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翌圣生物科技(上海)股份有限公司

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12592ESHieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit
參考價3200
具體成交價以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 12592ES 型號
  • Yeasen/翌圣生物 品牌
  • 生產(chǎn)商 廠商性質(zhì)
  • 上海市 所在地

規(guī)格
4 T3200元10 件 可售

訪問次數(shù):244更新時間:2023-11-19 20:55:49

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產(chǎn)品簡介
供貨周期 現(xiàn)貨 應(yīng)用領(lǐng)域 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè),制藥
Hieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit for Illumina®是針對Illumina®高通量測序平臺研發(fā)的用于Multi-CUT&Tag實驗的文庫構(gòu)建試劑盒,適用于100-100,000個細(xì)胞起始量的樣本建庫。Multi-CUT&Tag是研究蛋白與DNA互作的技術(shù),相較于傳統(tǒng)的CUT&Tag,該技術(shù)使用nanobody-Tn5(Anti-mouse
產(chǎn)品介紹

產(chǎn)品簡介

 

Hieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit for Illumina®是針對Illumina®高通量測序平臺研發(fā)的用于Multi-CUT&Tag實驗的文庫構(gòu)建試劑盒,適用于100-100,000個細(xì)胞起始量的樣本建庫。Multi-CUT&Tag是研究蛋白與DNA互作的技術(shù),相較于傳統(tǒng)的CUT&Tag,該技術(shù)使用nanobody-Tn5(Anti-mouse Tn5和Anti-rabbit Tn5,可實現(xiàn)一份細(xì)胞,兩種靶標(biāo)的研究,同時,該技術(shù)實驗中無需再添加二抗該技術(shù)具有一抗抗體投入量更少、無需二抗、文庫產(chǎn)量更高等優(yōu)點。經(jīng)過細(xì)胞捕獲、一抗孵育、轉(zhuǎn)座酶孵育、轉(zhuǎn)座酶激活、摻入DNA標(biāo)準(zhǔn)品、細(xì)胞裂解、磁珠回收gDNA、文庫擴增和磁珠分選等步驟,靶蛋白結(jié)合的DNA片段最終轉(zhuǎn)化為適用于Illumina®平臺測序的文庫。

本試劑盒包含兩個獨立模塊:BOX-I和BOX-II。BOX-I的核心為結(jié)合細(xì)胞的ConA磁珠和回收DNA的磁珠,BOX-II包含細(xì)胞透化劑、蛋白酶抑制劑、抗體結(jié)合buffer、轉(zhuǎn)座酶結(jié)合buffer、蛋白酶K以及后續(xù)文庫擴增所需的所有試劑。此外,本試劑盒已在不同種類細(xì)胞(如293T、K562、CHO、ESC細(xì)胞等)和動物組織(腦組織、肝臟、脾等)中進(jìn)行了驗證,均具有良好的建庫效率和建庫產(chǎn)量。本試劑盒提供的所有試劑都經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗證,上保證了文庫的穩(wěn)定性和重復(fù)性。

 

產(chǎn)品信息

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品編號

規(guī)格

Hieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit for Illumina®
多靶標(biāo)CUT&Tag試劑盒(Nanobody-Tn5款)

12592ES04

4 T

12592ES12

12 T

12592ES48

48 T

 

 

組分信息

 

組分編號

組分名稱

12592ES04

12592ES12

12592ES48

BOX-I

12592-A

ConA Beads

40 μL

120 μL

480 μL

12592-B

DNA Selection Beads

840 μL

2.52 mL

10.08 mL

12592-C

Cell wash buffer

3.6 mL

10.8 mL

43.2 mL

12592-D

ConA bind buffer

400 μL

1.2 mL

4.8 mL

BOX-II

12592-E

Protease Inhibitor Cocktail (EDTA-free)

40 μL

120 μL

480 μL

12592-F

5% Digitonin

8 μL

24 μL

96 μL

12592-G

3 M NaCl

120 μL

360 μL

1440 μL

12592-H

50x Protein blocker

4 μL

12 μL

48 μL

12592-I

Anti-mouse Tn5

8 μL

24 μL

96 μL

12592-J

Anti-rabbit Tn5

8 μL

24 μL

96 μL

12592-K

30x Activating buffer

4 μL

12 μL

48 μL

12592-L

15x Terminate Solution

8 μL

24 μL

96 μL

12592-M

DNA Spike-in mix V2 (5 pg/uL)

4 μL

12 μL

48 μL

12592-N

30x Proteinase K

4 μL

12 μL

48 μL

12592-O

2×Ultima Amplification Mix

100 μL

300 μL

1.2 mL

12592-P

i5 Universal Primer

8 μL

*

*

12592-Q

i7 Index Primer (T701)

8 μL

*

*

【注】:*12592ES12/48試劑盒不含Index Primer,需搭配Cat#12417進(jìn)行完整建庫
*12592ES04中,index信息為i5 index GCCTTAT(對應(yīng)mouse來源抗體數(shù)據(jù))、AGGATAT(對應(yīng)mouse來源抗體數(shù)據(jù))、i7 index TAAGGCGA。

 

儲存條件

 

BOX-I:2-8℃保存,BOX-II:-25~-15℃保存,有效期1年。

 

使用說明

 

一、自備材料

1. 抗體:靶蛋白的一抗鼠源或者兔源

2. 文庫質(zhì)檢:Agilent 2100 Bioanalyzer DNA 1000 Chip/ High Sensitivity Chip或其他等效產(chǎn)品、文庫定量試劑。

3. 其他材料:無水乙醇、無菌超純水、低吸附槍頭、PCR管、磁力架、PCR儀等。

4. 接頭:Hieff NGS® Tagment Index Kit for Multi-CUT&Tag(Cat#12417)。

、細(xì)胞準(zhǔn)備

1. 在室溫條件下收集細(xì)胞并計數(shù),死亡的細(xì)胞染色質(zhì)松散,暴露出大量的裸DNA,轉(zhuǎn)座酶復(fù)合物隨機切割會造成比較強的噪音信號,建議樣本細(xì)胞活性不低于80% (細(xì)胞活性可以用臺盼藍(lán)染色來鑒定)。

2. 貼壁較緊的細(xì)胞如Hela細(xì)胞等可用Accutase或者Trypsin部分消化獲得。

3. 植物或真菌細(xì)胞可通過特殊處理獲得原生質(zhì)體或細(xì)胞核進(jìn)行實驗,方法可參考附錄。

4. 新鮮或者凍存的動物組織可通過特殊處理獲得細(xì)胞/細(xì)胞核懸液進(jìn)行實驗,方法可參考附錄。
、操作原理及實驗流程圖

實驗原理:利用Con A磁珠捕獲細(xì)胞并利用5% Digitonin對細(xì)胞膜進(jìn)行穿孔,選擇鼠源一抗和兔源一抗實現(xiàn)同一細(xì)胞雙靶標(biāo)研究。之后,鼠源一抗結(jié)合Anti-mouse Tn5、兔源一抗結(jié)合Anti-rabbit Tn5從而定向切割不同靶標(biāo)結(jié)合的DNA序列,再經(jīng)過一步法PCR完成二代測序文庫的構(gòu)建。對文庫進(jìn)行測序后的數(shù)據(jù)進(jìn)行barcode拆分,即可獲得雙靶標(biāo)的高分辨率靶蛋白結(jié)合的染色質(zhì)圖譜。




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