SolarRed核酸染料有2種使用方法:
1.膠染法
(1) 制膠時(shí)加入SolarRed核酸染料(例如:每50mL 瓊脂糖溶液中加入5μL SolarRed 10,000× 儲(chǔ)液,以此比例類推)。
(2) 按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。
注意事項(xiàng):
(1) 此方法染色染料用量相對(duì)較少。500 μL染料大約可以做100塊 50mL的膠。
(2) 由于SolarRed具有良好的熱穩(wěn)定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉(zhuǎn)以保證染料充分混勻。也可以選擇將SolarRed儲(chǔ)液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中,然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。SolarRed兼容幾乎所有常用的電泳緩沖溶液。
(3) 如果總是看到條帶彌散或分離不理想,建議使用泡染法染色以確認(rèn)問(wèn)題是否與染料有關(guān)。如果染色后問(wèn)題依舊存在,則說(shuō)明問(wèn)題與染料無(wú)關(guān),請(qǐng)嘗試:降低瓊脂糖濃度;選用更長(zhǎng)的凝膠;延長(zhǎng)凝膠時(shí)間以保證邊緣清晰;改進(jìn)上樣技巧或選擇泡染法染色。
(4) 此方法不適合預(yù)制聚丙烯酰胺凝膠,對(duì)于聚丙烯酰胺凝膠請(qǐng)使用泡染法。
2.泡染法
(1) 按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。
(2) 用H2O將SolarRed 10,000× 儲(chǔ)液稀釋約3,300倍到0.1M NaCl中,制成3× 染色液。(例如將15μL SolarRed 10,000× 儲(chǔ)液和5mL 1M NaCl加到45mL H2O中)。
(3) 將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3× 染色液浸沒(méi)凝膠。室溫振蕩染色30min左右,染色時(shí)間根據(jù)凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對(duì)于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時(shí)間通常介于30min到1h,并隨丙烯酰胺含量增加而延長(zhǎng)。
注意事項(xiàng):
(1) 用泡染法染色時(shí),染料用量較多。單次使用的染色液可重復(fù)使用3次左右。
(2) 3×SolarRed染色液可以大量制備,在室溫下避光保存直用完。
在使用核酸染料時(shí)建議合理的佩戴手套、口罩、護(hù)目鏡等護(hù)具,并在符合要求的環(huán)境下進(jìn)行造作,避免核酸染料對(duì)操作者的皮膚和呼吸系統(tǒng)造成影響。不小心接觸皮膚后應(yīng)該立刻清洗,并妥善處理廢棄物。
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