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博卓生物科技(上海)有限...

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KUBTEC種子育種篩選分析功能

閱讀:1685      發布時間:2023-10-23
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KUBTEC種子育種篩選分析功能

 

食品安全是未來幾十年的一大挑戰。隨著人口的迅速增長,對食物的需求也在增加。為了解決這個問題,需要在植物育種方面取得進展,以改善植物品種。植物育種被稱為操縱植物物種,以改變植物的特征,以創造具有理想特性的新種子。利用先進的技術可以很容易地收集植物物種的基因型,但表型分析仍處于起步階段。基因型是細胞的遺傳結構,表現型是指生物體的物理特征或特性。表型[2]是生物體基因序列、基因型和環境影響的基因表達的結果。基本上,不同的表型可以存在于同一種物種中。在過去的10年里,基因組數據已經大大增加,而確定相應表型的方法卻很少。雖然基因組數據廣泛可用,但有助于研究基因組功能以選擇育種計劃的相應表型仍然是被動的,特別是從育種計劃的田間試驗中收集的表型[1]。在收集相應表型的模型方面幾乎沒有任何進展。這導致了連接基因型和表型的數據集的不平衡。在植物育種計劃中,對表型測定領域的進步的需求一直在升級。因此尋求融合當代圖像處理和機器視覺的進展,有效收集精確的表型數據,以破譯植物基因組和推進植物育種[1]。該研究是美國國家科學基金會(NSF)農業發展基礎研究(BREAD)項目BreadPheno的一部分。

X射線成像在農業種子和林業篩選中有多種應用。以下是一些常見的應用領域:

 

種子質量評估:X射線成像可以用于評估種子的質量,包括檢測種子的內部結構、內部缺陷和病蟲害感染情況。通過觀察種子的內部圖像,可以判斷種子的健康狀況和萌發潛力。

 

種子萌發測試:通過使用X射線成像技術,可以觀察種子在不破壞外殼的情況下的萌發過程。這有助于評估種子的萌發率和萌發速度,并為農民或種子生產商提供種子質量的重要信息。

 

林木品質評估:在林業中,X射線成像可用于評估樹木的品質和內部結構。通過掃描樹干、根部和樹木切片,可以檢測木材的缺陷、質量和穩定性,以支持木材選擇、加工和用途。

 

病蟲害檢測:X射線成像還可以用于檢測和診斷農作物和林木中的病蟲害。通過掃描受感染植物部分的X射線圖像,可以觀察和分析病蟲害的影響范圍和嚴重程度。

 

 

 

種子軟件分析軟件功能-KUBTEC種子分析功能





原始圖片

1. 可以自動識別種子,勾畫輪廓,判斷種子發育狀態,多種參數:包括種子ID,種子周長Perimeter,種子輪廓C,種子半長軸L,種子半短軸S,種子面積A,種子密度D等多種參數,可以選擇任意兩參數作為分析的關鍵因素作圖分析

圖片2.png



此處根據種子的半長軸L及半短軸D作散點圖,可以認為周長在100左右,短半軸S在(15:18)長半軸L在(38:40)左右時,面積A在(400-550)時,紅色點處種子處于初始狀態,未見發芽

【圖片來自博卓生物

2. 可以一鍵生成散點圖,單擊定位種子狀態,散點圖與原始圖片結合

圖片中綠色點短半軸S在(2023)顯示種子開始膨脹,但此時出芽不夠明顯長半軸L(33:40)區間,顯示剛剛萌芽狀態

【圖片來自博卓生物

 

3. 可以預覽散點圖上每個種子的形態狀況

4. 可以對種子形態進行無限分群分類分析,并保存分類結果與圖片,由此判斷種子發育發展階段

5. 可以對種子進行色彩分析育種狀態


6. 可以對種子進行計數分析


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