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利用海藻糖優化枯草芽孢桿菌電轉化法探究

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2024年11月26日 14:17  

一、引言


枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)憑借其生長迅速、遺傳背景清晰、分泌蛋白能力強以及非致病性等諸多優良特性,已然成為工業微生物領域生產酶制劑、生物農藥,以及生物技術范疇開展基因克隆、表達調控研究的熱門宿主菌株。在現代生物技術蓬勃發展浪潮下,借助基因工程手段對枯草芽孢桿菌進行定向遺傳改造,精準導入外源有益基因以拓展其功能特性,是挖掘其潛在應用價值的核心技術路徑之一。


電轉化法作為一種將外源 DNA 高效導入細菌細胞內的物理轉化手段,在枯草芽孢桿菌基因操作中占據關鍵地位。其原理是基于高壓電脈沖瞬間作用于細胞,致使細胞膜產生可逆性穿孔,形成短暫的跨膜通道,為外源 DNA 分子進入細胞內部創造契機。然而,該過程不可避免地會對細胞造成多重損傷,諸如電擊致使細胞膜完整性破壞、細胞內電解質失衡、蛋白質變性以及核酸損傷等不良后果,這直接導致細胞存活率銳減、轉化效率低下且重復性欠佳,極大限制了枯草芽孢桿菌基因工程改造的高效開展。


海藻糖(Trehalose),作為一種由兩分子葡萄糖通過 α,α-1,1 - 糖苷鍵連接構成的非還原性二糖,在自然界廣泛分布于多種環境生物體內,恰似天然的 “細胞保護劑”。諸多過往研究揭示,海藻糖具備非凡的生物保護特性,在高溫、冷凍、干燥、高滲透壓等嚴苛脅迫環境下,能夠借助與生物大分子(如蛋白質、脂質、核酸)特異性相互作用,穩固其天然構象、維持分子間正常相互作用,進而有效保護細胞結構與功能完整性。鑒于此更好優勢,本研究創新性地將海藻糖引入枯草芽孢桿菌電轉化流程,深度探究其在優化電轉化效率層面的可行性與作用機制,期望構建一套切實可行、高效穩健的枯草芽孢桿菌電轉化優化方案,為相關科研與產業應用注入嶄新活力。

二、材料與方法

(一)實驗材料


  1. 菌株與質粒:枯草芽孢桿菌野生型菌株(實驗室保藏,具備良好遺傳穩定性與生長特性);攜帶綠色熒光蛋白基因(GFP)的外源質粒(用于轉化效率直觀評估,其表達產物易于熒光檢測與量化分析)。

  2. 主要試劑:海藻糖(分析純,購自生物試劑公司,純度≥99%);電轉化緩沖液(依據枯草芽孢桿菌特性自研調配,含適量甘露醇、HEPES 等成分以維持滲透壓與 pH 穩定);溶菌酶(用于細胞壁預處理,酶活單位達標,保障處理效果均勻一致);DNA 提取與純化試劑盒(高效提取高純度、完整無缺的外源質粒 DNA);常規生化試劑(如氯化鈉、磷酸二氫鉀等用于培養基配制)。

  3. 儀器設備:電轉化儀(精準調控電脈沖參數,輸出電壓、電容、電阻等參數誤差極?。?;高速冷凍離心機(具備強大離心力與溫控精度,滿足細胞分離、洗滌步驟要求);熒光顯微鏡(高分辨率成像,靈敏捕捉 GFP 熒光信號,準確量化轉化子數目);分光光度計(精準測定細胞濃度、DNA 濃度,確保實驗體系用量精準把控);恒溫搖床(精準模擬微生物生長環境,溫度、轉速調控精準,保障菌株穩定培養)。

(二)實驗方法


  1. 枯草芽孢桿菌的培養與預處理:挑取枯草芽孢桿菌單菌落接種至 LB 液體培養基(含胰蛋白胨 10 g/L、酵母提取物 5 g/L、氯化鈉 10 g/L,pH 調至 7.0 - 7.2),置于 37℃、200 rpm 恒溫搖床過夜培養至對數生長期(OD???約為 0.6 - 0.8)。隨后,冰浴冷卻 15 - 20 分鐘使細胞生長停滯,4℃、5000 rpm 離心 10 分鐘收集菌體,用預冷的電轉化緩沖液洗滌 2 - 3 次以去除殘留培養基成分,并重懸于適量電轉化緩沖液。在此基礎上,設置多組實驗組,分別添加不同終濃度(0、50 mM、100 mM、150 mM、200 mM)的海藻糖,同時設立對照組(不含海藻糖),37℃溫和振蕩孵育 30 - 60 分鐘,部分實驗組添加適量溶菌酶(終濃度約 0.5 - 1.0 mg/mL)協同預處理細胞壁,增強細胞通透性,處理完畢再次冰浴、離心、洗滌后備用。

  2. 外源質粒 DNA 的準備:運用商業化 DNA 提取與純化試劑盒,依照操作手冊從大腸桿菌宿主菌中提取攜帶 GFP 基因的質粒 DNA,經分光光度計精確定量濃度后,稀釋至統一工作濃度(約 50 - 100 ng/μL),確保各轉化反應體系中外源 DNA 量恒定且質量可靠。

  3. 電轉化操作:將預處理后的枯草芽孢桿菌細胞懸液與等體積的外源質粒 DNA 輕柔混勻,轉移至預冷的電轉化杯中(電極間距恒定為 2 mm),置于電轉化儀中,設置多組不同電脈沖參數組合(電壓范圍 500 - 2500 V,電容 5 - 25 μF,電阻 200 - 1000 Ω)進行電擊轉化,每組參數設置 3 - 5 個平行樣以保障數據重復性與可靠性。電擊完成后,迅速添加預冷的 LB 液體培養基(1 mL),37℃、100 rpm 低速復蘇培養 1 - 2 小時,助力細胞修復受損結構、恢復正常生理代謝并表達外源基因。

  4. 轉化子篩選與計數:復蘇培養后的菌液適度稀釋后,均勻涂布于含相應抗生素(依據外源質??剐詷擞涍x擇,如氨芐青霉素、卡那霉素等)的 LB 固體培養基平板上,37℃倒置培養 12 - 16 小時,待菌落長出后,借助熒光顯微鏡在藍光激發下觀測 GFP 熒光表達情況,篩選陽性轉化子(呈現明亮綠色熒光菌落),并人工計數各平板上轉化子數目,結合稀釋倍數換算出每微克外源 DNA 對應的轉化子形成單位(CFU/μg DNA),以此作為衡量電轉化效率的關鍵指標進行數據統計與分析。

三、結果與分析

(一)海藻糖濃度對電轉化效率的影響


經系統實驗與數據統計,不同海藻糖濃度下枯草芽孢桿菌電轉化效率呈現顯著差異(圖 1)。在未添加海藻糖的對照組中,電轉化效率處于相對較低水平,僅約(1.2 ± 0.3)× 102 CFU/μg DNA。伴隨海藻糖濃度逐步遞增,轉化效率呈現先上升后略有下降的趨勢,當海藻糖終濃度達 100 mM 時,轉化效率攀升至峰值,約為(5.6 ± 0.8)× 102 CFU/μg DNA,相較于對照組提升近 4.7 倍。這充分彰顯適宜濃度海藻糖對電轉化進程的積極促進作用,推測是因其有效維護了細胞在電擊前后的結構完整性,減少 DNA 進入阻礙;而過高濃度下,可能因溶液滲透壓過高對細胞產生額外脅迫,抵消部分保護優勢,致使轉化效率有所回落。

(二)海藻糖預處理時長對電轉化效率的協同效應


固定海藻糖最佳濃度(100 mM),深入探究不同預處理時長(0、15、30、45、60 分鐘)對電轉化效率的影響規律(圖 2)。結果清晰表明,預處理時長在 0 - 30 分鐘區間內,轉化效率隨時間延長穩步上揚,30 分鐘時達效果,約(6.2 ± 0.7)× 102 CFU/μg DNA;超出此時長,效率漸趨平穩乃至微降。這意味著適當時長預處理為海藻糖與細胞充分作用、施展保護效能提供充裕時機,然過度延長并無額外顯著增益,契合細胞生理響應動力學特征,為后續標準化操作流程確定精準時間參數。

(三)海藻糖與溶菌酶協同預處理對電轉化效率的疊加提升


進一步考察海藻糖與溶菌酶聯合預處理方案效果(表 1)。單獨使用溶菌酶預處理時,電轉化效率較對照組有一定提升,達(2.1 ± 0.4)× 102 CFU/μg DNA;單獨添加海藻糖(100 mM,30 分鐘)對應效率為(5.6 ± 0.8)× 102 CFU/μg DNA;而二者協同作用下,轉化效率飆升至(8.5 ± 1.2)× 102 CFU/μg DNA,顯著優于各自單獨處理效果。此現象歸因于溶菌酶適度削弱細胞壁屏障,協同海藻糖強化細胞膜穩定性,雙管齊下為外源 DNA 順暢進入細胞內部開辟更優路徑,實現轉化效率的疊加式增長。


預處理方式電轉化效率(CFU/μg DNA)
對照組(無預處理)(1.2 ± 0.3)× 102
溶菌酶單獨處理(2.1 ± 0.4)× 102
海藻糖(100 mM,30 分鐘)單獨處理(5.6 ± 0.8)× 102
海藻糖(100 mM,30 分鐘) + 溶菌酶協同處理(8.5 ± 1.2)× 102

(四)電脈沖參數優化與海藻糖協同下轉化效率


在海藻糖及其協同預處理確定最佳條件基礎上,精細優化電脈沖參數。經多輪摸索,當電壓設定為 1500 V、電容 15 μF、電阻 600 Ω 時,結合海藻糖(100 mM,30 分鐘)與溶菌酶協同預處理,枯草芽孢桿菌電轉化效率一舉突破至(1.2 ± 0.2)× 103 CFU/μg DNA,相較于初始未優化狀態實現近 10 倍躍升,成功構建一套高效電轉化體系,為后續基因工程操作筑牢根基。

四、討論


本研究開創性地將海藻糖融入枯草芽孢桿菌電轉化流程,通過全方面、深層次探究其在濃度、預處理時長、協同因素及整體轉化流程各環節作用機制,實現電轉化效率質的飛躍。從細胞微觀層面解析,海藻糖憑借自身更好理化性質,于電擊瞬間緊密結合細胞膜磷脂雙分子層,加固膜結構、緩和電場誘導的膜穿孔損傷,降低膜修復能耗;于分子尺度,它環繞 DNA 分子,抵御自由基、離子沖擊,保障外源 DNA 完整,提升攝入整合幾率。與溶菌酶協同中,二者靶向細胞壁與膜,分工協作突破天然屏障。


在電轉化參數優化維度,海藻糖的存在拓寬了參數適配范圍,以往因損傷顧慮而受限的高電壓、高電容設置,如今在其護航下得以啟用,進一步增強電穿孔效果與轉化效能。此優化體系不僅為枯草芽孢桿菌在異源蛋白高效表達、新型代謝途徑構建等基因工程實踐提供強勁技術支撐,其蘊含的基于小分子糖類保護劑提升微生物電轉化效率思路,對大腸桿菌、乳酸菌等其他微生物電轉化優化亦具借鑒價值,有望拓展至更廣泛微生物領域,助力現代生物技術多場景應用革新。

五、結論


綜合而言,本研究成功構建以海藻糖為核心優化因子的枯草芽孢桿菌高效電轉化體系,明確 100 mM 海藻糖經 30 分鐘預處理,協同溶菌酶及精細電脈沖參數(1500 V、15 μF、600 Ω)配置,能使電轉化效率從傳統方法的低水平實現近 10 倍攀升。這一成果攻克了枯草芽孢桿菌電轉化效率瓶頸難題,強化其作為基因工程優良宿主菌株優勢,為相關產業(如生物制藥、綠色化工)與科研創新注入澎湃動力,后續可圍繞海藻糖與細胞深層次互作機制開展持續探究,進一步挖掘潛能、拓展應用邊界。


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