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一、分析效率
主要關注以下參數：每秒可實現多大通道(多少駐留時間、多少延遲時間)、MRM測定正負極性切換時間、掃描測定速度等。各個參數的優化選擇可以大大提高用戶的分析測定效率。
二、穩定性
關注離子化接口是否穩定，是否可以在長時間持續或間斷測定序列中獲得穩定且可靠的數據，碰撞室串擾zui小化保證高定量精度，準確捕捉超快速分析中的尖銳色譜峰，重現性是否良好。
三、日常維護
在日常工作中，對于儀器的維護不可少，從用戶角度考慮，日常維護是否簡單便捷將會是考慮的重要因素之一，若是太過復雜繁瑣無疑將會給用戶帶來額外的負擔。因此如果廠家還能提供定期的上門維護服務將會有很大裨益。
四、操作性
主要針對質譜工作站軟件。一套好的軟件操作平臺與儀器本身的設計有很大的關系，采購者可以根據自己的需要來操作檢驗質譜工作站：一般要求軟件對分析數據具有可靠的安全性，簡單實用可操作性強，能夠自動編輯分析方法(具有推薦方法)，自動進行數據的采集、處理、分析，自動進行條件優化選擇(很重要)、自動顯示對分析過程各參數的實時監控、自動報警出現的錯誤并提示原因、自動進行QA/QC控制。在實際操作過程中還需關注軟件的流暢性，有些儀器所配置的內存較小，在長時間的使用后經常會出現軟件卡頓甚至死機的情況出現，造成不必要的麻煩。
對于二手液質聯用儀的指標，驗收，有幾個是比較重要的建議：
(1)靈敏度，要在單位質量分辨率下
(2)分辨率，要指明在哪個具體的質量處
(3)單位質量分辨下的m/z范圍
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