當前位置:迪圖(上海)生物科技有限公司>>技術文章>>酶標儀在植物領域的三種應用總結
一、簡介
在基于哺乳動物細胞的研究中,酶標儀主要應用于: (1) 常規分子檢測,如核酸、蛋白濃度及酶活性分析等;(2) 信號轉導研究, 如一些細胞信號事件如 ROS,修飾的檢測;(3) 整體細胞水平的分析,如細胞的活力、凋亡和殺傷等。然而在植物領域中,酶標 儀的應用則偏向前兩個方向,此外,植物領域的酶標儀應用普遍度也不及動物,但這并不限制酶標儀在該領域的應用前景。在此, 我們結合常見的應用案例介紹酶標儀在植物領域中的應用,提升酶標儀在植物研究中的應用價值,并進一步協助植物的科研發展。
二、利用酶標儀進行常見的分子檢測和分析
在植物領域中一些基礎的分子檢測,如基于紫外吸收或熒光的 DNA,RNA 和蛋白定量及純度分析等,都可以用酶標儀進行 高通量檢測。由于原理和應用類型與研究哺乳動物細胞類似,在此就不贅述了,大家有需求可參考我們針對核酸定量的應用材料。 在此我們主要列植物領域中比較特色的幾個案例。
2.1 吸收峰和熒光光譜分析
植物領域中通常會涉及到對一些感興趣的化合物,如色素等的物理指標分析,其中就包括吸收峰分析和針對具有熒光特質的 化合物進行熒光光譜分析。通常這些分析會由分光光度計完成,但會受到通量和曲線分析能力的限制。現階段大部分 Molecular Devices 推出的配備光柵的酶標儀如 M 系列和 iD 系列都支持出色的光譜掃描分析,包括全波長光吸收和熒光光譜掃描,步進可精 確至 1 nm,可應對常見的光譜分析需求,并極大提高通量。同時配備的 SoftMax Pro 軟件可自動分析光譜圖簡化處理流程。
基于光譜掃描還可用于進一步分析具有調節熒光能力的蛋白功能,如藍藻細菌中的 Orange Carotenoid Protein (OCP) 在強 藍-綠光下會和藻膽 ( 蛋白 ) 體 (PBS) 相互作用來保護細胞。實驗中可觀察到 OCP 的引入可降低 PBS 的熒光發射強度。對于新發現 的 OCP 家族成員,我們就可以通過熒光光譜掃描功能確認其是否會淬滅 PBS 的熒光 ( 圖一 )。結果發現相較于已知的 OCP1,新 發現的 OCP2 具有較弱的熒光淬滅能力 ( 圖一,來源于文獻 Nat Plants. 2017 Jul 10;3:17089. )。
三、利用酶標儀進行植物信號分析
除了一些常見分子的分析和定量之外,常見的植物信號,如報告基因、蛋白蛋白相互作用和 ROS 分析等,也都可以用酶標儀 進行高通量的分析。
3.1 報告基因分析
基于 β-葡萄苷酸酶 (β-glucuronidase) 的 GUS報告基因系統利用了在高等植物中 β-glucuronidase 表達和活性很低,是常見 的研究植物基因功能和活力的分析方法。基于不同的底物,GUS 報告基因可用多種方法學進行檢測,包括組織染色法、光吸收法 和熒光法。在此主要介紹可用于熒光酶標儀分析的熒光法,其主要基于底物 MUG (4-methylumbelliferyl b-D-glucuronide),其 在 GUS 的作用下產生具有熒光的 4-MU (4-methylumbelliferone),可以進一步用熒光酶標儀進行分析。在進行熒光法 GUS 報告 基因檢測時,通常需要 4-MU 標準品進行校準,同時 GUS 的活性還需要進一步使用總蛋白量來校準。此外,4-MU 本身容易降解, 因此使用時注意保護和有效期。
熒光法 GUS 報告基因系統在植物研究中的應用方向很多,其中包括特定的基因啟動子活力在激素處理和壓力情況下的變化 ( 圖六,J Exp Bot. 2005 Mar;56(413):909-20. ) 和特定基因的過表達是否會影響靶基因啟動子活力 ( 圖七,Mol Plant. 2012 Sep;5 (5):1042-57. ) 等。
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