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吲哚-3羧酸酯及其類植物生長素衍生物的流動合成
【英國杜倫大學案例】吲哚-3羧酸酯及其類植物生長素衍生物的流動合成
吲哚類化合物是色氨酸（1）、相關的神經遞質血清素（2）以及許多復雜的生物堿天然物質和藥物中常見的重要的生物活性雜環結構之一。吲哚類植物激素在促進和調節植物生長發育方面也發揮著重要作用。的確，80%的植物自身合成的生長激素含有吲哚結構（圖1，結構3-7）。由于它們的調節活動，這些結構已成為研究促進植物生長以及目標植物的生長抑制作用產生新型農用除草劑的主要目標。近的一項合作研究了合成的吲哚-3-乙酸類似物在闊葉植物（雙子葉植物）中的吸收及其分布，需要大量制備結構8（圖1），以進行大規模的田間試驗。此外，由于氣候模式和環境問題對這類研究所需物質的時間安排和終數量有重大影響，因此，人們還認為，能夠使用靈活尺度的流動化學方法按需生產是非常可取的。
圖1
自1835年費希爾合成吲哚類化合物的報告以來，又有十幾種*的吲哚類化合物被報道出來，顯示出在這些有價值的結構中開發新化合物的重要性。然而，大多數吲哚類物質合成的共同特點是需要使用有害物質，如肼（Fischer）、重氮類化合物（Japp Klingemann）或疊氮化物（Hemetsberger Knittel），或者在吲哚環形成之前必須在多步反應中構建特定功能的前體。為了克服這些潛在的缺點，Marcus Baumann及其團隊開始開發一種良性的工藝，依靠廉價的底物和無毒的試劑，用一種容易擴大且連續的方式迅速合成所需的吲哚。
為了通過穩健的合成步驟生成核心吲哚單元，University of Durham化學系的Ian R. Baxendale教授團隊決定研究以氰乙酸乙酯（10）為親核試劑，在堿介導的SNAr反應中處理2-氯硝基苯9（Scheme1）。所得到的加合物11將在非均相氫化條件下，通過還原環化步驟生成吲哚產物12。從相應的酯功能化吲哚12，預期與肼縮合會得到相應的酰肼13，其可通過活性羰基供體的作用如CDI（1, 1-羰基二咪唑）或三光氣（雙（三氯甲基）碳酸酯）環構化得到所需的產品8。這種合成策略具有多種優勢，因為它依賴于現成的底物和試劑，產生少量無毒副產物（堿?HCl、H2O），并在關鍵的環構化步驟中使用工業上較友好的加氫工藝。相關成果喜人，并于2017年發表在《BeilsteinJournal of Organic Chemistry》雜質上（Beilstein J. Org. Chem. 2017, 13, 2549–2560）。
為了開始這項研究，作者首*行了一個全面的篩選流程，以確定形成化合物11的流動兼容性條件。對溶劑、堿、溫度和試劑化學計量比的優化選擇結果如表1所示。
表1
雖然DMF和乙腈是很好的反應溶劑（表1，第3，6，10，15，23和26項），但在淬滅反應（1 M HCl）后有效地提取產品上遇到了困難。乙酸乙酯性能優異，可使萃取非常容易，但在反應過程中觀察到少量暗紅色且粘稠的沉淀物（表1，第12項）。在中試尺度的流動反應器工藝中這被認為是有問題的，因為可能造成堵塞。然而，研究發現，添加10~20% v/v的乙腈可以保證溶液*均勻，也可以進行簡單的水萃取，回收率較高（>90%）。然而，從初步結果來看，DCM是有效的溶劑（表1，第7、24和25項），允許0.25 M的底物9的溶液在50℃時用TMG或DBU（2.5當量）和氰乙酸乙酯（10，1.1當量）進行定量轉化。
基于這些篩選結果，作者設計了一個簡單的流動裝置，兩股預備的原料液在一個簡單的T型混合器中匯合，隨后直接到一個維持在50℃的加熱的流動線圈反應器中（Scheme 2）。迅速形成的深紅色溶液（SNAr離子加合物）在保溫周期（35 -108 min）后使用在混合后的混合物相分離之前，通過的混合芯片進行混合的第三股物料鹽酸（1 M）淬滅。
為了使相分離成為可能，作者使用了一個基于改進的Biotage通用分離器的被動膜系統。這使得較重的氯化物相可以從較低的連接處去除，較輕的水相可以從溢流位置流出。當從主反應器流出的流量為0.5-1.2 mL/min時，該裝置可靠地進行了良好的淬滅和分離。然而，在高流速下產生了兩相混合物的不*分離（有些乳液形成），導致產品中的物質向水中流失從而造成損失，這是由于在較高的流速下在線攪拌芯片產生了較大的剪切力，以及形成高度柱塞流所需要的穩定時間更長。這個問題可以通過將水從個分離器引出到第二個等效裝置，或者簡單地通過兩個平行分離器將原來的淬滅流股分開來解決。雖然這些方法在設計或使用分離器組件時不是優的，但在功能上是可行的。因此，作者還研究了用各種配置的T型和Y型連接器替換有問題的混合芯片，但這立即帶來了其他問題，因為不*淬滅導致了產品回收不良和相關的污染。一種更直接的方法是在分離器之前引入一個流動分層區，這是通過簡便地引入一段內徑更寬的管（從內徑1.6 mm→4.0 mm×20 cm的反應器擴展而來）來實現的。這使得反應器可以通過2.0 mL的流量（對于1.0 mL以上的流量，則向系統中添加第二個52 mL的流動盤管）成功地在線淬滅反應，然后由單個Biotage通用分離器依次處理。在所有情況下，主反應器的出料都顯示出定量轉化，只有在溶劑蒸發后產品被分離出來。反應器流出速率為1.8 mL/min，這使得在穩態條件下的大吞吐量達到27 mmol/h。
盡管該反應器功能多樣，但其生產效率低于理想要求，不幸的是，DCM被證明對以下氫化步驟是一個不兼容的溶劑。雖然溶劑交換是可能的，但作者確定，當乙氧基乙酸作為溶劑并在乙酸作為添加劑存在下用乙醇稀釋時，可使吲哚的還原環構化得以成功進行。在此基礎上，研究了乙酸乙酯中中間體11的放大反應。在之前成功使用Coflore，AM技術公司ACR設備處理流動泥漿后，作者決定在合成中使用該設備來克服在溶解性方面遇到的問題。
起始物料用乙酸乙酯中分別儲備的料液來制備，而后混合，首先是堿和氰乙酸乙酯（10）在芳氯9的溶液匯合前混合（注意這是一個放熱過程），然后進入ACR，振動頻率設置為8 Hz（Scheme 3）。
為了加強這一過程，并以減少溶劑量為具體目標，以便在隨后的還原步驟（乙醇稀釋后）中保持一個可行的反應濃度，作者進行了一系列濃度和流速優化。終發現，在3 mL的混合流速下，相當于停留時間約為30 min，反應器溫度為65℃，能夠實現1.5 M底物9溶液的定量轉化。連續運行時，反應器的出料為暗紅色懸浮液，其中包括體積分數約為10%的固體，但即使在較長時間內（> 14 h）也能很容易地通過系統進行處理。該裝置的理論工作效率為0.108 mol/h。接下來，為了便于整體淬滅和后處理，作者在以6 mL/min的流速輸送的2 M HCl水溶液的匯合點添加了一個靜態混合元件（Scheme 4）。通過將暗紅色的反應混合物轉化為收集時快速相分離的淺黃色雙相溶液，可以立即觀察到有效淬滅的跡象。通過對有機相的1H NMR和LC分析，確認了該方法淬滅成功，顯示只有產物11和微量氰乙酸乙酯（10）。后進行人工分離，然后在Na2SO4上干燥，將溶劑蒸發，得到了目標產物11，收率94-96%，基于每隔20 min取一次樣，共取6次。
幾種實現間歇分離自動化的實驗室方法已經被報道，利用機器視覺系統和采用光學或感應電導率（阻抗測量）來確定相位劃分的內聯檢測設備來確定相分離。然而，由于特定項目的時間限制，作者被迫使用更人工的方法，但肯定會將這種節省勞動力的設備納入未來的發展計劃。作者的基礎系統使用一個簡單的間歇式收集容器和兩個位置合適的液相色譜泵來獨立地去除水相和有機相。偶爾的人工干預允許間歇重新校準泵，以保持工作體積，并創建一個合適的相段進行去除。同樣，在溶劑蒸發后，目標分子11的分離收率高達93-97%。
表2
水相淬滅分離后收集的溶液中含有0.4 M產品11，該產品11再用乙醇稀釋，以提供0.2 M的原液，用于下一個還原性成環步驟。在全氫條件下，使用含10 mol% Pd/C催化劑的ThalesNano H-cube系統進行還原。流速為0.4 mL/min，溫度為50℃，*轉化為吲哚產物12（表2，第1項）。當流速提高到0.8-1 mL/min時，觀察到原料*消耗，但分離出混合產物（表2，第2、3項）。對其組成的詳細分析表明了所需產物（12，62%）和另外兩種化合物（圖2）的存在，這兩種化合物在柱層析分離后分別被確認為氨基吲哚（14，29%）和n-羥基氨基吲哚（15，9%）。正如預期，隨著流速進一步增加，n-羥基氨基吲哚15的比例增加，后兩種不*還原產物增多。這與以往文獻中使用催化氫化或化學計量金屬（鋅或銦）介導還原的研究結果相關聯，并且與逐步還原機制相一致（Scheme 5）。從實驗序列中可以明顯看出，需要幾倍當量的氫才能*還原，因此較高的氫濃度（壓力）是有益的（表2，第4-10項）。作者還注意到，根據機理，苯胺氮的質子化可以促進還原步驟，并有助于水（16和18）和氨（20）的去除。因此，作者篩選了一系列酸性催化劑，其中乙酸（10-30 mol%）（表2，第11-14項）。較強的酸或較高的酸負荷往往會導致產生較高的內部壓力，在某些情況下，若觀察到沉淀物的形成，則需要將運行提前終止并安全關閉。使用乙酸并限制酸的濃度（10 mol%），在較高的內部壓力（15 bar）下運行，能夠穩定且連續地操作，流量允許提高到1.3 mL/min，同時確保>98%的轉化至所需的吲哚12（表2，第15-18項）。這轉化為15.6 mmol/h（3.7 g/h產品）的通量。通過9:1正己烷/yi mi 溶劑蒸發和研磨，可分離出白色固體終產物，收率93%。這種凈化除去了殘留的乙酸，雜質即使存在也只是痕量的副產物。
圖2
在接下來的實驗序列中，作者研究了這個過程的后兩個步驟：乙氧基取代物的聯氨，然后成環形成3H-[1, 3, 4]惡二唑-2-1單元。
在此過程中，將化合物12的0.95 M THF溶液與肼溶液（THF中，1.0 M）混合，直接進入加熱的流動線圈中，在100℃下進行過熱（Scheme 6）。停留時間為40 min，可以*轉換為相應的酰肼13，該酰肼13與含有CDI（THF中，1.1 M）的另一股料液直接混合，并在第二個流線圈中75℃加熱26 min。這提供了終產品8的定量轉換，產品流通過QP-SA清除盒（一種磺酸功能化聚合物）易于提純。該產品8經溶劑蒸發得到黃色固體（94%），但需要從DCM重結晶得到白色非晶粉末，純度高，收率82%。
作者進行了一系列在后一步中使用碳酸二甲酯作為CDI替代試劑的嘗試，在一系列條件下都失敗了，而在前面的酰肼形成步驟中直接使用（甲氧羰基）肼（CAS：6294-89-9）的試驗也失敗了。然而，作者發現三光氣（0.4當量）可以成功地應用于后者的成環過程。使用與Scheme 6類似的反應器組件，將三光氣（lv fang中，0.8 M）與中間體13的溶液混合，通過一個加熱（55℃）的流動線圈，然后通過一個含有QP-DMA（N, N-二甲基芐胺聚苯乙烯）的填充床掃氣筒。溶劑蒸發后，產品為白色固體，分離收率91%。在實踐中，這一方法被證明遠遠優于以前使用的CDI環化直接從反應器獲得更高的總收率和質量提升的產品。實際上，終產品8的純度足夠直接應用，允許在反應裝置中用<2 h從一個穩定的中間體12按需大規模生產。
總結：
1.按照文中所述的步驟，作者已經能夠通過一個靈活的實驗流程快速制備所需的目標分子8；
2. 在整個實驗流程中，英國AM Technology公司的連續多級攪拌反應器Coflore ACR在第1步生成中間體11的反應中起到了關鍵作用，因為反應中會不斷生成大量不溶的固體鹽副產物，而Coflore ACR可以在防止堵塞的同時使反應連續穩定運行；
3. Coflore ACR反應器可以解決連續流反應中的多項問題，包括對反應的淬滅以及處理含不溶性固體的反應，體現了Coflore ACR反應器良好的實用性能；
4. 作者利用Coflore ACR反應器實現了第1步中間體11的連續化穩定生產，并與整個后續流程實現串聯，表明不溶性固體不再是限制連續流生產的問題，該項技術可以在精細化工產品的大量制備中起到關鍵性作用；
5. Coflore ACR是已經成熟商業化的反應器，具備很好的規范性和通用性，對如含固等多相等復雜體系的工業化應用前景十分廣闊。
參考文獻：
doi:10.3762/bjoc.13.251
Beilstein J. Org. Chem. 2017, 13, 2549–2560.
公司簡介：
深圳市一正科技有限公司，作為荷蘭Chemtrix公司（微通道反應器）、英國AM公司（連續多級攪拌反應器、催化加氫系統）、英國NiTech公司（連續結晶儀、連續合成儀）在中國區的代理商和技術服務商，為廣大高校和企業提供連續合成、在線萃取、連續結晶、在線過濾干燥、在線分析等整套連續工藝解決方案。
公司與復旦大學、南京大學、中山大學、華東理工大學、南京工業大學、浙江工業大學、河北工業大學等高校研究機構合作成立微通道連續流化學聯合實驗室，致力于推動連續流工藝在有機合成、精細化工、制藥行業、能源材料、食品飲料等領域的應用，合作實驗室可以為客戶的傳統間歇釜式工藝在連續流工藝上的轉變提供工藝驗證、連續流工藝開發工作，促進制藥及精細化工企業由傳統間歇工藝向綠色、安全、快速、經濟的連續工藝轉變。
公司與荷蘭Chemtrix B.V.在浙江臺州、江蘇南京合作組建了連續流微通道工業化應用技術中心（以下簡稱“工業化技術中心”），旨在打造集連續流微通道工藝開發、中試試驗、工業化驗證、技術交流于一體的綜合性連續流微通道應用技術服務中心，以為廣大生物醫藥企業、化工類企業提供專業、完善的智能化連續流工藝整套系統解決方案及技術服務方案。