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LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆試劑盒
產品貨號:PT0101
儲存溫度:-20℃儲存,至少12個月。冰袋運輸,1-2 天置于室外常溫不影響質量。
試劑盒組成 | 20次 | 80次 |
TOPO-TA/Blunt Vector(30ng/ul) | 40ul | 160ul |
1000bp Control(30ng/ul) | 5ul | 5ul |
10 Enhancer | 20ul | 80ul |
產品介紹
本制品和傳統的T4連接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)、高效(接近100%)連接DNA片段的原理采用本公司du創的工藝制成。
(1)可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)完成任意PCR產物(兼容A末端/平末端)連接。
(2)特制的新型載體質粒大小僅僅不到2kb,充分發揮了TOPO載體越小,可容納片段越大的優勢,最大限度提高了大片段連接效率;連接后質粒大小比傳統載體小2kb以上,質粒越小,轉化效率越高,極大的提高了各種片段連接后的轉化子數量。
(3)采用氨芐抗性載體只需10min復蘇時間,比卡那抗性載體1小時復蘇時間縮短6倍。
(4)最快可以不用冰浴和熱休克,室溫5min內完成轉化;無需1小時復蘇,只需37℃10 min復蘇便可以涂板。從連接到涂板最快只需15-20min。
(5)zi殺基因零背景原理,無自連假陽性,無需繁瑣藍白斑篩選和菌落PCR篩選。大部分情況下隨機挑一個克隆便是有插入的(接近100%)。
(6)連接長片段能力遠超傳統TA/Blunt克隆載體,可連接長達10kb片段(例如連接5kb片段,也可能達到挑10個菌落,至少8個是有插入的效果),是新一代shi界領xian的簡單、快速、零背景免篩選的TOPO TA/Blunt克隆載體。
注意:測序只能采用M13F/M13R通用引物測序(見后面圖譜),但是不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序。菌落 PCR 可使用和測序相同的引物。
操作步驟
1.連接反應的準備:
PCR引物使用正常設計的引物即可,不需做任何改變(不能用磷酸化引物)。任意PCR產物(兼容A末端/平末端)均可以直接連接。PCR產物一般建議膠回收純化,這樣可以避免后續可能的問題。如果PCR產物僅有目的條帶、無非特異條帶和引物二聚體,也可嘗試直接進行連接反應。如果是以質粒為模板的PCR產物則最好進行純化,因為模板質粒也可能長出菌落(但不是想構建的目的載體)。
2.連接反應:
1)室溫(25℃-37℃)設立10ul連接體系(建議用0.2ml PCR 管,PCR儀器控溫):
純化后的PCR產物或1ul 1000bp control | 0.5-5ul |
TOPO-TA/Blunt Vector | 2ul |
10 x Enhancer | 1ul |
無菌水 | Xul |
總體積 | 10ul |
加完試劑后,用移液器輕輕吹打混勻或者輕彈管底混勻,低速瞬時離心收集所有液體在離心管底,注意此步驟不能在冰上進行,只能在室溫(25℃-37℃)進行。
注:如果使用5ul體系連接,各成分按照比例減半使用,使用次數可以加倍。不同大小插入片段的推薦用量(注意過量太多了,反而導致轉化子減少)
插入片段大小(bp) | 推薦用量(ng) |
100-1000 | 10-40 |
1000-2000 | 40-80 |
2000-5000 | 80-180 |
2)室溫(25℃-37℃)連接5min。
本載體推薦室溫(25℃-37℃)5min完成連接。長片段或者連接困難片段可以延長連接時間到10-15min,溫度可選37℃,可顯著增加轉化子數量。
3)連接產物置于冰上備用。立即接標準的感受態轉化步驟或者快速轉化步驟。
3.快速轉化:
1)感受態細胞從-80℃拿出,迅速插入冰浴中,解凍融化(約1-3min左右)。
2)立刻加入5ul連接液(最多可全部加入,只要體積不超過感受態細胞體積的1/10), 用手撥da離心管底輕輕混勻(避免用槍吸打),冰浴放置5min。
3)42℃水浴熱激60秒,迅速放回冰浴靜置2-3min,該過程不要搖動離心管。
注意:此步驟shou選建議 42℃水浴 60 秒熱激。但是根據我們的經驗,大部分商品化的TOP 10 和 DH5a 感受態細胞此步驟也可將離心管置于室溫(?22℃)進行, 時間不需十分準確,夏季或室溫較高時,可放置 5-8min左右;如果室溫較低,可延長時間至8-15min左右。有經驗的客戶可以根據具體情況嘗試無熱激轉化。
4)加 300-500ul LB或者SOC培養基(不含抗生素),37℃ 200 rpm 振蕩培養10min。
根據經驗,一般可以直接將培養基(如從冰箱取出溫度低,應事先置37℃溫箱回溫至22℃-37℃)加入到感受態細胞的1.5 ml 離心管,蓋上離心管蓋,水平固定在振蕩培養箱中振蕩培養復蘇即可,不需要轉移到試管培養復蘇。
一般商品化的感受態細胞不超過 2kb 插入片段情況下,熱休克后 10-15 min復蘇可以得到足夠多轉化子,如果使用實驗室自制的感受態效率低、或者轉化子少、插入片段長的情況下可以提高復蘇時間到 30-60 min以得到更多的轉化子。
5)取100-200ul菌液涂板(培養板含氨芐qing霉素100ug/ml),培養過夜。(如果預計轉化子少,為得到較多克隆,4000rpm 離心1min,吸棄掉部分上清,保留100-150ul,輕彈懸浮菌體,取全部菌液涂板)
4.轉化子的篩選鑒定:
本制品采用zi殺基因零背景原理,無插入自連的細菌會zi殺無法生長,因此幾乎沒有假陽性,一般情況下,可以達到所見即所得,只要是長出來的菌落正常(不是污染的雜菌,轉化子數量也不算太少),基本就包含插入。因此插入片段不超過 2-3kb 的情況下可以不用菌落PCR 鑒定,直接挑 1-2 個菌去測序。
1)一般本公司TOPO 載體陽性率非常高,所以菌落生長正常,數量也不是太少的情況下建議省略菌落 PCR/菌液 PCR 鑒定直接去測序。注意測序引物不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序。
2) TOPO 載體的菌落 PCR 結果容易出現假陰性。因此在使用菌落 PCR 鑒定的情況下,如菌落 PCR 結果陽性,一般可以相信此結果。如結果是陰性,或者顯示擴增出大小和預期不符合,一般不可相信,要考慮到菌落 PCR 結果假陰性的可能。需要進一步提取質粒電泳跑大小,或者酶切鑒定來確認。
用上述培養的白色菌落的菌液抽提質粒,插入片段較大的情況下,直接跑電泳看質粒大小就直接能鑒定出有插入的質粒,還可用 EcoR I/Ecor V 單酶切釋放插入片段或用其它合適的酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢查片段大小,確定是否含有目的片段。
pTOPO-TA/Blunt 載體圖譜:
pTOPO-TA/Blunt 載體多克隆位點序列: