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產品描述
LcGreen(20×水溶液)是一種用于實時定量PCR(qPCR)的DNA 結合染料。本產品的諸多優點使它遠勝于SYBR Green I,除了有相似的光譜特性,還有三個主要特點使它區別于SYBR Green I 。
首先,LcGreen對PCR的抑制性遠小于SYBR Green I。因此,使用LcGreen進行的qPCR實驗可以使用快速PCR步驟。同時,本產品在實驗中可以使用較高的濃度,從而獲得遠強于SYBR Green I擴增信號。較高濃度也消除了“染料重分布”的缺陷,使本產品既可用于多重PCR,也可用于高分辨率(高清晰)熔解曲線分析(HRM)。該分析正被越來越多的用于PCR后的基因分型和異源雙鏈分析。由于SYBR Green I對PCR的抑制性,從而要求其使用濃度必須很低,因此SYBR Green I無法解決由低濃度造成的染料重分布問題,既不能用于多重PCR也不能用于HRM。同時,染料重分布問題也可能影響常規熔解曲線的可靠性,因為低熔點的DNA鏈可能由于這種原因而無法檢測到。
第二,本產品的穩定性*。在正常的儲存、操作和PCR過程中不會被破壞。在緩沖溶液中的染料可以安全的儲存在室溫或冰箱里,也可以反復凍融。與之相反,SYBR Green I不穩定而且降解后對PCR抑制性更強。
第三,本產品降低了細胞膜透性,因而比SYBR Green 1更加安全。獨立實驗室的測試結果顯示,本產品既沒有誘變性也沒有細胞毒性。相反,雖然SYBR Green I本身誘變性很弱,但它在細胞中可能抑制了正常DNA的修復機制,使其有誘變增強作用。考慮到PCR的廣泛使用,其安全性應該足夠重視。
訂購信息
產品名稱 | 貨號 | 規格 | 價格 |
LcGreen(20× 水溶液) | AN19L122 | 1 mL | 700 |
LcGreen(20× 水溶液) | AN19L123 | 5 mL | 2800 |
產品參數
λabs/λem = 500/530 nm (結合DNA)
λabs = 471 nm (未結合DNA)
保存方法
4℃或-20℃,避光保存,有效期見外包裝。
使用方法
如下建立實驗體系:(僅供參考)
名稱 | 體積 |
10×的無Mg2+聚合酶緩沖液 | 5 µL |
50 mM MgCl2 | 2.5 µL |
2 mM dNTP | 5 µL |
20×LcGreen | 2.5 µL |
Taq DNA polymerase | 1-5 units |
F, R Primers | 各0.1-0.5 µM |
模板 | 適量 |
dH2O | to a final volume of 50 µL |
實驗目的
實時定量PCR檢測20× LcGreen
主要試劑
(1)Prime
hβ-actin:
forward 5’ -CACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3’
reverse 5’-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3’
(2)HS Taq DNA Polymerase: Thermo(EP0612)
(3)Glycerlo: Sigma(V900090-500 mL)
(4)BSA: Sigma(A7030)
(5)10 mM dNTPs: Takara(4019)
實驗方案
1. 配制2× LcGreen Buffer
2× LcGreen Buffer | ||
組分 | 濃度 | 體積(μL) |
1 M Tris HCl pH8.5 | 50 mM | 5 |
500 mM (NH4)2SO4 | 20 mM | 4 |
50 mM MgCl2 | 7 mM | 14 |
50% glycerol | 2.5% | 5 |
DMSO | 10 % | 10 |
20× LcGreen | 2× | 10 |
10 mM dNTPs | 0.4 mM | 4 |
2 % Tween20 | 0.03 % | 1.5 |
1 mg/mL BSA | 22 mg/mL | 2.2 |
H2O | / | 44.3 |
Total volume | / | 100 |
2. 配制 q-PCR反應體系
成分 | 20 μL/體系/管反應 |
10 μM primers | 1 μL |
模板 | 適量 |
HS Taq DNA 酶 (5 U/μL) | 0.2 μL |
2× LcGreen buffer | 10 μL |
H2O | 定容至20 μL |
【注】:① DNA 模板的添加量通常在 100 ng 以下,因不同種類的 DNA模板中含有的靶基因的拷貝數不同,必要時可進行梯度稀釋,確定合適的 DNA 模板添加量。cDNA作為模板時的添加量不要超過 PCR 反應液總體積的 10%。② 引物終濃度一般控制在0.1-0.5 μM范圍內。
3. 實驗分組:標準對照樣品孔(陽性對照)、檢測樣品孔、空白對照孔(陰性對照)共三組,同時進行檢測,分別進行三次平行實驗。
4. 混勻離心、上機進行熒光定量PCR(儀器為Roche:LC96)。
PCR程序:
溫度 | 時間 | |
Step 1 | 95 ℃ | 2 min |
Step 2 | 95 ℃ | 5 sec |
Step 3 | 60 ℃ | 30 sec |
Step 2~3,重復 45個循環 | ||
熔解曲線Tm值 57 ℃~99 ℃ |
5.保存數據,判斷樣本質量:
(1)檢測樣品與標準品之間的Ct值差
(2)檢測樣品與標準品之間的熒光強度差
檢測結果需達到:以上兩組檢測指標無顯著性差異
注意事項
該產品*于科學實驗研究使用,不得用于臨床診斷、治療等領域。
相關試劑推薦
LyGreen (20×in water) HRM用染料(20×水溶液)(貨號:AN19L022)