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RNA提出取得的基本操作步驟

閱讀:2133        發布時間:2011-12-31

RNA的提出取得準備試藥:氯仿,異丙醇,75酒精,無RNase的水或0.5SDS(溶液均需用DEPC處置過的水配合制造)

操作步驟:

1. 勻漿處置:

① 團體 將團體在液氮中磨碎,每50-100mg團體參加1ml TRIzol,用勻漿儀施行勻漿處置。樣品大小不應超過TRIzol大小10。

② 單層培育細胞 直接在培育板中參加TRIzol裂解細胞,每10cm2平面或物體表面的大小(即3.5cm直徑的培育板)加1ml,用移液器吸打幾次。TRIzol的用量應依據培育板平面或物體表面的大小而定,不決定于于細胞數。TRIzol加量不充足有可能造成提出取得的RNA有DNA污染。

③ 細胞懸液 離心使聚在一起細胞,每5-10×10動物、植物、釀母菌細胞或1×107球菌細胞參加1ml TRIzol,反反復復吸打。加TRIzol之前不要蕩滌細胞免得mRNA降解。一點釀母菌和球菌細胞需用勻漿儀處置。

2. 將勻漿樣品在室溫(15-30℃)干燥箱安放5分鐘,使核酸蛋白復合物離合。

3. 可選步驟:如樣品中包括較多氨基酸,脂肪,多糖或胞外事物(肌肉,植物支節局部等)可于2-8℃10000×g離心10分鐘,取上清。離心獲得的沉淀中涵蓋細胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中包括RNA。處置脂肪團體時,領導有數量多油脂應去除。取表白的勻漿液施行下一步操作。

4. 每運用1ml TRIzol參加0.2ml氯仿,猛烈振動15秒,室溫安放3分鐘。

5. 2-8℃10000×g離心15分鐘。樣品分為三層:底層為黃色有機相,領導為無色水相和一個半中腰層。RNA主要在水相中,水相大小約為所用TRIzol試藥的60。

6. 把水相轉移到新管中,如要離合DNA和氨基酸可保存有機相,進一步操作見后。用異丙醇沉淀水相中的RNA。每運用1ml TRIzol參加0.5ml異丙醇,室溫安放10分鐘。

7. 2-8℃10000×g離心10分鐘,離心前看不出RNA沉淀,離心后在管側和管底顯露出來膠狀沉淀。移去上清。

8. 用75酒精蕩滌RNA沉淀。每運用1ml TRIzol至少加1ml 75酒精。2-8℃不超過7500×g離心5分鐘,棄上清。

9. 室溫安放干燥或真空抽干RNA沉淀,大約晾5-10分鐘即可。不要真空離心干燥,過于干燥會造成RNA的溶解性大大減低。參加25-200μl無RNase的水或0.5SDS,用槍頭吸打幾次,55-60℃安放10分鐘使RNA溶解。如RNA用于酶切反響,勿運用SDS溶液。RNA也可用100的去離子甲酰胺溶解,-70℃保留。

常見問題剖析:

1. 得率低:

① 樣品裂解或勻漿處置不*

② RNA沉淀未溶解

A260/A280<1.65 :

① 檢驗測定吸光度時,RNA樣品沒有溶于水,而溶于了TE中。低離子液體濃度和低pH值條件下A280值偏高

②  樣品勻漿時加的試藥量太少

③ 勻漿樣品時未在室溫安放5分鐘

④ 汲取水相時混入了有機相

⑤ RNA沉淀未溶解。

RNA降解:

① 團體抽取后沒有立刻處置或冷凍

②  待提出取得RNA的樣品沒有保留于-60至-70℃,而保留在了-5至-20℃

③ 細胞在用胰酶處置時過度

④ 溶液或離心管未經RNase去除處置

⑤ 電泳時運用的甲醛pH值低于了3.5

DNA污染:

① 樣品勻漿時加的試藥量太少

②  樣品中包括有機溶劑(如酒精,DMSO等),強緩和沖突液或堿性溶液

蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的過程中作以下改進可去除這些個污染,步驟7中,每運用1ml TRIzol在水相中加0.25ml異丙純和0.25ml高鹽溶液(0.8M寧檬酸鈉和1.2M NaCl)混合離心,按之前操作施行。這種辦法可使蛋白聚糖和多糖留在溶液中,沉淀出純RNA。從包括數量多多糖的植物中提出取得RNA時應在勻漿后離心,并加上以指出操作步驟。

注意事情的項目:

1.自小量樣品(1-10mg團體或102-104細胞)中提出取得RNA時可參加少量牲粉以增進RNA沉淀。例如加800ml TRIzol勻漿樣品,沉淀RNA前加5-10μg RNase-free牲粉。牲粉會與RNA一同沉淀出來,牲粉液體濃度不高于4mg/ml是不影響第1鏈的合成,也不影響PCR反響。

2.勻漿后加氯仿之前樣品可以在-60至-70℃保留至少一個月。RNA沉淀可以保留于75 乙醇中2-8℃一星期以上或-5至-20℃一年以上。

3.分層和RNA沉淀時也可運用臺式離心思,2600×g離心30-60分鐘。

預先期待產量:1mg團體或1×106細胞提出取得RNA作別為:

肝和脾6-10μg,腰子3-4μg,橫紋肌和腦團體1-1.5μg,臍帶1-4μg,上皮細胞8-15μg,成纖維細胞5-7μg 。

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