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在進行腫瘤細胞分選前，保留一小部分起始樣本是非常重要的。這樣有助于評估分選前樣品中目標細胞的比率及分選后該細胞的回收率。

各種組織和細胞來源中的細胞比率可以根據已發表的數據來估算。然而，實際操作中，細胞比率可能因供體而異，并且取決于是否來自正常的、患病的還是轉基因的樣本。

細胞回收率：

計算分選后的細胞回收率是評估實驗是否成功的寶貴工具。需要準確地得到以下四個數據： 

分選前起始樣本中的細胞總數*
目標細胞在起始樣本中的比率*
分選后的細胞總數
分選后目標細胞的純度

使用以下公式計算細胞回收率：
回收率 = [(3) x (4)] / [(1) x (2)] X 100%

*為方便起見，您可以在實驗結束時將預留的起始樣本與您的分選后（富集）樣本一并進行分析。 

細胞總數：

起始樣本和富集樣本中的細胞總數可以通過的細胞計數來確定。理想情況下，應評估有核細胞（TNC）的總數和細胞活率，但是計算細胞回收率只需要TNC計數。如果使用自動化系統進行細胞計數，需注意僅計數白細胞（排除紅細胞）。 

目標腫瘤細胞的純度：
起始樣本和富集樣本中目標細胞的比率（或純度百分比）可以通過流式細胞儀來確定。細胞分選試劑盒的產品說明書為如何評估該特定細胞的純度提供了建議。要注意，一些陽性分選試劑盒可能存在表位占據問題，因此需要遵循產品說明書的指示，以確保準確地評估細胞純度（例如使用特異性抗體克隆，或在進行細胞分選時，同時加入染色抗體和分選抗體混合物）。另外，需要注意對活細胞設門以提高準確性。
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腫瘤細胞