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Applied Biosystems™ 7300 和 7500 實時熒光定量PCR儀器入門指南:相對定量測定
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實時熒光定量PCR(qPCR)作為分子生物學研究中的一種強大工具,已廣泛應用于基因表達分析、病原體檢測、基因分型和藥物篩選等多個領域。賽默飛世爾科技旗下的Applied Biosystems™ 7300 和 7500系列實時熒光定量PCR儀器,憑借其出色的性能、簡便的操作和強大的數據分析能力,成為眾多實驗室和研究機構的。本文將為您詳細介紹這兩款儀器,并著重講解其在相對定量測定中的應用。
Applied Biosystems™ 7300 和 7500 實時PCR儀器是專為滿足不同規模實驗室需求設計的高性能設備。它們均集成了多通道熒光檢測、精準溫度控制和直觀的數據分析軟件,能夠幫助科研人員進行快速、準確的核酸定量分析。
7300 實時熒光定量PCR儀器:7300型號為中小規模實驗室設計,適合需要中等通量的研究。其系統采用96孔板,適合常規實驗的定量分析。
7500 實時熒光定量PCR儀器:7500系列與7300的主要區別在于其優化的速度和靈活性,能夠在更短的時間內完成PCR反應。7500可用于高通量實驗,擁有更強的處理能力,特別適用于時間要求較高的實驗室。
Applied Biosystems™ 7300 和 7500 系列實時熒光定量PCR儀器采用的核心技術確保了實驗數據的高靈敏度、準確性和重現性。以下是其幾大核心技術優勢:
這兩款儀器均配備了多通道熒光檢測系統,7300 配有四通道檢測能力,而7500系列擁有五通道熒光檢測功能。多通道熒光檢測允許用戶在同一個反應體系中檢測多種目標基因,實現多重PCR的應用。多重檢測極大地提高了實驗的通量,同時節省了樣本量和反應時間。
PCR反應的關鍵在于精確的熱循環控制。Applied Biosystems™ 7300 和 7500 實時PCR儀器內置高精度溫度控制模塊,確保每個PCR反應循環中的溫度變化均一且穩定,減少了因溫度波動造成的實驗偏差,從而提高了PCR反應的重復性和可靠性。
這兩款儀器均配備直觀易用的軟件界面,操作流程簡便。其專屬的qPCR軟件能夠自動化分析實驗數據,支持多種分析模式,如絕對定量、相對定量、SNP分析和基因分型。即使是新手實驗人員,也能夠迅速掌握儀器操作流程,完成數據采集與分析。
7300 和 7500 系列儀器均支持多種熒光染料和探針化學試劑,如SYBR Green、TaqMan探針和分子信標。這種廣泛的兼容性為用戶提供了高度靈活性,能夠根據具體實驗需求選擇最佳的試劑和反應方案。
相對定量PCR是一種廣泛應用于基因表達分析的方法,通過與內參基因的比較來確定目標基因的相對表達水平。以下是Applied Biosystems™ 7300 和 7500 實時PCR儀器在相對定量測定中的應用方法和流程。
相對定量測定基于△△Ct方法(雙重循環閾值比較法),其中Ct值代表PCR擴增達到熒光信號閾值所需的循環數。通過比較目標基因與內參基因的Ct值差異,可以計算目標基因在不同實驗條件下的相對表達水平。
相對定量的計算公式為:
其中:
該方法能夠精準反映基因表達在不同實驗條件下的變化,適用于比較多個樣本或實驗條件下的基因表達差異。
在相對定量PCR實驗中,首先需要從實驗樣本(如組織或細胞)中提取高質量的RNA,然后通過逆轉錄反應將RNA轉化為cDNA。為了確保實驗結果的準確性,RNA樣本必須保持純凈,避免蛋白質、DNA或有機溶劑的污染。
使用Applied Biosystems™ 7300 或 7500儀器,qPCR反應體系通常包括:
目標基因和內參基因的引物
cDNA模板
熒光探針(如TaqMan探針)或SYBR Green染料
PCR酶和緩沖液
確保引物設計合理,能夠特異性擴增目標基因和內參基因的片段,同時引物退火溫度優化到最佳,以提高反應的擴增效率。
在Applied Biosystems™ 7300 或 7500系統中,用戶可以輕松設置PCR循環參數,包括預變性、退火和延伸步驟。根據具體實驗的優化情況調整退火溫度和循環次數,確保高效的擴增。
qPCR反應完成后,系統會自動生成Ct值。通過內置的軟件,用戶可以輕松地利用△△Ct方法進行相對定量分析。數據分析過程中,需確保內參基因的Ct值在不同樣本間保持相對穩定,才能確保相對定量結果的準確性。
在相對定量PCR實驗中,數據標準化是非常關鍵的一步。通常使用內參基因來校正樣本間的差異,常見的內參基因包括GAPDH、β-Actin和18S rRNA等,這些基因在不同實驗條件下的表達通常保持穩定。在進行實驗設計時,選擇適合的內參基因能夠顯著提高相對定量結果的準確性。
在基因表達分析中,Applied Biosystems™ 7300 和 7500 實時PCR系統被廣泛應用于檢測特定基因在不同組織、發育階段或實驗條件下的表達水平。例如,在癌癥研究中,科研人員可以利用這些儀器分析腫瘤組織中與癌癥相關基因的表達變化,揭示潛在的分子機制。
7300 和 7500 系列儀器在病原體檢測方面表現優異,尤其是在病毒或細菌核酸檢測中。相對定量方法能夠幫助臨床研究人員量化病原體的感染水平,為疾病診斷和防控提供有力的支持。
在藥物篩選過程中,研究人員經常使用7300 和 7500 實時PCR系統分析藥物處理后細胞中基因表達的變化,以評估藥物的效果和毒性。這種應用尤其適用于高通量篩選研究,通過多重qPCR檢測多個基因,快速評估藥物對不同基因的調控作用。
Applied Biosystems™ 7300 和 7500 實時PCR系統的高靈敏度能夠檢測到微量的核酸,并精確量化其表達水平。這在分析低豐度基因表達時尤為重要,能夠提供可靠的實驗結果。
多重熒光檢測功能使得7300 和 7500 系列能夠在一次反應中同時檢測多個基因,大大提高了實驗效率,減少了樣本和試劑的用量。
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