近日,由中國科學院科技服務網絡計劃(STS計劃)項目支持,中科院青島生物能源與過程研究所、北京生命科學研究院、天津工業生物技術研究所、微生物研究所共同承擔的“生物高通量檢測分析服務網絡”項目結題驗收。
經過5年的實施,該項目研制出了單細胞拉曼分選儀工程化樣機(RACS-Mini),開發了單細胞拉曼表型組數據庫及拉曼組數據分析軟件,建立了完整的單細胞拉曼成像-分選-測序的單細胞組學分析平臺,形成了外套基于拉曼光譜的高通量單細胞檢測、分析、分選系統,為生命科學研究提供新工具。RACS-Mini適用于細菌、真菌、微藻、植物細胞、人體細胞等多種細胞類型,可實現無損、非標記條件下每小時10萬個單細胞檢測通量,準確率達到98.3%,分選后細胞超過93%細胞保持活性并可增殖。
中科院科技促進發展局組織召開了該項目驗收會,驗收專家一致認為該項目不僅在核心檢測裝備與技術方面有顯著創新,同時項目組利用所開發的設備及技術,為外多個單位提供技術服務,產生了積極的行業影響和可觀的經濟效益,建議項目組應進一步發揮團隊力量,聚焦技術產業化推廣,促成更大的應用成果,提升科技服務能力。
高通量測序的*性體現在:測序序列長,可以覆蓋16S /18S rDNA、ITS等高變區域; 測序通量高,可以檢測到環境樣品中的痕量微生物;實驗操作簡單、結果穩定,可重復性強;無需進行復雜的文庫構建,微生物DNA擴增產物可以直接進行測序,實驗周期短;測序數據便于進行生物信息分析。
該方法得到*期刊的認可(Nature等),已成為土壤微生物多樣性檢測的重要手段。上海美吉生物公司已有若干成功案例,為客戶提供的土壤樣本進行高通量測序并進行生物信息學分析。高通量測序因其數據量大,操作過程簡單,盡可能避免了繁瑣的實驗操作過程所造成的樣本損失,能夠相對客觀的反應出土壤樣本的情況。
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