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類器官污染鑒別與除菌攻略(一)

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2024年10月29日 14:02  

一、概述

 

類器官污染是一個老生常談的事情,尤其是做胃腸道,組織本身帶來的菌群數量非常龐大,一旦消毒不到位,就會導致類器官培養失敗。類器官污染常見類型有細菌、真菌、支原體、黑膠蟲等污染源,今天小愛帶大家學習鑒別類器官污染及除菌方案

 

二、類器官污染鑒別

 

1、細菌污染

 

細菌污染-肉眼下

 

污染特征:

● 肉眼下可明顯觀察基質內有明顯黑色球體物;

● 而且呈多個黑色球狀物分布;

● 生長迅速,通常D1就有會出現;

● 培養液隔夜即會變紅黃渾濁。

 

細菌污染-鏡下類器官原代提取D1

 

細菌污染特征:

● 細菌集落呈黑色團球狀,wan全不透;

● 外圍模糊,有朦朧感;

● 爆發非常快,一般1-2天即可出現大量集落。

 

細菌克星

貨號

抗生素

作用對象

使用比例

儲存條件

abs42020125

卡那霉素B硫酸鹽

細菌(G+,G-)支原體

母液濃度10mg/mL(無菌水溶解),工作濃度稀釋1:100

-20℃

abs42018967

硫酸慶大霉素溶液(10mg/mL)

細菌(G+,G-)支原體

稀釋1:200

-20℃

abs9244

青鏈雙抗

細菌(G+,G-)

稀釋1:100

-20℃

abs9246

青霉素-鏈霉素-兩性霉素B三抗

細菌(G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)

稀釋1:100

-20℃

abs9245

青霉素-鏈霉素-慶大霉素三抗

細菌(G+,G-)、支原體

稀釋1:100

-20℃

 










2、真菌污染

 

左圖 真菌污染特征——霉菌

右圖 真菌污染特征——根霉

 

霉菌污染特征:

● 早期并不會使得培養基變黃變渾濁,但在顯微鏡下可觀察到菌絲體;

● 真菌形成的菌絲呈絲狀,管狀,樹枝狀,串珠狀

 

真菌污染——酵母菌

 

小鼠胃類器官P0D1中發現的酵母菌團從左到右依次是4X、10X、20X

 

類器官基質膠中的酵母菌污染

 

類器官基質膠中的酵母菌+根霉污染

 

酵母菌污染特征:

● 酵母菌呈類似棉花絮狀的團狀物;

● 酵母菌等,當其行出芽生殖時可從一大一小的連體結構識別;

● 細胞被污染后,仍可生長,長時間類器官活力狀態會變差

● 梅雨季時的污染率會提高。

 

真菌克星

貨號

抗生素

作用對象

使用比例

儲存條件

abs42013298

兩性霉素B

真菌(如:酵母菌,霉菌)

母液濃度2.5mg/mL(DMSO溶解),工作濃度稀釋1:1000

-20℃

abs44071148

制霉菌素

真菌(如:酵母菌,霉菌)

母液濃度2mg/mL(DMSO溶解),工作濃度稀釋1:100

-20℃

abs9246

青霉素-鏈霉素-兩性霉素B混合溶液(100×三抗)

細菌(如G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)

稀釋1:100

-20℃

 








3、黑膠蟲

 

 

黑膠蟲污染特征:

● 活躍扭動;

● 多呈桿狀;

● 培養基不渾濁。

 

黑膠蟲清除劑PLUS (500×) abs9841

 

產品優勢:

1)性能穩定:通過細菌、真菌、支原體、內毒素檢測;通過滲透壓、pH檢測;通過產品性能檢測;

2)高效快速:有效實現對“黑膠蟲”的抑制和滅殺,減少不必要的實驗損失;

3)環保安全:經上百種細胞驗證無毒害作用。

 

使用方法:

1)請在收到貨后, 將試劑管瞬時離心(3000rpm,3~5s)保存;

2)使用黑膠蟲清除劑處理時, 建議現配現用, 并保持細胞密度在50%~60%

3)推薦稀釋比例為1:500。例如5mL培養基中加入10μL的黑膠蟲清除劑。丟棄舊的培養基, 用PBS將細胞清洗干凈, 再加入含有黑膠蟲清除劑的新鮮培養基, 2天一次,連續處理一周。

 

黑膠蟲預防劑(1000×)abs9842

 

產品優勢:

1)高效穩定:通過產品性能檢測,能夠有效防治細胞培養中的“黑膠蟲”污染問題;

2)環保安全:對細胞無毒性作用,在細胞培養過程中不會對細胞造成影響,本產品為多肽類,不像抗生素會影響細胞生長狀態并讓細胞產生耐藥性。

 

使用方法:

1)使用黑膠蟲預防劑(1000X)時, 建議現配現用;

2)推薦黑膠蟲預防劑(1000X)的稀釋比例為1:1000, 例如:10mL的培養基加入10μL的黑膠蟲預防劑(1000X)。

 

4、支原體污染

 

支原體是實驗室中常見的污染細胞的原核生物,污染主要來自組織、血清等動物性原材料和操作者本身。支原體直徑在0.1-0.3μm,顯微鏡下也很難分辨,一般通過吸取培養液上清采用qPCR技術擴增DNA檢測。

 

1)檢測原理

 

TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,其5’末端攜帶熒光基團(報告基團),如FAM、CY5、VIC等,3’端攜帶淬滅基團,如TAMRA、BHQ1等。PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一條特異性的熒光探針,探針完整時,熒光基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收。PCR擴增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使熒光基團和淬滅基團分離,從而熒光監測系統(熒光定量PCR儀)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物形成wan全同步。本試劑盒采用多重PCR的方法,用2種不同的熒光探針分別檢測目標序列與內參。

 

2)清除試劑

 

支原體清除試劑Plus abs9253

 

產品優勢:

● 特異性清除培養基中的支原體;

● 只需要3-6天,便可以有效清除支原體;

● 活性成分為抗生素,不會產生耐藥性;

● 對細胞幾乎無毒性,在100多種細胞上進行過驗證,包括但不限于HEK293、Hela、MCF-7、MRC-5、NIH-3T3、CCC-ESF、CHO-S、CHO-K1、CHO-DG44、H295R、HL-60、K562、MDA-MB-231、SP2/0、T47D、BM和BV2等;

● 廣譜性,可替代雙抗,可以清除常見的革蘭氏陰性和陽性菌;

● 可直接加入血清、培養基中,用于清除支原體污染。

 

3)使用方法

 

A、儲存液的配制: 

稱取適量支原體清除試劑,配制成10mg/mL的儲存液。適當分裝后-20℃保存。如長時間不使用,也可以-80℃保存;

 

B、預防支原體污染或抑制支原體:

在細胞培養液中加入適量支原體清除試劑儲存液,使最終濃度為0.01-0.5μg/mL,通常推薦使用的濃度為0.2μg/mL或0.5μg/mL。在添加了前述劑量的支原體清除試劑的情況下,可以有效防止支原體污染或抑制支原體增殖;

 

C、清除污染的支原體:

對于發現或懷疑有支原體污染的細胞,在細胞培養液中加入適量支原體清除試劑儲存液,使最終濃度為0.5-250μg/mL。推薦依次嘗試使用25、50、100和250μg/mL這4個濃度。在添加了前述劑量的支原體去除試劑的細胞培養液中培養1周后,檢測是否還存在支原體污染。如果還是存在支原體污染,可以酌情提高支原體清除試劑的工作濃度。

 

5、非污染情況

 

因為類器官原代培養中,會有很多雜質、組織碎片、成纖維細胞等,容易造成細胞“污染”的假象,其實并非污染,如下所示:

 

1)成纖維細胞

成纖維細胞的胞體細長,又呈纖維樣,很容易被誤認為是菌絲體,被誤判成真菌污染。其實仔細觀察,成纖維細胞成梭形,胞體中間粗,兩頭細長,而菌絲體整體粗細均勻

 

左圖 基質膠底層貼壁生長的成纖維細胞

右圖 真菌污染特征——霉菌

 

2)組織碎片

在提取原代細胞的過程中,在組織解離過程中產生很多細胞碎片及雜質,故原代培養背景會比較臟,這種情況也容易被誤認為污染。接下來,小愛帶大家了解一下組織碎片特點:

 

 

● 原代組織碎片往往成不規則形狀,區別于菌團橢圓形菌落形態;

 

 

● 原代組織雜質往往大小不一,形態各異;菌團形態均一,均為橢圓狀。

 

今天講解就到這了,大家如有實驗問題,歡迎一起交流哦!

  

本期小愛推薦


貨號

品名

規格

貨期

abs9841

黑膠蟲清除劑PLUS(500×)

400uL×5

現貨

abs9842

黑膠蟲預防劑(1000×)

500uL×5

現貨

abs9925

支原體檢測試劑盒(qPCR法)

50T

1-2周

abs9253

支原體清除試劑Plus

20mg/100mg

1-2周

abs42020125

卡那霉素B硫酸鹽

250mg

現貨

abs42018967

硫酸慶大霉素溶液(10mg/mL)

10mL

現貨

abs9244

青鏈雙抗

100mL

現貨

abs9246

青霉素-鏈霉素-兩性霉素B三抗

100mL

現貨

abs9245

青霉素-鏈霉素-慶大霉素三抗

100mL

現貨

abs42013298

兩性霉素B

1g/5g

現貨

abs44071148

制霉菌素

1g/5g

現貨




 

Absin產品線:

爆款產品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細胞培養(類器官試劑盒+基質膠,胎牛血清+培養添加劑+細胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...

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