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T4 DNA Ligase(Fast)
產品貨號:T5205-200U
儲存條件:-20℃
產品組成
組分 | 規格 |
T4 DNA Ligase(Fast)(5U/ul) | 40ul |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 1ml |
50% PEG | 1ml |
注:1U=1 Weiss unit
產品簡介
T4 DNA Ligase(Fast)由攜帶T4噬菌體gene30的大腸桿菌產生。該酶催化雙螺旋DNA或RNA之間的5'-磷酸基團和3'-羥基之間形成磷酸二酯鍵。該酶在雙鏈DNA、RNA或者DNA/RNA復合物間可修復單鏈缺刻,并且可以連接有粘性末端或者平末端的DNA片段,但對于單鏈核酸無活性,主要用于限制性內切酶酶切產物DNA片段克隆、基因定點突變與PCR產物克隆、修復雙鏈DNA缺刻與線性DNA自環化。T4 DNA Ligase(Fast)需要ATP作為輔助因子,在室溫下完成粘性末端連接反應僅需10分鐘。
酶活單位定義
37℃條件下,1 Weiss unit的酶在20min內催化1nmol的[PPi]轉變為活性炭吸附態。1 Weiss unit等同于約200個粘性末端連接反應單位(CEU),相當于在16℃條件下,30min內連接50% HindIII消化后的λDNA片段。
酶活檢測條件
酶活在如下反應混合物中進行測試:66mM Tris-HCl(pH7.6),6.6mM MgCl,0.066mM ATP,10mM DTT,3.3μM[32PPi]。
質量控制
核酸量內控切酶制殘留測試
37℃條件下,將200U的T4 DNA Ligase(Fast)與1ug的pUC19DNA中溫育4h,未檢測出共價閉合環狀DNA轉變為帶有缺刻的DNA。
核酸外切酶殘留檢測
將酶液與雙鏈DNA底物在37℃溫育16h,通過DNA電泳檢測雙鏈DNA底物無變化。
藍白斑測試
室溫條件下,使用30U T4 DNA Ligase連接pUC57 DNA/HindIII,pUC57 DNA/PstI或pUC57 DNA/SmaI消化產物1h,然后用E.coli XL1-Blue感受態細胞轉化連接產物,檢測到少于1%的白斑。
使用方法
1.DNA插入片段連接至載體DNA(粘性末端連接)
1)于冰上配制如下反應體系:
試劑 | 使用量 |
線性化載體DNA | 20~100ng |
插入片段DNA | 3:1~10:1(片段:載體摩爾比) |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 1U(0.2ul) |
Nuclease-FreeWater | To 20ul |
2)充分混勻并瞬離,22℃溫育10min;
3)取1~5ul的連接產物用于50ul化學感受態細胞的轉化,或者取1~2ul用于50ul電轉感受態細胞的轉化。
注:如果連接反應產物用于電轉化,應使用離心柱或者氯仿抽提清潔DNA代替熱失活步驟。
2.DNA插入片段連接至載體DNA(平末端連接)
1)于冰上配制如下反應體系:
試劑 | 使用量 |
線性化載體DNA | 20~100ng |
插入片段DNA | 3:1~10:1(片段:載體摩爾比) |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
50% PEG | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 5U(1ul) |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
2)充分混勻并瞬離,22℃溫育1h;
3)取1~5ul的連接產物用于50ul化學感受態細胞的轉化,或者取1~2ul用于50ul電轉感受態細胞的轉化。
注:如果連接反應產物用于電轉化,應使用離心柱或者氯仿抽提清潔DNA代替熱失活步驟。
1. 線性DNA自環化
1)于冰上配制如下反應體系:
試劑 | 使用量 |
線性化DNA | 10~50ng |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 5ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 5U(1ul) |
Nuclease-Free Water | To 50ul |
2)徹di混勻并瞬離,22℃溫育10min;
3)取1~5ul的連接產物用于50ul化學感受態細胞的轉化,或者取1~2ul用于50ul電轉感受態細胞的轉化。
注:如果連接反應產物用于電轉化,應使用離心柱或者氯仿抽提清潔DNA代替熱失活步驟。
2.接頭連接
雙鏈寡核苷酸接頭經常被用于在插入片段上產生粘性末端。接頭通常包含限制酶識別位點,在連接后經酶切處理產生和克隆載體匹配的粘端。有時候接頭已包含與克隆載體匹配的粘端,此時無需在接頭連接完成后進行插入片段的進一步處理。
1)于冰上配制如下反應體系:
試劑 | 使用量 |
線性化DNA | 100~500ng |
磷酸化接頭 | 1~2ug |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
50% PEG | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 2U(0.4ul) |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
2)徹di混勻并瞬離,22℃溫育10min;
3)在65℃作用10min或者70℃作用5min,進行熱失活。
注:添加1mM ATP的條件下,T4 DNA Ligase(Fast)在LabFD™酶切緩沖液中具有100%活性。因此,接頭連接反應時可以在LabFD™酶切緩沖液中進行,以簡化“接頭連接-酶切"實驗流程。具體方法為:接頭連接反應完成后,先失活T4 DNA Ligase,然后向該體系中添加ATP至終濃度1mM,再在體系中加入適量的LabFD™快速內切酶,最后使用最適酶切反應溫度進行溫育即可。
注意事項
1)T4 DNA Ligase在濃度高于200mM的NaCl或KCl中會被強烈抑制;
2)連接反應液添加量不應該超過感受態細胞體積的10%,不推薦體系中加入過量的T4 DNA Ligase;
3)與T4 DNA Ligase結合的DNA可能會在瓊脂糖凝膠中出現帶移或彌散,為了避免此現象,可以在上樣前對酶進行熱失活,必要時加入適量的SDS;
4)聚乙二醇(PEG)能極大地提高平末端連接的連接效率,PEG8000的推薦添加量是連接體系的5%(w/v);
5)電轉化效率可能通過對T4 DNA Ligase熱失活或者使用離心柱或者氯仿抽提純化DNA方式來提高;
6)轉化子數目可通過延長反應時間至1h而增加。