AFA-TUBE 是一款專門設計的聚合物容器,設計用于使用 truSHEAR 對樣品體積范圍為 10 至 20 µl 的 DNA 進行剪切。它提供板和條帶,可用于提高 NGS 工作流程中自動化平臺的周轉時間和吞吐量。這種新格式可以與加熱塊、磁鐵和熱循環儀兼容。板和條帶均包含用于樣品跟蹤的 RFID,專門與 Covaris 儀器一起使用。
96 AFA-TUBE TPX 板
Covaris 工程聚合物板可處理 8 至 96 個樣品,體積范圍為 10 至 50 µl。啟用 RFID 樣本跟蹤。
8 AFA-TUBE TPX 條
Covaris 工程聚合物條可處理多達 8 個樣品,體積范圍為 10 至 50 µl。啟用 RFID 樣本跟蹤。
AFA-TUBE 的特點和優點
特征 | 益處 |
單個容器中的多個過程(例如剪切、非接觸式混合、裂解) | 工作流程簡化 |
用于等溫控制的工程聚合物 | 無熱致偏差或樣品損壞 |
基于 RFID 的樣品板跟蹤 | 樣品監管鏈和多板、批量處理 |
使用 AFA-energetics® 實現均勻分布的空化 | 處理速度更快 |
標準實驗室器具 SBS 板格式設計 | 與大多數液體處理機兼容 |
無纖維激光蝕刻塑料 | 易于自動化 |
AFA-TUBE NGS 工作流程
使用 AFA-TUBE 獲得高精度且可重復的結果
圖 2:LE220-Plus,樣品體積為 10 µl。結果顯示,96 AFA-TUBE TPX 板的預期目標尺寸為 150 和 350 bp,每個重復 24 個,尺寸分布緊密。
從全血中提取 HMW gDNA
圖 3 :使用高分子量 (>20 Kb) 提取方案在 Covaris truPOP ® Buffer中提取的 gDNA(30 μl 全血)的大小分布圖。在掃描模式下,96 個樣本的處理時間為 6 分鐘。
gDNA 片段的窄尺寸分布
圖 4:使用兩種不同的格式和密封選項,在 LE220-plus 上剪切后使用片段分析儀對 DNA 進行分析。顯示了 8 AFA-TUBE TPX 條和 96 AFA-TUBE 板的 175 bp 和 350 bp 10 µl 的數據。結果顯示所有三種配置均具有較高的重現性和準確性。
直接從全血中進行高度可重復的 DNA 片段化
圖 5:圖表顯示了高度可重復的 DNA 片段化譜(30 μl 全血)和低變異系數。 DNA 片段大小模式介于 1 和 1.3 kb 之間。通過調整 AFA 條件(未顯示)可以實現剪切至 NGS 兼容的片段大小分布(150 至 500 bp)。通過調整提取緩沖液條件(例如 Covaris 的 truPOP 緩沖液)可以提取高分子量 DNA (40 kb)。對于 96 AFA-TUBE TPX 板,每列處理時間為 30 秒。
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