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干細胞轉染及基因編輯,一篇講透!
目前有多種方法可以將基因導入真核細胞內,一般可分為病毒類載體技術和非病毒類載體技術,后者具有低毒性和低免疫反應的特點,且不受細胞或種屬特異機制和導入片段大小等限制的優(yōu)勢。其中,電穿孔法以其較高的轉染率而備受關注。電穿孔法是應用短暫的高壓電流脈沖誘導活細胞產生跨膜電位,由于外加電場強度大于細胞膜穿孔的臨界值,引起細胞質膜結構暫時性改變,形成納米級微孔,DNA等外源物質通過這些微孔進入細胞質或細胞核。
大多數(shù)細胞通過傳統(tǒng)轉染技術就可以提高轉染效率,而原代細胞、免疫細胞、神經細胞、干細胞等難以通過傳統(tǒng)方法獲得高轉染效率,成為困擾科研人員的難題。NEPA GENE公司在細胞轉染和融合領域擁有超過二十年的研究經驗,其代表產品NEPA21高效基因轉染系統(tǒng)自上市以來受到了國內外眾多科學家的青睞。在干細胞轉染方面,如iPS、ESC、HSC和MSC等細胞,NEPA21均被研究者們用于轉染實驗中,積累了豐富的轉染條件、細胞轉染效率和基因編輯效率等寶貴的經驗和數(shù)據(jù)。
案例一 使用NEPA21電轉染儀將mRNA導入hESC
參考文獻:Gene Manipulation of Human Embryonic Stem Cells by In Vitro-Synthesized mRNA for Gene Therapy
轉染物質:GFP / DsRed mRNA
電轉參數(shù):電壓125V(文中只寫明電壓,詳細參數(shù)可咨詢)
在本研究中,作者通過體外轉錄合成多種類型的mRNA,使用NEPA21電轉儀將其導入到hESC中,以研究mRNA在hESC中的轉染效率和誘導蛋白表達的時間(圖1)。同時,為了保證轉染效率對HN4細胞系不具有特異性,作者對多種hESC細胞系和iPS的轉染效率進行了比較。在電穿孔24h后,F(xiàn)CAS分析顯示,GFP mRNA在HN4、NS1、NS2和iPS中表達量均在95%以上(圖1)。
圖1 電穿孔24h后,GFP在不同細胞系中的轉染效率
在電穿孔后,是否能維持胚胎干細胞的多能性仍需要進一步的檢測。在此,研究人員通過免疫熒光法檢測了兩種常見的標志基因(Oct4和SSEA4)。結果顯示,轉染24h后,大多數(shù)表達GFP的細胞仍然呈Oct4陽性和SSEA4陽性。
圖2 電穿孔24h后,HN4細胞中Oct4和SSEA4基因的表達
此外,研究人員還證明采用電穿孔法可以有效地將GFP和DsRed mRNA共轉染至HN4細胞中(圖3)。
圖2 GFP和DsRed mRNA共轉染
案例二 使用NEPA21進行iPSC電轉及基因編輯(CRSIPR/TALENs)
參考文獻:
1.Precise correction of the dystrophin gene in duchenne muscular dystrophy patient induced pluripotent stem cells by TALEN and CRISPR-Cas9.
2. Efficient genomic correction methods in human iPS cells using CRISPR–Cas9 system
轉染物質:EGFP質粒、敲除實驗(TALENs: 5μg left + 5μg right或CRISPR: 5μg Cas9 + 5μg sgRNA)、敲入實驗(5μg donor vector + TALENs(5μg left + 5μg right)或CRISPR(5μg Cas9 + 5μg sgRNA))
電轉參數(shù):電壓125V、脈沖時長5ms、脈沖次數(shù)2
為了在iPS細胞中獲得最高的質粒轉染效率,研究人員使用EGFP質粒轉染了3種iPS細胞系(201B7、404C2、DMD-iPSC),優(yōu)化脈沖電壓、脈沖時間等轉染條件。結果如下圖所示:
圖4 iPSC轉染條件優(yōu)化
使用NEPA21優(yōu)化轉染條件之后,通過TALEN和CRISPR兩種方法對iPSC的DMD基因進行敲除和敲入實驗,基因編輯效率如下:
Knockout:
圖5 iPSC基因敲除效率
Knockin:
圖6 iPSC基因敲入效率
案例三 使用NEPA21進行HSC轉染條件優(yōu)化及基因編輯(CRISPR)
參考文獻:Non-viral ex vivo genome-editing in mouse bona fide hematopoietic stem cells with CRISPR/Cas9
轉染質粒:CRISPR/RNP
電轉參數(shù):穿孔參數(shù)(電壓100V、脈沖時長5ms、脈沖次數(shù)8)、轉移參數(shù)(電壓10V、脈沖時長50ms、脈沖次數(shù)5),本文使用1mm間隔電轉杯
在這項研究中,研究者旨在通過連續(xù)移植來評估真正的HSCs的基因組編輯效率。為了避免病毒整合到HSC基因組中,采用了非病毒轉染方法(電穿孔)來編輯小鼠HSC的基因組。首先通過電穿孔將Cas9/RNP轉移到體外的HSC中,隨后通過三次細胞移植來檢驗真正的HSC的敲除效率。此外,通過基因插入,還成功地證明了對小鼠HSCs中X-SCID突變的基因校正,從而治愈了小鼠。
研究人員首先以GFP為報告基因,通過NEPA21在小鼠骨髓系陰性細胞(Lin-)中優(yōu)化了電穿孔條件,并通過GFP熒光和7-氨基-放線jun素D(7-AAD)染色檢測細胞轉染效率和細胞存活率。結果顯示,在電壓100V、脈沖時間5ms、脈沖次數(shù)8次的電轉條件下,細胞轉染效率>60%,存活率>50%,可作為后續(xù)實驗的電穿孔參數(shù)(圖7)。
圖7 HSC轉染效率
隨后,將針對Itga2b基因外顯子1和2的RNP復合體電穿孔轉染至Lin-細胞。在體外培養(yǎng)1~2周后,通過Surveyor實驗檢測到Itga2b外顯子1和2的突變,并且將基因編輯后的Lin-細胞通過連續(xù)移植后仍能檢測到15%定點突變效率,證明了基因編輯發(fā)生在真正的HSC中(圖8)。
圖8 在HSC中敲除Itga2b結果
為了恢復X-SCID小鼠的IL2RG基因功能,研究者采取了基于NHEJ和同源無關的靶向整合(HITI)的策略,將IL2RG外顯子2-8(HITI-cDNAex2-8)整合到IL2RG的內含子1。他們先在NIH3T3細胞中測試了該方法,通過NEPA21電轉儀導入IL2RG內含子1的gRNA與Cas9(Cas9/RNP-Il2rgin1),在NIH 3T3細胞中有效地產生了43.1%的突變。基于此,進一步檢測了在Lin-細胞中的基因插入效率,通過Surveyor分析和擴增序列測定,細胞基因突變效率為20.2%(圖9)。
圖9 在HSC中對IL2RG基因插入結果
本文中提到,Cas9/RNP通過電穿孔到造血干細胞,可以不使用任何病毒載體,基因編輯技術為基因位點的特異性修飾提供了可能。非整合病毒如腺病毒或腺相關病毒(AAV)經常被用來傳遞CRISPR/Cas9,但它們會在宿主中激發(fā)對組成性表達的Cas9的免疫反應。相反,Cas9/RNP在轉導細胞中迅速降解,從而逃避宿主的免疫反應,更重要的是,電穿孔與其他傳遞方法相比,產生的脫靶DSB更少。
案例四 使用NEPA21電轉MSC的最佳條件
參考文獻:電穿孔法轉染臍帶華通膠間充質干細胞的最佳條件
轉染物質:EEV-EGFP質粒
電轉參數(shù):電壓150V、脈沖時長5ms、脈沖間隔50ms、脈沖次數(shù)2
本文采用電穿孔法將質粒EEV-EGFP轉入華通膠間充質干細胞(WJ-MSC),并通過流式細胞儀檢測轉染率,以探討不同電穿孔條件對WJ-MSC轉染效率的影響,確定最佳電轉染條件。
研究人員測試了不同電壓(125,130,140,150,170V)、不同脈沖時間(2.5,5.0,7.5ms)、不同細胞狀態(tài)(體積分數(shù)為20%正常氧、體積分數(shù)為5%低氧)對WJ-MSC電轉染效率的影響。電穿孔后48h進行檢測,轉染質粒攜帶EGFP綠色熒光標簽,轉染成功的WJ-MSC將表達綠色熒光蛋白,使用流式細胞儀檢測熒光表達率。
結果表明,正常培養(yǎng)的WJ-MSC在電壓150V、脈沖時長5.0ms、脈沖間隔時間50ms、脈沖數(shù)2次時可達到較高的電轉染率。
圖10 不同轉染條件下WJ-MSC的轉染效率
總結
較高的電穿孔條件可以更有效地編輯基因組,但會對細胞造成較大損傷,而較弱的電轉染條件對細胞更溫和,但細胞轉染效率和編輯效率可能較低。因此,為基因組編輯效率和細胞活力找到一個可接受的條件是十分重要的。NEPA21采用全新四步法電轉程序,可對細胞穿孔模式和基因轉移模式中的所有參數(shù)進行單獨設置(電壓、脈沖時長、脈沖間隔、脈沖次數(shù)和衰減比例),非常有利于難轉染細胞的參數(shù)優(yōu)化,提高轉染效率。
NEPA21高效基因轉染系統(tǒng)采用全新設計的電轉程序,配合電壓衰減設計,在獲得高轉染效率的同時,提高細胞存活率。操作簡單,電轉參數(shù)可見可調,適用性強。特別適用于難轉染的原代免疫細胞、干細胞、神經細胞、外泌體、類器官、活體動物、受精卵及宮內胚胎等的轉染,已應用于眾多著名期刊文獻中,是進行細胞懸浮/貼壁狀態(tài)、活體和離體組織轉染的電轉系統(tǒng)主流品牌之一。
本文引用的案例均為已發(fā)表文獻,想了解NEPA21更多應用案例或實驗細節(jié)可咨詢。
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