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NanoTemper 助力小分子靶向無序蛋白(IDP)的研究

來源:諾坦普科技(北京)有限公司(NanoTemper Technologies)   2022年11月04日 15:19  


高 分 文 獻 解 讀


前列腺癌是quan球男性zui常見的癌癥之一。早期、低級別的癌癥可以通過手術或放射成功治療。對于患有前列腺以外的高級別腫瘤的患者,標準治療與雄激素治療相結合。雄激素消融阻斷前列腺腫瘤賴以生長和存活的男性激素,最初是有效的;然而,在沒有雄激素的情況下,前列腺癌會再次生長,并發展為更具侵襲性的形式,稱為去勢抵抗型前列腺癌(CRPC)。抗去勢前列腺癌患者不可避免地會對抗雄激素療法產生耐藥性,部分原因是雄激素受體(AR)突變或剪接變體能夠恢復AR信號。


上海奕拓生物和上海Chinese Academy of Sciences生物與化學交叉研究中心朱繼東/朱光亞團隊合作的研究顯示配體活化的AR可以形成轉錄活性的聚合物。AR的結構化和非結構化區域都有助于AR的有效相分離,無序N端起主要作用。AR液-液相分離行為具有轉錄活性和抗雄激素功效??剐奂に乜梢砸耘潴w獨立的方式促進AR抗性突變體的相分離和轉錄活性。該研究進行了基于相分離的表型篩選,并鑒定了ET516分子,ET516特異性破壞AR聚合物,有效抑制AR轉錄活性,并抑制表達AR抗性突變體的前列腺癌細胞的增殖和腫瘤生長。研究的結果表明液-液相分離是一種新的耐藥機制,并表明靶向相分離可能為藥物發現提供一種可行的途徑。


doi.org/10.1038/s41589-022-01151-y

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在這項研究中,來自于NanoTemper的微量熱泳動MST互作技術以及nanoDSF蛋白穩定性技術發揮了重要的作用。


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圖注:微量熱泳動(MST)實驗,作者用AR (NTD,1-555aa)–mEGFP


蛋白與不同濃度的ET516(藍色)以及Enza(紅色)孵育進行MST實驗。mEGFP蛋白用作陰性對照(綠色)。使用親和力分析軟件擬合數據。結果表明,ET516與NTD的親和力Kd值25µM,表明ET516可以作為很好的候選分子。


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圖注:與ET516孵育的AR AF-1(144-450 aa,0.3 mg/mL)中的TSA測定


加熱過程從25℃增加到81.5℃,升溫速率為1℃/min。記錄發射強度比(Em350nm\/Em330nm),分析熒光強度比(左圖)和一階導數(右圖)。

監測蛋白內源熒光的nanoDSF實驗顯示,ET516處理后AR AF-1中的熒光比率呈劑量依賴性下降,進一步證實了ET516和AF-1的相互作用。熱位移TSA結果表明,AF-1是典型的固有無序蛋白,其在加熱過程中沒有明顯的發射強度變化;然而,與ET516孵育誘導了AF-1熔化溫度的劑量依賴性變化,表現為球狀蛋白,表明ET516與重新分布后穩定的構象AF-1結合。Promethus系列儀器通過內源熒光檢測,無需加入染料,對緩沖液沒有要求,高精準的檢測精度可以保證即使是極小結構變化造成的Tm值shift都可以很好表征。


對于固有無序蛋白,因為其蛋白的無序性的特性,其他常規方法難以進行檢測。在這篇工作中,通過MST技術及nanoDSF技術,很好的篩選到目的分子。


Monolith系列分子互作儀基于MST技術,不依賴于分子量的改變,蛋白用量少,對于蛋白聚集耐受度高,可以輕松表征不同類型的分子間相互作用。

生物分子互作儀 Monolith X

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Promethus系列儀器,以nanoDSF技術為核心,通過檢測蛋白內源熒光監測蛋白的穩定性,該技術檢測蛋白濃度寬泛,低濃度也可輕松表征,媲美DSC的高精準檢測結果,快速高通量的檢測速度,在小分子篩選上具有不可比擬的優勢。

蛋白穩定性分析儀 PR Panta

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