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翌圣OnePot 酶切法建庫試劑盒亮相科研期刊

2021-12-13  閱讀(967)

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榮登Nature Methods | 翌圣OnePot 酶切法建庫試劑盒亮相科研期刊

 

 

GUIDE

 導  讀


生物個體所有細胞的親緣關系可以用細胞譜系樹來描述。細胞譜系對于理解多細胞生物的胚胎發育、細胞分化、器官的維持與衰老等生理病理過程具有重要意義,目前主要通過DNA條形碼(barcode)技術記錄細胞分裂過程產生的突變來還原細胞譜系。然而,目前DNA條形碼技術的精確度為平均每個條形碼只攜帶3-5個突變,限制了科學家對復雜多細胞生物胚胎發育的全貌的研究。

 

研 究 內 容


中山大學賀雄雷團隊長期致力于DNA條形碼技術優化和創新。2021年12月2日,賀教授團隊在Nature 子刊Nature Methods(IF=28)發文“Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development”,介紹一種基于單堿基突變的細胞譜系追蹤系統SMALT(substitution mutation aided lineage tracing system),通過SMALT系統構建轉基因果蠅品系,實現在單細胞水平上對復雜多細胞生物的胚胎發育過程中細胞譜系關系進行可靠描述。


▲ 圖源論文,點擊可查看原文


此外,研究人員開發了利用細胞譜系樹還原具有分裂活性的祖先細胞群體數量的分析方法-ICPD,從細胞譜系樹推斷各器官發育過程的群體歷史特征,結果顯示,不同器官具有*的群體歷史特征,并且該特征在不同個體具有高度一致性。此外,ICPD進一步發現,各器官中分裂產生的細胞總數與器官的真實細胞數量顯著相關,對其方差解釋度達到74.5%,這表明細胞群體的分裂活性對器官大小的穩定性具有重要作用。

圖1、果蠅幼蟲各器官的分歧時間.jpg
圖2、分裂細胞數與真實器官細胞數一致性.jpg

 

翌圣提供NGS建庫完整解決方案


值得一提的是,這篇高水平文章采用翌圣Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® “一步法”DNA建庫試劑盒對果蠅DNA進行建庫。該試劑盒采用高質量的片段化酶,將片段化模塊與末端修復模塊合二為一,降低了建庫的時間和成本,可用于500 pg-1 μg動植物基因組、微生物基因組等樣本,同時能兼容FFPE DNA樣本的建庫。經測序驗證,不同GC含量的樣本,均可獲得優異的測序結果,使建庫變得更加簡單高效。

 

圖3、賀教授團隊建庫使用翌圣建庫試劑盒.jpg圖3.賀教授團隊建庫使用翌圣建庫試劑盒


目前翌圣生物針對MGI以及Illumina測序平臺均提供完善的核酸提取以及文庫制備方案,相關產品經過嚴格的批次性能與穩定性質控,確保產品的優異性能,為研究者進行高質量的科學研究提供有力的保障。

 

適用平臺

產品名稱

產品編號

規格

Illumina機械法建庫

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina® 機械法DNA建庫試劑盒

12199ES08/12199ES24/12199ES96

8T/24T/96T

Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® 機械法DNA建庫試劑盒

12201ES08/12201ES24/12201ES96

8T/24T/96T

Illumina酶切法建庫

Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® 酶切法DNA建庫試劑盒

12204ES08/12204ES24/12204ES96

8T/24T/96T

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® DNA 酶切法建庫試劑盒

12205ES08/12205ES24/12205ES96

8T/24T/96T

Illumina轉座酶法建庫

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng)  轉座酶法建庫試劑盒(1ng

12206ES08/12206ES24/12206ES96

8T/24T/96T

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 50 ng)  轉座酶法建庫試劑盒(50 ng

12207ES08/12207ES24/12207ES96

8T/24T/96T

MGI機械法建庫

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI® 機械法建庫試劑盒

13310ES16/13310ES96/13310ES98

16 T/96 T/192 T

MGI酶切法建庫

Hieff  NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI® 酶切法建庫試劑盒

13321ES16/13321ES96

16T/96T

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for MGI® DNA 酶切法建庫試劑盒

13322ES16/13322ES96

16T/96T

文庫分選/純化磁珠

Hieff NGS® DNA Selection Beads 分選磁珠

12601ES08/12601ES56/12601ES75

5mL/60mL/450mL

Qubit文庫定量

dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit試劑

12640ES60/12640ES76

100T/500T

1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit預混液

12642ES60/12642ES76

100T/500T

 

 

 

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