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PCR引物設計需要注意：

1、引物長度：一般為15～30個堿基，引物太短會降低擴增特異性。引物過長退火溫度會提高，不利于反應的發生。

2、引物序列：設計引物時堿基要隨機分布，避免堿基或核苷酸的重復導致錯誤引發；引物間和引物自身序列也要盡量避免互補，防止形成引物二聚體或發夾結構。

3、堿基分布：GC含量一般40-60%，含量過高或過低都不利于進行反應。其含量過低會使引物不穩定；過高會引發非特異性擴增。

4、 Tm值：引物的Tm值（解鏈溫度）=4（G+C）+2（A+T），盡可能保證上下游引物的Tm值一致，一般不超過2℃。

5、 引物設計好后進行BLAST檢查，檢測是否與基因組中重復序列或其它基因位點有交叉同源；

6、 引物的特異性：引物的3'端如果含有一個G或C殘基能增加引物的特異性。