多種應(yīng)用方向的擴(kuò)增需求。
哪些應(yīng)用方向可優(yōu)選Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase呢?
重亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化/酶法轉(zhuǎn)化的DNA擴(kuò)增-甲基化研究;
受損FFPE DNA樣本的擴(kuò)增-腫瘤領(lǐng)域;
防止擴(kuò)增子的氣溶膠污染-病原領(lǐng)域;
基于尿嘧啶切除的克隆-分子克隆。
圖1.Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase的應(yīng)用方向
<點(diǎn)擊查看大圖>
以上這些應(yīng)用展示了Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase在分子生物學(xué)研究中的多功能性和高效性,使其成為實(shí)驗(yàn)室中的工具之一。
下面重點(diǎn)介紹Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase在多重PCR擴(kuò)增體系里的表現(xiàn):
多重PCR (Multiplex polymerase chain reaction,MPCR) 是指通過(guò)一次PCR反應(yīng)同時(shí)對(duì)多個(gè)靶標(biāo)進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)合一定的檢測(cè)手段對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多個(gè)靶標(biāo)進(jìn)行診斷的技術(shù)。MPCR具有高效率、高通量、低成本的特性而被深入研究。
多重PCR微生物多樣性檢測(cè)的應(yīng)用非常廣泛,尤其是原核生物16S的多重PCR擴(kuò)增測(cè)序。16S擴(kuò)增子測(cè)序是指利用合適的通用引物擴(kuò)增環(huán)境中微生物的16S rDNA/18S rDNA /ITS高變區(qū)或功能基因,通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)PCR產(chǎn)物的序列變異和豐度信息,分析該環(huán)境下的微生物群落的多樣性和分布規(guī)律,以揭示環(huán)境樣品中微生物的種類、相對(duì)豐度、進(jìn)化關(guān)系等。16S擴(kuò)增子測(cè)序的技術(shù)路線如下:
圖2. 16S擴(kuò)增子測(cè)序的技術(shù)路線
性能展示
實(shí)驗(yàn)條件
樣本:土壤DNA 10 ng
一輪PCR:25μL體系,擴(kuò)增28個(gè)循環(huán),MGI平臺(tái)16S引物(16S-V3-V4,16S-V4),擴(kuò)增酶2×Hieff NGS® HG Multiplex PCR Master Mix(13283ES)
二輪PCR:25μL體系,第一輪產(chǎn)物投入量50 ng,擴(kuò)增6個(gè)循環(huán),擴(kuò)增酶包含Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase及另外兩種高保真擴(kuò)增酶,0.9x純化,50μL洗脫
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
實(shí)驗(yàn)結(jié)論
引物16S-V3-V4擴(kuò)增的文庫(kù)主峰在600bp左右,引物16S-V4擴(kuò)增的文庫(kù)主峰在500bp左右,擴(kuò)增條帶與理論文庫(kù)條帶吻合;
第二輪PCR擴(kuò)增時(shí),在兩種擴(kuò)增引物體系下12928相對(duì)擴(kuò)增酶A和擴(kuò)增酶B的擴(kuò)增能力強(qiáng),文庫(kù)產(chǎn)量最高。
產(chǎn)品推薦
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號(hào) | 產(chǎn)品應(yīng)用 |
Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase mix Hieff Canace®耐U+高保真DNA聚合酶混合液 | 12928ES | 耐U高保真擴(kuò)增 |
熱敏UDG含甘油Uracil DNA Glycosylase(UDG/UNG),heat-labile,1 U/μL | 10303ES | PCR防污染 |
Uracil-Specific Excision Reagent (1 U/μL) | 14537ES | 基于尿嘧啶切除的克隆 |
2×Hieff NGS® HG Multiplex PCR Master Mix | 13283ES | 多重PCR擴(kuò)增 |
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