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實驗室用水的純度高低，將直接影響到整個測試的準確性。目前，實驗室樣品測試的用水標準用普通純水即可用于常量分析，微量元素分析和離子電極法，原子吸收光譜法等有時需用優質的純水(主要考慮到水中微量金屬元素的存在)。
超純水設備的預處理系統一般由砂濾器、碳濾器、軟化器三部分組成，砂濾器和碳濾器要注意沖洗，以便將器體中累積的雜質去除，以防顆粒較大的雜質進入反滲透機組造成膜堵塞，一般來說，以自來水為原水的超純水設備，其砂碳過濾器每個三天就要沖洗一次，當然對于全自動的超純水設備，其沖洗程序自動進行，比較省時省力。
為了便于實驗室超純水器的安裝和開閉，建議進水口與設備相隔1-2米。更換配件時方便關閉進水口，同時不會因管道太長影響到制水效率。如果實驗室空間足夠，盡量不要讓設備周圍有太大的電壓波動和強烈的電磁干擾，尤其是含有取水臂和遙控功能的設備，電源應妥當放置，建議放在不太遠的隱蔽之處。條件允許的話，可以加一個防水罩，在管子出現問題或是更換配件處理不當噴出水時可以有效保護電源。
通水通電后，原水壓力使低壓開關閉合，此時電路形成通路。
電路連通后，進水電磁閥打開，水泵啟動。
經過高壓泵增壓使原水滲透過膜片，從純水機出水口出來的就是純凈水，而濃縮水順著
純水經過逆止閥后就到了高壓開關，它的主要作用是水滿后，將電路斷開的作用。
從廢水出水口出來的廢水經過沖洗閥和廢水比(或組合沖洗電磁閥)，沖洗的時候，沖洗閥打開，借助水泵的壓力沖洗膜表面的雜質。沖洗狀態，無純水。
廢水出水口排放掉。在純水出水口處有一個配件—逆止閥，也叫做單向閥，它的作用是防止純水回流的作用。
純水進入到壓力桶，壓力桶儲存純水，當鵝頸水龍頭關閉，壓力桶水滿后，在鵝頸水龍頭和單向閥之間形成了一股壓力，達到高壓開關啟動值之后，高壓開關斷開，機器停機。
實驗室超純水器沖洗完畢后，沖洗閥閉合，水經過廢水比，膜殼內有足夠的滲透壓，使水透過膜片，保證純水流出。
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