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GFP-Nanoab-Agarose
貨號:GNA-25-500/GNA-50-1000/GNA-500-10K
儲存條件:可在4℃保存1年,或在-80℃長期保存,避免反復凍融。
產品描述
偶聯anti-GFP納米抗體的瓊脂糖珠子用于免疫沉淀GFP融合蛋白。
產品優勢
沒有普通抗體的輕鏈和重鏈;
高親和力:解離常數達到pM級別;
高載量:10μl的slurry可以結合2-4μg GFP蛋白;
較短的孵育時間,結合5-30min即可;
應用范圍
可用于免疫沉淀(IP)/免疫共沉淀(CoIP)、染色質免疫沉淀(ChIP)/RNA結合蛋白免疫沉淀(RIP)、酶活性測定、質譜分析等;
特異性
可以結合GFP、EGFP、YFP和EYFP等。
產品特性
存儲緩沖液:PBS(含有20%乙醇)。
實驗步驟:
收集細胞:
每個免疫沉淀反應大約使用 106-107 個表達綠色熒光蛋白融合蛋白的細胞,可根據綠色熒光蛋白融合蛋白表達量適當調整細胞數。吸出培養基,向培養皿中加入預冷的1×PBS,漂洗2次,利用細胞刮或yi酶消化收集貼壁細胞,細胞轉移到離心管,500g離心3分鐘并丟棄上清液。
植物組織裂解處理:
取適量植物組織樣本(葉片等)放置于冷凍液氮中,之后將冷凍后得植物組織樣本放于研缽進行研磨,盡可能充分研磨破壞其細胞壁。加入500-1000ul RIPA 裂解液(需加蛋白酶抑制劑)進行裂解,為了提高裂解效率,可加入200ul 玻璃粉充分震蕩 30min,裂解完成后12000 rpm,離心30min,吸取上清置新的離心管中,棄去沉淀。
動物細胞裂解:
1.在裂解緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,用500μl預冷的裂解緩沖液重懸細胞。
2.置于冰上30分鐘,可每10分鐘充分吹打一次。
3.4℃,20,000g離心15分鐘,將裂解產物(上清)轉移到一個新的預冷管中,丟棄沉淀。注意:此時細胞裂解產物可長期保存于-80℃。
平衡珠子:
4.振蕩充分混勻GFP-Nanoab-Agarose, 吸取20μl該產品到500 μl預冷的裂解緩沖液中,4℃,2,500g離心2分鐘,丟棄上清液。(此步驟可選)
結合蛋白
5.將平衡好的GFP-Nanoab-Agarose加入到細胞裂解產物中(如果未做第4步,可在細胞裂解產物中直接加入20μl該產品),于4℃旋轉混合結合5-30min。如果需要,留存50μl的裂解產物進行免疫印跡分析。
6.4℃,2,500g離心2分鐘,丟棄上清液。如果需要,留存50μl上清液進行免疫印跡分析。
清洗珠子:
7.用500μl預冷的裂解緩沖液中重懸6中的GFP-Nanoab-Agarose,4℃,2,500g條件下離心2分鐘,丟棄上清液并重復洗滌2次。
洗脫蛋白:
方法一:
8.加入20μl 2×SDS-sample buffer重懸GFP-Nanoab-Agarose。95℃,加熱10min,2,500g離心2分鐘收集上清,收集的產物可進行SDS-PAGE及免疫印跡分析。
方法二:
9.替代步驟8的可選步驟:加入50μl 0.2 M pH2.5的gan氨酸洗脫結合的蛋白,孵育時間30秒,期間不斷混勻,2,500g離心2分鐘收集上清,為了中和酸性的gan氨酸,需加入5μl 1.0 M Tris(pH10.4)。注意:為了提高洗脫效率可以重復這一步。
可選方案
方案一:
如需進行GFP融合酶的活性檢測,無需洗脫,可以直接檢測。
方案二:
如需進行染色質免疫沉淀(ChIP)實驗,主要用于含有GFP融合蛋白的蛋白質/DNA相互作用的實驗。染色質免疫沉淀一般包括細胞固定,染色質斷裂,染色質免疫沉淀,交聯反應的逆轉,DNA的純化以及DNA的鑒定。其中前期細胞固定,染色質斷裂不變;然后接著直接進入說明書的第5步,加入細胞裂解產物后,DNA-蛋白質復合物結合到GFP-Nanoab-Agarose上;
進入第6和7步,分離得到復合物;進入第10步,得到洗脫的復合物;后期交聯反應的逆轉,DNA的純化及DNA的鑒定等同于普通的ChIP實驗。RNA結合蛋白免疫沉淀(RIP)實驗步驟同上。
方案三:
GFP-Nanoab-Agarose 不僅可以用于在體內外檢測和驗證蛋白質之間的相互作用, 也可以結合質譜分析篩選與已知蛋白相互作用的未知蛋白。其操作步驟同免疫沉淀法,得到洗脫的復合物后,然后進行SDS–PAGE分析,用考馬斯亮藍或者銀染的方法染色后,切下未知蛋白的條帶,用質譜技術鑒定未知蛋白。
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