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預染蛋白marker常見問題及解決方法

來源:上海雅吉生物科技有限公司   2023年02月08日 09:06  

Q1:我使用了你們的一種預染蛋白質標準品進行轉印,發現在轉印過程中條帶在膜上褪色了。為什么會這樣?

A1褪色最可能是由于封閉/洗滌液中的洗滌劑將一些蛋白質從膜上洗脫造成的。染料本身不會從蛋白質上洗脫,因為它們是共價結合的。我們已經發現較小孔徑的膜可以在封閉和洗滌過程中更好地保留蛋白質,因此,為了獲得的分辨率和蛋白質保留率,推薦使用0.2 µm代替0.45 µm的膜。轉印后,可以用鉛筆在膜上圈出預染條帶,從而在封閉和處理后仍可辨認條帶位置。
Q2:我的蛋白質標準中的幾個條帶在凝膠上缺失。你們能幫我排查問題嗎?
A2:
  1. *查使用的凝膠類型/凝膠百分比。可能會由于凝膠類型和/或百分比的不同而不能看到所有條帶。例如,蛋白質標準品的最小條帶可能不能在非常低百分比的凝膠上分辨,而較高分子量條帶可能不能在高百分比凝膠上分辨。

  2. *檢查蛋白質分子量標準品的有效日期。由于蛋白質降解,過期批次可能導致條帶褪色或缺失。

  3. *檢查蛋白質分子量標準品的儲存條件。不適當的儲存條件會損害標準品中蛋白質的穩定性。

  4. *確保蛋白質分子量標準品在上樣到凝膠上之前未加熱/煮沸。我們的蛋白質分子量標準品可直接上樣,我們不建議將其加熱/煮沸,因為這可能會導致標準品中的蛋白質降解。

Q3:我使用了你們的一種蛋白質標準品,并在泳道中看到了一些額外的條帶。可以提供一些建議嗎?
A3:
  • *上樣時,請注意確保相鄰樣品泳道沒有交叉污染。

  • *確保每個泳道上標準品的量都是正確的。蛋白質上樣過多會導致產生額外的條帶,這個問題在使用銀染凝膠時尤為突出。

  • *標準品儲存不當或反復凍融會導致蛋白質降解。

Q4:我使用了你們的一種蛋白質標準品進行轉印,發現一些小分子蛋白質條帶穿過了膜。我該如何解決這個問題?
A4:
  • *降低電壓、電流或縮短轉印時間

  • *確保轉膜緩沖液的甲醇濃度合適;可使用濃度為10–20%的甲醇,從而去除SDS-蛋白質復合物中的SDS,并促進蛋白質與膜的結合。

  • *確保轉膜緩沖液的SDS濃度合適(若加入了SDS),SDS濃度不要超過0.02–0.04%。過多的SDS會阻礙蛋白質與膜的結合。

  • *檢查膜的孔徑和靶標蛋白質的大小。小于10kDa的蛋白質很容易穿過0.45μm孔徑的膜。如果您的目標蛋白質小于10 kDa,那么最好使用0.2μm孔徑的膜。

Q5:我在Tris-甘氨酸凝膠上使用了一種預染標準品,發現蛋白質的分子量與在NuPAGE Bis-Tris凝膠上的分子量不同。這是什么原因?
A5:預染標準品具有與每種蛋白質共價結合的染料,這將導致標準品在不同的緩沖系統(即不同的凝膠)中遷移率不同。因此,使用預染標準品進行分子量估算將僅得出蛋白質的表觀分子量。預染標準品可用于分子量估算、確認凝膠遷移和估算轉膜效率,但對于需要精確估算分子量的應用,應使用非預染標準品。
Q6:我使用了你們的一種蛋白質標準品進行轉印,發現一些高分子蛋白質條帶轉印到膜上的效果很差。可以提供一些提示嗎?
A6:
  • *增加電壓、電流或轉印時間

  • *凝膠和SDS-蛋白質復合物中的SDS會促進蛋白質從凝膠中洗脫,但抑制蛋白質與膜的結合。這種抑制作用在硝化纖維素膜上的強度大于PVDF膜。對于難以從凝膠中洗脫的蛋白質,如大分子量蛋白質,可在轉膜緩沖液中加入少量SDS以改善轉印效果。我們建議在組裝三明治前將凝膠置于含0.02–0.04% SDS的2x轉膜緩沖液(無甲醇)中預平衡10分鐘,然后使用含10%甲醇和0.01% SDS的1X轉膜緩沖液進行轉印。

  • *甲醇可去除SDS-蛋白質復合物中的SDS,促進蛋白質與膜的結合,但對凝膠本身有一些不良影響,會降低轉印效率。甲醇可能導致孔徑減小、某些蛋白質發生沉淀以及一些堿性蛋白質帶正電荷或變為中性。應確保轉膜緩沖液的甲醇濃度不高于10–20%,并使用高質量的分析級甲醇。

Q7:我使用了你們的一種蛋白質分子量標準品,它的條帶看起來不太明顯,很模糊。我該怎么操作?
A7:
  • *確保每個泳道上標準品的量都是正確的。蛋白質上樣過多會導致模糊,這個問題在使用銀染凝膠時尤為突出。

  • *條帶在低百分比凝膠中不能很好地分辨。嘗試使用更高百分比的凝膠。

  • *如果在轉膜/檢測后條帶看起來不明顯和模糊,可能是由于抗體濃度過高。遵循制造商建議的稀釋度或通過斑點印跡確定最適抗體濃度。

Q8:我使用了你們的一種預染蛋白質分子量標準品進行轉印,但是膜上的轉印效果較差。可能出了什么問題?
A8:
  • *凝膠上的分子量標準品的量不足: 將適當體積的分子量標準品上樣到凝膠上。以下是我們的建議:(小型凝膠:每孔5μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔10μL(厚度1.5 mm);•大凝膠:每孔10μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔20μL(厚度1.5 mm))

  • *轉印不全或不理想: 優化轉印條件

Q9:我使用了你們的一種預染蛋白質分子量標準品,這些條帶沒有很好地分離。可能是什么原因造成的?
A9:
  • *樣品被煮沸: 丟棄煮沸的分裝樣品。

  • *使用的分子量標準品體積過大: 加入較少的體積或使用前用蛋白質上樣緩沖液稀釋分子量標準品。


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