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實時熒光定量PCR實驗代測,RT-PCR實驗代測,mRNA實驗代做
1.聚合酶鏈反應(英文全稱:Polymerase Chain Reaction),簡稱PCR。聚合酶鏈反應(PCR)是體外酶促合成特異DNA片段的一種方法,由高溫變性、低溫退火(復性)及適溫延伸等幾步反應組成一個周期,循環進行,使目的DNA得以迅速擴增,具有特異性強、靈敏度高、操作簡便、省時等特點。它不僅可用于基因分離、克隆和核酸序列分析等基礎研究,還可用于疾病的診斷或任何有DNA,RNA的地方.聚合酶鏈反應(Polymerase Chain Reaction,簡稱PCR)又稱無細胞分子克隆或特異性DNA序列體外引物定向酶促擴增技術。Real -Time PCR,即實時監測PCR擴增產物并進行解析的方法,它是在PCR反應體系中加入熒光物質,并通過Real -Time PCR檢測系統對PCR反應進程中的熒光信號強度進行實時監測,zui終對實驗數據進行分析處理的方法。Real -Time PCR自1996年由美國Applied Biosystems公司推出以來,廣泛應用于生物研究的各個領域。目前主要有SYBR Green 染料、Taqman探針法兩種。
實時熒光定量PCR實驗代測,RT-PCR實驗代測,mRNA實驗代做
2 方法
2.1 組織總RNA的提取
(1)取組織或者細胞于1mL的Trizol的勻漿管中,于勻漿機勻漿20sec,立即放于冰上;
(2)置于超凈臺中,溫育5min,12000r/min,離心10min;
(3)吸上清于新的1.5mL離心管中,加入200μL的氯仿,搖勻,室溫靜置2min,4℃,12000r/min,離心10min;
(4)吸取上清于新的1.5mL離心管中,加入600μL的異丙醇,混合均勻,室溫靜置15min,4℃,12000r/min,離心15min,棄上清;
(5)加入1mL75%的無水乙醇(750μL無水乙醇+250μL DEPC水)漂洗沉淀,4℃,12000r/min,離心5min,棄上清;
(6)加入1mL無水乙醇,漂洗沉淀,4℃,12000r/min,離心5min,棄上清,室溫干燥10min;
(7)加入40μL的DEPC水溶解RNA,置于-80℃冰箱保存備用。
2.2 cDNA*條鏈的合成
2.2.1 總RNA中DNA的消除
DNaseⅠ: |
| 1μL |
10×DNaseⅠ Buffer: |
| 1μL |
總RNA: |
| ≦1ng |
DEPC-H2O: |
| nμL |
總體積: |
| 10μL |
37℃,30min;Hold,加1μL的EDTA;65℃,10min。
2.2.2 反轉錄
(1)按以下體系加入:
RNA-Primer Mix: | 12μL |
5×RT Reaction Buffer: | 5μL |
25mM dNTPs: | 1μL |
25U/μL RNase Inhibitor : | 1μL |
200U/μL M-MLV Rtase: | 1μL |
Oligo(dt)18 | 1μL |
ddH2O(DNase-free): | 4μL |
總體積: | 25μL |
反應程序:37℃,60min;85℃,5min;4℃,5min;置于-20℃保存。
2.3 Real-time PCR擴增
將制備好的cDNA進行PCR擴增,擴增體系如下:
SYBRGreen Mix 12.5μL
上游引物F 0.5μL
下游引物R 0.5μL
ddH2O 9.5μL
cDNA模板 2μL
總體積 25μL
反應程序:
95℃ ,10min(95℃,15Sec;60℃,45Sec)×40;95℃,15 Sec; 60℃,1min;95℃,15 Sec;60℃, 15 Sec;
數據采用儀器自帶軟件分析:ABI Prism 7300 SDS Software
實驗結果
提供實驗原始數據
cytochrome c mRNA擴增動力學曲線
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