水冷式冷水機是目前較為為理想的一種降溫裝置，而為了保證冷水機長期有效運行，水冷式冷水機的操作一定要規范。
冷水機組開機前必須嚴格遵守：檢查電源，冷卻水閥門、冷凍水閥門是否開啟，冷凍水壓、冷卻水壓力表，機組油壓、油溫等是否正常。水冷式冷水機組開機順序：冷卻水泵開→冷卻塔風機開→冷凍水泵開→冷水機組開。
水冷式冷水機組停機順序為：(必須嚴格遵守)：冷水機組停→冷卻塔風機停→冷卻水泵停→冷水泵停
水冷式冷水機組操作時要注意以下注意事項：
①停機時，水冷式冷水機組應在下班前1小時關停(適情況而定)，冷水泵下班后再關停，有利于節省能源，同時避免故障停機，保護機組。
②運行制冷循環前，應確認制熱循環管道閥門已全部關閉。
另外，使用水冷式冷水機以后要定時進行清洗，每一次在操作的過程當中都要做好后續處理工作，每一次操作完成之后應該清楚水冷冷水機上面的殘留物質，不僅僅是表面，對于管道內部也應該經常清洗，而且不用的時候要清潔以后保持內部的ph值，特別是加藥清洗以后，不允許一些表面粗糙的物質來進行清洗。
