1、操作前檢查
 
操作人在啟動樓頂風機系統后，即可開始使用實驗室通風柜，在使用前需先檢視：
 
（1）電源開關是否都處于開啟位置。
 
（2）日光燈開關是否打開。
 
（3）設備是否處于排風狀態。
 
2、設備的正確操作模式
 
（1）在組裝、調試或清潔儀器柜內時玻璃視窗為全開狀態。
 
（2）在正常操作狀態時，玻璃視窗是應開至操作人員手肘處（半開），使得操作人員手伸入柜內操作實驗，而胸部以上則應被玻璃視窗所屏護。
 
（3）如果儀器在待機狀態時，調節門應開至。
 
（4）實驗人員在通風柜進行實驗時，應避免將頭伸入調節門內，以免發生危險。
 
（5）通風柜內應避免過多非必要物品、器材等，以免干擾。（一般左右側壁和柜門口15cm內盡量不要放置物品）
 
（6）在實驗過程中、完成后通風柜門不要拉太高，以免降低污染物的捕集率，增加泄漏率。
 
（7）操作人員在結束工作后，離開儀器前，應將通風柜內設備電源關閉，所有水、電、氣開關予以關閉，并且將門降至位置方可離開。
 
（8）實驗室通風柜雖然為高分子耐腐蝕材料，但是為延長使用壽命，定期清洗保養儀器也是很有必要的。平時使用時若有試劑、藥品噴濺應及時拭擦、清除，在每天停止工作離去前，應將內部以清水擦拭清潔，每三個月至少一次將導流板卸下清洗檢查。
 
3、操作人員的位置與動作
 
實驗室通風柜操作人員應隨時注意自己本身與儀器之間相對位置，切忌將頭伸進儀器內，以免造成污染的空氣流經操作人員的呼吸區。
 
避免或降低周圍環境影響—周圍湍流的影響
 
（1）門、窗、主要走道、風扇等
 
如果設備距離門、窗較近時，操作時應盡可能保持關閉，降低橫向氣流的影響；
 
如果在通風柜附近不得不使用風扇，應盡可能降低環境氣流的干擾。
 
（2）人員的移動與操作
 
開柜門時要速度慢，操作實驗中動作也盡量放慢；
 
步入操作區及時離開時，速度要慢；
 
減少在柜門前走動。
 
（3）當通風柜內產生污染物質時，操作熱源必須慢慢地接近或離開，避免速度過快而產生氣流干擾，帶出污染物質。