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RNA提取的原理是什么?
不同組織RNA提取原理是將細胞裂解,釋放出 RNA,并通過不同方式去除蛋白,DNA 等雜質,最終獲得高純度 RNA 產物的過程。常用的RNA提取方法是Trizol方法,Trizol內含異硫氰酸胍能迅速破碎細胞,同時使核蛋白復合體中的蛋白變性并釋放出核酸,由于釋放出的DNA和RNA在特定pH值下的溶解度不同,且分別位于中間相和水相,從而使DNA和RNA得到分離,取出水相后,通過有機溶劑 (氯仿) 抽提及異丙醇沉淀,可得到純凈RNA。那么你知道RNA提取的原理是什么嗎?讓我們一起來看看吧!
一、常見RNA提取樣本細胞裂解方法
1.異硫氰酸胍/苯酚(Trizol)
原理:苯酚裂解細胞,變性蛋白,但不能wan全抑制RNase活性。異硫氰酸胍迅速溶解蛋白,破碎細胞,解離核蛋白復合體,釋放核酸,并抑制RNase活性,保持RNA完整性。苯酚是酸性酚,后續加入氯仿進行有機萃取。
特點:得率高、可提取到含miRNA和其他小RNA在內的總RNA。但產生有機試劑廢物。
適用范圍:次級代謝較少的植物組織,如幼苗、幼葉等。培養細胞、動物組織、微生物。
2.胍鹽/β-巰基乙醇法:
原理:胍鹽一般是鹽酸胍或異硫氰酸胍。鹽酸胍迅速裂解細胞,變性蛋白,并抑制核酸酶活性。配合β-巰基乙醇還原蛋白質結構中的二硫鍵,從而使RNase變性。
特點:得率高
適用范圍:次級代謝較少的植物組織,如幼苗、幼葉等。培養細胞、動物組織、微生物。
二、常見抽提方法:
1.酚氯仿抽提(有機試劑抽提)
原理:將被裂解的生物樣本,混勻離心分相以后,RNA在上層水相,DNA,蛋白質在中間層,下層有機相。收集水相加入乙醇或異丙醇可沉淀RNA,漂洗后得到RNA。
優點:得率高、可提取到含miRNA和其他小RNA在內的總RNA。
缺點:用到苯酚、氯仿等有毒試劑。
2.硅膠柱法抽提
原理:硅基質材料在一定的高鹽緩沖系統下高效、專一地吸附核酸。(高鹽低pH吸附核酸,低鹽高pH釋放核酸。
優點:操作簡單、安全無毒
缺點:需配合高速離心機使用;提取的總RNA不含小于200nt的小RNA。
3. 磁珠法抽提
原理:納米微球磁珠材料表面涂上一層二氧化硅,使磁珠獲得吸附能力。
優點:磁場中快速分離,無需離心,可實現自動化操作。
缺點:成本較高;提取的RNA可能殘存磁珠。
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