北京大學腫瘤醫(yī)院梁軍教授團隊通過 CRISPR 篩選,得到了一種驅(qū)動 HCC 細胞對治療藥物產(chǎn)生耐藥機制的方法。并通過這種方法發(fā)現(xiàn) PSTK(磷酸絲氨酰-tRNA激酶)是一種重要的 RNA 依賴性激酶,也是 HCC 細胞對靶向治療產(chǎn)生抗性的關鍵介導因子,可通過抑制鐵死亡誘導起作用。
鐵死亡是一種鐵依賴性的,區(qū)別于細胞凋亡、細胞壞死、細胞自噬的新型的細胞程序性死亡方式。其的本質(zhì)是谷胱甘肽的耗竭、谷胱甘肽過氧化物酶(GPX4)活性下降、脂質(zhì)氧化物不能通過 GPX4 催化的谷胱甘肽還原酶反應代謝,之后二價的鐵離子氧化脂質(zhì)產(chǎn)生活性氧,從而促使鐵死亡的發(fā)生。
因癌細胞比正常細胞利用更高水平的鐵以促進其更具侵襲性的生長,且對鐵誘導劑更敏感,因此,鐵誘導物有望治療腫瘤耐藥,特別是在 HCC 中。
CRISPR 篩選結(jié)果
PSTK 抑制鐵死亡誘導
谷胱甘肽過氧化物酶 4 (GPX4) 是鐵中毒的中心調(diào)節(jié)因子,可減輕鐵中毒過程的毒性。PSTK 是參與硒代半胱氨酸生物合成的關鍵激酶,而硒代半胱氨酸是 GPX 蛋白的活性中心 ,因此 PSTK 的調(diào)控可以使 HCC 對靶向治療誘導的鐵離子中毒產(chǎn)生抗性。
肝癌患者 PSTK 過度表達與 Gpx4 表達相關
例如,在使用 Abemaciclib、Sorafenib 或 Erastin 進行靶向治療時,會導致 HCC 細胞中產(chǎn)生明顯的鐵離子信號 (圖AC),且 PSTK-KO HCC 細胞會顯示較低的 GPXs 和 GPX4 基線活性 (圖D)、PSTK-KO Hep3B 細胞會表現(xiàn)出較高的 ROS 基線水平,并且這些水平在靶向治療后會進一步放大 (圖E),但是 PSTK 可通過維持 GPX4 的活性來抑制鐵離子的誘導。
PSTK 維持 GPX4 的活性以防止鐵離子誘導
同時,作者通過 RNA-seq 分析,以及對差異表達基因進行 KEGG 富集分析 (圖A) 發(fā)現(xiàn),敲除 PSTK 后,磷酸化鐵蛋白相關基因表達有明顯差異 (圖B) ,嗜鐵基因組呈負富集 (圖C),與鐵卟啉相關的關鍵保護因子下調(diào) (圖D) 。
綜合代謝組學和 RNA-seq 分析將 PSTK 鑒定為鐵死亡抗性的介質(zhì)
細胞內(nèi)氧化磷脂水平顯著增加, GSH(谷胱甘肽)轉(zhuǎn)化為 GSSG(氧化型谷胱甘肽) 。
代謝物水平變化
GSH 合成過程中的關鍵成分,γ-谷氨酰半胱氨酸、半胱氨酸甘氨酸和半胱氨酸水平顯著降低,胱氨酸和谷氨酸水平不會明顯變化。此外,與葉酸生物合成相關的關鍵代謝產(chǎn)物水平降低,包括葉酸和 5-甲基四氫葉酸。
GSH 合成成分水平變化
由此可見,GSH 的耗竭和一些直接、間接的靶向機制,都可以導致 GPX4 失活,而且除抑制體系 System Xc-外,直接抑制 GSH 的合成也可誘導鐵細胞凋亡。因此可通過調(diào)控 PSTK 維持 GPX4 的活性和 GSH 的合成來保護 HCC 細胞免受鐵細胞死亡的誘導。
PSTK 抑制劑
作者利用 TargetMol 的化合物庫進行了基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選以識別 PSTK 抑制劑。top 10 的化合物對接得分如圖所示。通過結(jié)合模式分析,選取了 4 個具有代表性的化合物,其中兩種可水解的單寧 (Punicalin 和 Geraniin) 對 PSTK 活性袋的結(jié)合親和力最高。
虛擬篩選后top 10 的化合物
這兩種單寧直接用于治療 HCC 細胞時,會使得 HCC 細胞對索拉非尼更加敏感,且腫瘤細胞中 GPX4 蛋白水平會顯著降低。
CCK-8 試驗表明,Geraniin 和 Punicalin 具有顯著的抗 HCC 活性
PSTK 和 GPX4 蛋白水平顯著降低
同時,在一項動物研究中發(fā)現(xiàn) Punicalin/ geraniin 與 Sorafenib 一起口服后,Punicalin 與 Sorafenib 協(xié)同作用能夠顯著抑制腫瘤生長。
動物實驗中腫瘤體積隨時間變化
因此,使用 Punicalin 阻斷 PSTK 激酶活性可能是克服肝癌中索拉非尼耐藥的一種有效手段。 綜上所述,作者的研究確定了 PSTK 是肝癌細胞鐵死亡抵抗的關鍵介質(zhì)。從機制上講,PSTK 的耗竭與硒代半胱氨酸依賴的 Gpx4 激活、谷胱甘肽代謝和葉酸合成的抑制有關,并可導致亞致死性鐵死亡的誘導,從而使肝癌細胞對能夠誘導鐵死亡的靶向治療更加敏感。因此,抑制 PSTK 可能是克服肝癌患者靶向治療耐藥性的一種新穎可行的方法,該蛋白的抑制劑值得進一步的臨床研究。 陶術可提供多種 PSTK 抑制劑相關的化合物和化合物庫以及虛擬篩選服務,助力領域相關研究。
相關產(chǎn)品 |
SCR7 pyrazine Enhances CRISPR-Cas9-mediated homology-directed repair (HDR) efficiency in vitro up to 19-fold. Inhibits nonhomologous end-joining (NHEJ). |
激酶抑制劑庫 2203種激酶抑制劑的*集合,用于特定靶向激酶,可用于高通量篩選和高內(nèi)涵篩選; |
激酶庫 The KINASet Library is a computationally selected group of more than 12,000 small molecules from our EXPRESS-Pick Collection chosen using a ligand-based pharmacophore search query. |
Punicalin Punicalin exerts anti-inflammatory, antioxidative, and anti-hepatotoxic activities, it shows inhibitory activity on HIV-1 reverse transcriptase in a dose-dependent manner, with an IC50 of 0.11 microg/ml (0.14 microM). |
Geraniin Geraniin has cytotoxic activity towards cancer cells in vitro and in vivo. |
References
1.Chen, Y., Li, L., Lan, J. et al. CRISPR screens uncover protective effect of PSTK as a regulator of chemotherapy-induced ferroptosis in hepatocellular carcinoma. Mol Cancer 21, 11 (2022). doi.org/10.1186/s12943-021-01466-9
2.De Mattia E, Cecchin E, Guardascione M, et al. Pharmacogenetics of the systemic treatment in advanced hepatocellular carcinoma. World J Gastroenterol. 2019;25:3870–96.
3.Nie J, Lin B, Zhou M, Wu L, Zheng T. Role of ferroptosis in hepatocellular carcinoma. J Cancer Res Clin Oncol. 2018;144:2329–37.
4. Forner A, Reig M, Bruix J. Hepatocellular carcinoma. Lancet (London, England) 2018;391:1301-14.
5.Keating GM. Sorafenib: A Review in Hepatocellular Carcinoma. Target Oncol. 2017;12:243–53.
免責聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關法律責任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點和對其真實性負責,不承擔此類作品侵權(quán)行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負版權(quán)等法律責任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關權(quán)利。