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超凈工作臺(tái)的原理是，在某一的空間中，室內(nèi)空氣先通過(guò)預(yù)過(guò)濾器初步過(guò)濾，再由小型離心風(fēng)機(jī)壓入靜壓箱，然后通過(guò)空氣高效過(guò)濾器完成二次過(guò)濾，此時(shí)，從空氣高效過(guò)濾器出風(fēng)面吹出的潔凈氣流具有均勻的斷面風(fēng)速，可以將工作區(qū)域中的原始空氣排除，并去除灰塵顆粒和生物顆粒，從而形成高度清潔和無(wú)菌的工作環(huán)境。空氣被過(guò)濾器過(guò)濾以達(dá)到無(wú)菌狀態(tài)，并被輸送到操作空間以便在操作空間中形成相對(duì)正壓。如果不打開(kāi)風(fēng)機(jī)，就不會(huì)有無(wú)菌的空氣輸送，操作空間也就無(wú)法達(dá)到無(wú)菌效果。

在超凈工作臺(tái)的使用過(guò)程中，需要通風(fēng)。隨著風(fēng)機(jī)的轉(zhuǎn)動(dòng)，風(fēng)通過(guò)高效過(guò)濾膜（無(wú)）進(jìn)入，使操作臺(tái)保持在無(wú)菌狀態(tài)。超凈工作臺(tái)的功能是提供相對(duì)無(wú)菌的環(huán)境，其設(shè)計(jì)和實(shí)用原理有兩種，一種是頂部或側(cè)面無(wú)菌空氣過(guò)濾裝置，內(nèi)部有幾層無(wú)菌空氣過(guò)濾器，吹出來(lái)的風(fēng)是相對(duì)無(wú)菌的空氣。由無(wú)菌空氣過(guò)濾裝置吹出的無(wú)菌空氣確保了超凈工作臺(tái)的內(nèi)部在操作過(guò)程中是相對(duì)無(wú)菌的。
然而，紫外線燈照射主要是在開(kāi)始操作之前的準(zhǔn)備工作，或是對(duì)要使用的設(shè)備和器械的表面進(jìn)行消毒的方法，紫外線照射的滅菌效果基本上可以忽略不計(jì)。通常，在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中不會(huì)同時(shí)打開(kāi)風(fēng)機(jī)和紫外線燈。只需先打開(kāi)紫外線燈照射一段時(shí)間后，關(guān)閉紫外線燈，打開(kāi)風(fēng)扇機(jī)吹半小時(shí)左右，然后再開(kāi)始實(shí)驗(yàn)。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中，風(fēng)機(jī)應(yīng)一直保持開(kāi)啟狀態(tài)。

打開(kāi)風(fēng)機(jī)的目的是在操作臺(tái)內(nèi)形成正壓，以防止周?chē)臻g的空氣隨氣流進(jìn)入操作臺(tái)。因?yàn)榭諝庵锌赡芎袕亩绊憣?shí)驗(yàn)結(jié)果，因此須打開(kāi)風(fēng)機(jī)。風(fēng)機(jī)的風(fēng)用于凈化空氣，凈化后的氣流可以防止人員污染操作對(duì)象。

超凈工作臺(tái)的風(fēng)是向外吹的，主要作用是防止空氣中的進(jìn)入。如果超凈工作臺(tái)的玻璃已經(jīng)關(guān)閉了，則無(wú)需打開(kāi)風(fēng)機(jī)。