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用常規方法進行基因敲除研究需耗費大量的時間和人力，研究者必須針對靶位點在染色體組文庫中篩選相關的染色體組克隆，繪制相應的物理圖譜，構建特異性的基因敲除載體以及篩選中靶ES 細胞等，通常一個基因剔除純合子小鼠的獲得需要一年或更長的時間。面對人類基因組計劃產生出來的巨大的功能未知的遺傳信息，傳統的基因敲除方法顯得有些力不從心。因此，基因捕獲法應運而生，利用基因捕獲可以建立一個攜帶隨機插入突變的ES 細胞庫，節省大量篩選染色體組文庫以及構建特異打靶載體的工作及費用，更有效和更迅速地進行小鼠染色體組的功能分析。
 
此方法的缺點是只能剔除在Es 細胞中表達的基因.單種的細胞類型中表達的基因數目約為I04，現在的基因捕獲載體從理論上來講應能剔除所有在ES細胞表達的基因，因此，在ES 細胞中進行基因捕獲還是大有可為的。用基因捕獲法進行基因剔除的另一個缺點是無法對基因進行精細的遺傳修飾。

C [ATCC 25312, CIP 104337, NCIB 12416]    Escherichia coli (Migula) Caslani and Ch ..
NRRL YB-3239 [CBS 5762, CCRC 20470, FMJ 7135 ..    Barnettozyma californica (Lodder) Kurtzman ..
CAL/CSF1 [CBS 6832, NRRL Y-12936, NRRL Y-829 ..    Sporidiobolus salmonicolor Fell et Tallman
XM101    Dictyosium discoideum Raper
yD2461    Homo sapiens, human
    Patulibacter americanus Reddy and Garcia-Pi ..
FAS21    Saccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C. Hans ..
RP24238D19    Mus musculus, mouse
YJL065C BY4743, homozygous diploid [31359]    Saccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C. Hans ..
    dried
4AB-65    Varicosporium elodeae Kegel
110S    Ardenscatena maritimus
YGL218W BY4742, mating type alpha [16884]    Saccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C. Hans ..
FRI 182    Poria rhizomorpha Bagchee, eomorph
int-2i    Mus musculus, mouse
YPL227C BY4743, homozygous diploid [31065]    Saccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C. Hans ..