液相色譜儀與氣相色譜儀的主要差別：
1、分析對象差別：
(1)氣相色譜儀的分析對象：
1)能氣化、熱穩定性好和沸點較低的樣品。
2)高沸點、揮發性差、熱穩定性差、離子型和高聚物樣品不能檢測。
3)僅占有機物的15%～20%左右。
(2)液相色譜儀的分析對象：
1)溶解后能制成溶液的樣品。
2)不受樣品揮發性和熱穩定性的限制。
3)分子量大、難氣化、熱穩定性差、高分子和離子型樣品及具有生理活性物質均可檢測。
4)應用廣泛，占有機物的80%～85%左右。
2、流動相差別：
(1)氣相色譜儀的流動相：
1)流動相為氣體。
2)流動相與組分之間無親和作用，只與固定相互作用。
(2)液相色譜儀的流動相：
1)流動相為液體。
2)流動相與組分之間有親和作用，提高了柱選擇性，對分離起很大作用。
3)流動相種類較多，選擇余地大。
4)流動相極性和PH值的選擇對分離起重要作用。
5)可選用不同比例的兩種或兩種以上液體作為流動相，增大分離選擇性。
3、操作條件差別：
(1)氣相色譜儀的操作條件：
加溫操作。
(2)液相色譜儀的操作條件：
室溫，高壓(液體粘度大)。
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