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中壓制備色譜是一般由泵提供壓力，壓力在5~20bar。中低壓色譜柱與常壓柱、HPLC柱有比較大的不同：在使用是是封閉的，但是可以比較方便的打開與調節長度，這與中低壓色譜常常固體上樣相適應的。中低壓制備色譜柱的材質主要有塑料柱、玻璃柱、不銹鋼柱三種。
中壓制備色譜的主要部件為輸液泵、進樣閥、檢測器、餾分收集器等，早期的中壓液相制備色譜，其輸液泵大流速可達156mL/min，并配有阻尼器，以保證液流的穩定；進樣器配有0.5-50mL的不同體積的定量管；檢測器有紫外和示差折光檢測器，流通池體積比較大，允許大流量流動相通過而無需分流；餾分收集器有原盤式和排式兩種，原盤式的接收管多達80個，而后者則更多；色譜柱內徑9-105mm，長度250-1760mm不等。
對于一般中壓制備色譜，當色譜柱直徑較大時，柱頭往往設計成錐形或有類似于傘狀的液流導向結構，使得當大量樣品進入到柱頭上時，能迅速地分散到整個柱橫截面上，及時被流動相沖走，避免了因樣品的局部過濃而引起柱超負荷和譜帶加寬。柱子填料則采用比較耐壓的交聯改性的多糖凝膠(如SepharoseCL，Superose等)，聚合物微球，復合材料介質或硬質SiO2基體的化學鍵合相等，粒徑一般在25～40μm（常用的填料尺寸是15-25μm，25-40μm或40-63μm），可采用濕法或干法裝柱。
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