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肺炎鏈球菌(SP)熒光PCR試劑盒說明書
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上海晅科生物科技有限公司
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【產(chǎn)品名稱】
商品名稱:肺炎鏈球菌(SP)核酸檢測(cè)試劑盒(熒光 PCR 法)
Name:Streptococcus pneumoniae Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包裝規(guī)格】25T/盒、50T/盒
【預(yù)期用途】
肺炎鏈球菌(Streptococcus pneumoniae, SP)可定植與呼吸道粘膜,當(dāng)呼吸系統(tǒng)防御功能及肺部正常清除功能受損時(shí),可引起呼吸系統(tǒng)疾病。各個(gè)年齡段人群都可能受感染,2 歲以下的幼兒最容易罹患。臨床對(duì)獲得肺炎患者診斷的金標(biāo)準(zhǔn)是細(xì)菌培養(yǎng)鑒定,但耗時(shí)長(zhǎng),繁瑣。熒光 PCR 技術(shù)為肺炎鏈球菌提供了快速而敏感的診斷方法,解決了傳統(tǒng)方法的不足。
本試劑盒適用于檢測(cè)患者痰、咽拭子等樣本中的肺炎鏈球菌,用于肺炎鏈球菌感染的輔助診斷。
【檢驗(yàn)原理】
本試劑盒采用 TaqMan 探針法實(shí)時(shí)熒光 PCR 技術(shù),設(shè)計(jì)一對(duì)肺炎鏈球菌特異性引物,結(jié)合一條特異性探針, 用熒光 PCR 技術(shù)對(duì)肺炎鏈球菌的 DNA 進(jìn)行體外擴(kuò)增檢測(cè),用于科研實(shí)驗(yàn)中對(duì)可疑感染病料的病原學(xué)檢測(cè)。
【試劑組成】
包裝規(guī)格25T/盒50T/盒
SP 反應(yīng)液500μL×1 管500μL×2 管
酶液25μL×1 管50μL×1 管
SP 陽性質(zhì)控品250μL ×1 管250μL ×1 管
陰性質(zhì)控品250μL ×1 管250μL ×1 管
說明:不同批號(hào)的試劑盒組分不可交互使用
【儲(chǔ)存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運(yùn)輸、反復(fù)凍融次數(shù)不超過 5 次,有效期 12 個(gè)月。
【適用儀器】
ABI7500、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測(cè)儀。
【標(biāo)本采集】
采集病人痰液或咽拭子標(biāo)本,咽拭子應(yīng)使用專用采樣拭子,適度拭抹咽后壁和兩側(cè)扁桃體部位,應(yīng)避免觸及 舌部;迅速將拭子放入標(biāo)本采集管中,旋緊管蓋并密封,以防干燥。
【保存和運(yùn)輸】
采集或處理好的樣品在 2℃~8℃條件下保存應(yīng)不超過 24 h;若需長(zhǎng)期保存,應(yīng)放置-70℃以下保存,凍融不超過 3 次。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
取痰或咽拭子拭子 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中。
1.2核酸提取
推薦采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的核酸提取試劑(離心柱法)進(jìn)行核酸提取,請(qǐng)按照試劑說明書進(jìn) 行操作。
2.試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
根據(jù)待檢測(cè)樣本總數(shù),設(shè)所需要的 PCR 反應(yīng)管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對(duì)照+1 管陽性對(duì)照;反應(yīng)管數(shù)每滿 10 份,多配制 1 份),每測(cè)試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑SP 反應(yīng)液酶液
用量(樣本數(shù)為 N)19μL1μL
將混合好的測(cè)試反應(yīng)液分裝到 PCR 反應(yīng)管中,20μL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的核酸、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 5μL,分別加入相應(yīng)的反應(yīng)管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR 擴(kuò)增(核酸擴(kuò)增區(qū))
4.1將待檢測(cè)反應(yīng)管置于熒光定量 PCR 儀反應(yīng)槽內(nèi);
4.2設(shè)置好通道、樣品信息,反應(yīng)體系設(shè)置為 25μL;
熒光通道選擇: 檢測(cè)通道(Reporter Dye)FAM,淬滅通道(Quencher Dye)NONE,ABI 系列儀器請(qǐng)勿選擇 ROX
參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設(shè)置:
步驟循環(huán)數(shù)溫度時(shí)間收集熒光信號(hào)
11 cycle95℃2min否
245cycles95℃15sec否
60℃30sec是
5.結(jié)果分析判定
5.1結(jié)果分析條件設(shè)定(請(qǐng)參照各儀器使用說明書進(jìn)行設(shè)置,以分析 ABI7500 儀器為例)
反應(yīng)結(jié)束后自動(dòng)保存結(jié)果,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)Baseline 的 Start 值、End 值以及 Threshold 值(用戶可根據(jù)實(shí)際情況自行調(diào)整,Start 值可設(shè)在 3~15、End 值可設(shè)在 5~20,使閾值線位于擴(kuò)增曲線指數(shù)期,陰性質(zhì)控品的擴(kuò)增曲線平直或低于閾值線),點(diǎn)擊 Analyze 自動(dòng)獲得分析結(jié)果。
5.2結(jié)果判斷
陽性:檢測(cè)通道 Ct 值≤40,且曲線有明顯的指數(shù)增長(zhǎng)曲線; 陰性:樣本檢測(cè)結(jié)果無 Ct 值,且無特異性擴(kuò)增曲線;
可疑:樣本檢測(cè)結(jié)果 40<Ct 值≤45,建議重復(fù)檢測(cè),如果檢測(cè)通道仍為 40<Ct 值≤45,且曲線有明顯的增長(zhǎng)曲線,判定為陽性,否則為陰性。
5.3質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
陰性質(zhì)控品:無特異性擴(kuò)增曲線或無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴(kuò)增曲線有明顯指數(shù)增長(zhǎng)期,且 Ct 值≤32; 以上條件應(yīng)同時(shí)滿足,否則實(shí)驗(yàn)視為無效。
6.檢測(cè)方法的局限性
1.樣本檢測(cè)結(jié)果與樣本收集、處理、運(yùn)送以及保存質(zhì)量有關(guān);
2.樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會(huì)出現(xiàn)假陽性結(jié)果;
3.陽性對(duì)照、擴(kuò)增產(chǎn)物泄漏,會(huì)導(dǎo)致假陽性結(jié)果;
4.病原體在流行過程中基因突變、重組,會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
5.不同的提取方法存在提取效率差異,會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果;
6.試劑運(yùn)輸,保存不當(dāng)或試劑配制不準(zhǔn)確引起的試劑檢測(cè)效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測(cè)不準(zhǔn)確的結(jié)果;
7.本檢測(cè)結(jié)果僅供參考,如須確診請(qǐng)結(jié)合臨床癥狀以及其他檢測(cè)手段。
【注意事項(xiàng)】
1.所有操作嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行;
2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化,完-全混勻并短暫離心;
3.反應(yīng)液應(yīng)避光保存;
4.反應(yīng)中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)專用工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進(jìn)行,以免交叉污染;
7.實(shí)驗(yàn)完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺(tái)和移液器;
8.試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對(duì)待,并按照《微生物生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通則》進(jìn)行處理。
【參考文獻(xiàn)】
[1]顏善活, 孫雷, 符可鵬, 等. 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 快速診斷肺炎鏈球菌[J]. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué),2013. [2]吉林省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局. DB22/T 2567-2016 肺炎鏈球菌核酸檢測(cè) PCR 法[S].