本文介紹一下用勻漿器研磨法提取貼壁細胞核蛋白的具體操作。
一、前期準備
1、臺盼藍染液:
取臺盼藍粉劑,將其溶解在10mL的雙蒸水當中配制成質量體積比為4%(4%w/v)的臺盼藍母液。在使用時,利用PBS緩沖液將母液稀釋10倍,使其濃度達到0.4%,之后再與細胞懸液混合均勻。
2、BufferA:
包含10mmol/L的HEPES(在4℃下pH值為7.9)、1.5mmol/L的氯化鎂、10 mmol/L的KCL、0.5mmol/L的二硫蘇糖醇(DTT)。若擔心漿蛋白降解會對核蛋白產生影響,可以添加1mmol/L的PMSF。
3、BufferB:
含有20mmol/L的HEPES(pH值為7.9)、體積分數為25%的甘油、0.42mol/L的氯化鈉、1.5mmol/L的氯化鎂、0.2mmol/L的乙二胺四乙酸(EDTA)、0.5mmol/L的PMSF、0.5mmol/L的二硫蘇糖醇(DTT)。
二、具體步驟
1、使用胰酶將貼壁細胞消化下來,把這些細胞收集到1.5mL EP管中。4℃以300g的離心力離心5min。離心完成后,用PBS緩沖液對細胞進行洗滌(2次)。
2、棄上清,加入體積為細胞沉淀5倍的預冷Buffer A(每20μL的細胞沉淀加入100μL的Buffer A),之后輕輕吹打,使細胞在Buffer A中重新懸浮。
3、將上述細胞懸浮液在冰上放置10min,隨后再次在4℃條件下,以300g的離心力離心5min。離心結束后,加入體積為其25倍的預冷Buffer A,并通過吹打操作讓細胞重新懸浮。
4、把經過上述處理后的細胞懸液轉移勻漿器中,準備進行勻漿操作。
5、在勻漿過程中,取出少量的細胞懸液,與等體積的0.4%臺盼藍染液混合均勻,接著在顯微鏡下觀察細胞的破膜情況。如果觀察到大部分細胞都被染成了藍色,就停止勻漿操作;要是大部分細胞未被染成藍色,則繼續進行勻漿。
6、當大部分細胞的細胞膜被破壞后,將細胞懸液轉移至Eppendorf管中,然后在4℃環境下,以25000g的離心力離心20min。
7、離心結束后,現在上清液中包含的是細胞裂解物中的胞漿成分,沉淀部分則是核蛋白。
8、收集離心后的沉淀,向其中加入與沉淀等體積的預冷Buffer B,然后輕輕地吹打,使沉淀呈現懸浮狀態。接著將懸浮液轉移到干凈的組織勻漿器中,以均勻的力度進行30次勻漿操作。
9、把經過勻漿的懸浮液轉移到Eppendorf管中,放在冰上的低速搖床上振蕩45min。
10、在4℃條件下,以25000g的離心力離心30min,收集得到的上清液即為細胞核蛋白
11、提取核蛋白后,可使用一些核蛋白(如H3蛋白、Lamin蛋白)作為對照蛋白,進行WB驗證。
注:全部步驟均需于冰上操作。
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