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公司動態(tài)

轉(zhuǎn)化細胞的代謝過程

閱讀:200          發(fā)布時間:2018-3-28

轉(zhuǎn)化細胞分別描述基因的分子功能、參與的生物過程和所處的細胞位置。分子功能分析結(jié)果顯示:與PRRSV nsp11互作的宿主細胞蛋白具有結(jié)合能力和酶活性;生物過程分析結(jié)果顯示:與nsp11互作的宿主細胞蛋白主要參與細胞的代謝過程,蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后修飾、翻譯、運輸過程、信號轉(zhuǎn)導,RNA的代謝過程等;細胞位置分析結(jié)果顯示:與nsp11互作的宿主細胞蛋白主要分布于細胞質(zhì)、細胞膜、細胞核以及大分子復合體等部位。
COG (Clusters of Orthologous Groups of proteins)注釋: 對鑒定出的201個與PRRSV nsp11相互作用的宿主細胞蛋白進行COG注釋,通過比對分析,預測這些蛋白可能發(fā)揮的功能,并對其功能進行分類統(tǒng)計。結(jié)果顯示:與PRRSV nsp11互作的宿主細胞蛋白主要功能與蛋白質(zhì)的翻譯和修飾、RNA的加工和修飾以及信號轉(zhuǎn)導等密切相關(guān)。
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代謝通路注釋: KEGG是一個整合了基因組、化學和系統(tǒng)功能信息的數(shù)據(jù)庫。轉(zhuǎn)化細胞為了確定與PRRSV nsp11互作的宿主細胞蛋白所參與的主要生化過程和代謝通路,本研究利用KEGG數(shù)據(jù)庫對鑒定出的201個宿主細胞蛋白進行pathway分類分析。結(jié)果顯示:與nsp11互作的宿主細胞蛋白主要參與核糖體代謝、碳代謝、剪切體代謝、氨基酸的生物合成以及病原的致病性等代謝通路。
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轉(zhuǎn)化細胞 

 

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