Cy3/Cy3.5/Cy5 NHS ester 染料活體成像應用（圖）
菁染料是近紅外熒光染料中常用的一類熒光染料，有顯著的優勢。由于細胞和組織的自發熒光在近紅外波段小，因此在檢測復雜生物系統時，近紅外染料能提供更高的特異性和靈敏度。同時，由于光波在近紅外區段的組織透過性更好。
產品說明：菁染料是性能優良的熒光標記染料，摩爾吸光系數在熒光染料中是非常高的，其琥珀酰亞胺酯是常用的脂肪氨基標記試劑，廣泛用于蛋白、抗體、核酸及其他生物分子的標記和檢測。通過改變次甲基鏈的長度，可改變其熒光發射波長，每增加一個雙鍵，按照Huoffman 規則正好紅移約100nm。 
磺酸化菁染料和非磺酸化菁熒光染料可以用于標記各種不同的目標分子：
l 可在有機溶劑中溶解的蛋白質
l 抗體 (use 5-10% ofDMSO/DMF)
l DNA和寡核苷酸
l 多肽
l 其他小分子，包括藥用小分子及抑制劑
磺酸化菁熒光染料可用于：
Ø 在DMF或DMSO中變性的敏感蛋白
Ø 被透析及純化的蛋白
Ø 水溶性的納米粒子
Ø 不溶或疏水的蛋白
非磺酸化菁熒光染料可用于：
Ø 在有機介質反應（二氯甲烷、乙腈）
產品一 Cy3 NHSester （CY3,SE）
Cyanine 是一種屬于聚甲炔基的合成染料,仍用于工業以增加感光乳劑的感光范圍(例如增加
波長范圍且使薄膜全色),近用于生物技術領域.作為熒光染料,Cyanine 已用于生物醫學成
像.根據它們的結構,cyanines 能覆蓋 UV 到 IR 的光譜范圍.
Cyanine3 NHS ester 可用作反應性染料,用于標記生物分子中的氨基。該試劑通常用于標記可溶性蛋白\多肽\寡核苷酸或 DNA. Cy3 NHS ester 需要使用有機共溶劑(例如 DMF 或 DMSO)用于標記,然而,考慮到水溶性sulfo-Cyanine3 NHS ester 在精細蛋白中的使用,此類共溶劑不是必需的.Cy3熒光位于橙色區域(~550nm 激發, ~570 nm 發射),而Cy5 是在紅色區域發光(~650/670nm),且在橙色區域吸收(~649nm).Cy3 可以通過配有標準的TRITC濾波器的熒光計\成像儀及顯微鏡檢測.由于其固有的高消光系數,甚至肉眼也可以很容易地檢測到凝膠和溶液中的 Cy3.
產品名稱 | Cy3 NHS ester | ||
英文名稱 | (2E)-1-[6-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-2-[(E)-3-(1,3,3-trimethyl-5-sulfonatoindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]indole-5-sulfonate | ||
Canonical SMILES | CC1(C2=C(C=CC(=C2)S(=O)(=O)[O-])[N+](=C1C=CC=C3C(C4=C(N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)C=CC(=C4)S(=O)(=O)[O-])(C)C)C)C | ||
分子式 | C34H38N3NaO10S2 | 分子量 | 735.80 |
溶解度 | very high in water, good in polar organic solvents (DMF, DMSO) | 儲存條件 | 在- 20°C的黑暗環境中保存24個月。運輸：室溫下長達3周。避免長時間暴露在光線下。干燥劑。 |
更高要求 | 為了獲得更高的溶解度，請將管在37℃加熱并在超聲波浴中搖晃一段時間，原液可儲存在20℃以下幾個月。 | ||
Spectral properties
光譜信息 大激發波長 (nm) | 584 | 大發射波長 (nm) | 563 |
在大激發波長下的消光系數, Lmol-1cm-1 | 162000 | 熒光量子產率 | 0.1 |
CF260 | 0.03 | CF280 | 0.06 |
產品二 Cy3.5 NHSester （CY3.5,SE）
Cy3.5 NHS ester是一種活性染料，用于標記生物分子中的氨基，Cy3.5®NHS酯的類似物。該試劑是用于標記可溶性蛋白、肽和寡核苷酸/ DNA的理想試劑。溶解于有機溶劑DMSO，對于微妙的蛋白質考慮使用水溶性CY3.5-NHS酯，不需要使用任何共溶劑。
化學名稱 | Cy3.5 NHS ester | |||||
英文名稱 | 2-((1E,3E)-3-(3-butyl-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)prop-1-en-1-yl)-3-(6-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-3-ium | |||||
Canonical SMILES | CC1(C)C2=C3C(C=CC=C3)=CC=C2[N+](CCCCCC(ON4C(CCC4=O)=O)=O)=C1/C=C/C=C5C(C)(C)C6=C(C=CC=C7)C7=CC=C6N\5CCCC | |||||
分子式 | C42H44ClN3O4 | 分子量 | 690.27 | |||
溶解度 | >69.6mg/mL in DMSO | 儲存條件 | 在- 20°C的黑暗環境中保存24個月。運輸：室溫下長達3周。避免長時間暴露在光線下。干燥劑。 | |||
更高要求 | 為了獲得更高的溶解度，請將管在37℃加熱并在超聲波浴中搖晃一段時間，原液可儲存在20℃以下幾個月。 | |||||
光譜信息 大激發波長 (nm) | 591 | 大發射波長 (nm) | 604 | |||
在大激發波長下的消光系數, Lmol-1cm-1 | 116000 | 熒光量子產率 | 0.35 | |||
CF260 | 0.29 | CF280 | 0.22 | |||
產品三 Cy5 NHSester （CY5,SE）
在過去的幾年中，cy5已經成為生命科學研究和診斷領域的一個非常受歡迎的標簽。熒光團在紅色區域發射大，其中許多CCD探測器表現出大的靈敏度，熒光明亮。
Cy5 NHS ester 是用于標記肽、蛋白質和核苷酸中的氨基的活性染料。這種染料需要少量的有機共溶劑（如DMF或DMSO）用于標記反應。該試劑是非常可貴的有效標記的可溶性蛋白以及各種肽和核苷酸的理想試劑。該試劑也適用于小分子標記的有機溶劑。對于更復雜的目標，如易降解的蛋白質，當使用DMF或DMSO是不可取的，考慮使用水溶性Cy5 NHS ester，它不需要任何共溶劑，并且具有非常相似的熒光性質。
化學名稱 | CY5 NHS | |||||
英文名稱 | (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2E)-3,3-dimethyl-2-[(2E,4E)-5-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dienylidene]indol-1-yl]hexanoate | |||||
CAS: | 1032678-42-4 | |||||
Canonical SMILES | CC1(C2=CC=CC=C2[N+](=C1C=CC=CC=C3C(C4=CC=CC=C4N3CCCCCC(=O)ON5C(=O)CCC5=O)(C)C)C)C | |||||
分子式 | C36H42ClN3O4 | 分子量 | 616.19 | |||
溶解度 | >31.5mg/mL in DMSO | 儲存條件 | 在- 20°C的黑暗環境中保存24個月。運輸：室溫下長達3周。避免長時間暴露在光線下。干燥劑。. | |||
更高要求 | 為了獲得更高的溶解度，請將管在37℃加熱并在超聲波浴中搖晃一段時間，原液可儲存在20℃以下幾個月。 | |||||
光譜信息 大激發波長 (nm) | 646 | 大發射波長 (nm) | 662 | |||
在大激發波長下的消光系數, Lmol-1cm-1 | 250000 | 熒光量子產率 | 0.2 | |||
CF260 | 0.03 | CF280 | 0.04 | |||
菁染料Cy3 和Cy5 已成為基因芯片的熒光標記物; 另外,Cy5, Cy5.5 和Cy7 的吸收在近紅外區背景非常低，是熒光強度高、穩定的長波長染料。特別適合于活體小動物體內成像代替放射性元素。下圖是CY5熒光標記小鼠的圖片。
杭州新喬生物科技有限公司可以提供種類為齊全的CY系列染料，CY3/CY3.5/CY5/CY5.5/CY7/CY7.5的末端各種活性基團包括COOH, NH2, NHS, MAL, N3, ALK, hydrazide, SH等等不同活性基團。
N-羥基琥珀酰亞胺脂Dye NHS esters
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