高壓滅菌器的工作原理基于熱力滅菌原理，通過高溫高壓狀態下的水蒸汽及其釋放的大量潛熱對有細菌的菌體物質進行的滅菌處理。
具體來說，當物品放入高壓滅菌器中，密封容器內的壓力和溫度會迅速升高。在0.1MPa的壓力下，鍋內溫度可以達到121℃。在這個溫度下，可以很快殺死各種細菌及高度耐熱的芽孢。在這個階段，滅菌器內部的高溫高壓環境對微生物起到了破壞作用，使其失去活性。同時，高溫高壓狀態下的水蒸汽與微生物接觸，通過凝結成水釋放出大量潛熱，使溫度能夠迅速達到滅菌所需的要求，加速了滅菌過程。
另外，當蒸汽凝結成水之后，體積瞬間縮小1000多倍，產生局部負壓又可使蒸汽穿透至滅菌物品的深部，這樣就加強了蒸汽對被滅菌物品的穿透，使物品的深部也能達到所需的滅菌溫度。在達到設定的滅菌時間后，滅菌過程結束，壓力和溫度逐漸下降。此時，滅菌器內部的壓力和溫度降低，但仍然保持一定的濕度。這樣可以保證滅菌后的物品保持一定的濕度，有利于后續的處理和使用。
總之，高壓滅菌器的工作原理是通過高溫高壓蒸汽進行滅菌。在高溫高壓狀態下，水蒸汽能夠穿透物品并釋放大量潛熱，殺滅其中的微生物。同時，高溫高壓的環境能夠破壞微生物的細胞壁和細胞膜，使其失去活性。正確使用高壓滅菌器可以有效地殺滅各種微生物，提高產品質量和生產效率。
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