操縱氣相色譜儀如何選用不同氣體純度的氣源做載氣和輔助氣體，固然是一個老的技術題目，但是對于剛剛接觸氣相色譜儀的用戶，目前很難找到有關這方面的綜合資料，所以他們總是到處詢問究竟選擇什么樣的氣體純度的這類題目。確實是一個比較復雜的題目。選擇氣體純度時，主要取決于1色譜柱中填充物；2分析對象；3檢測器.我們建議在滿足分析要求的條件下，盡可能選用純度較高的氣體。這樣不但會進步（保持）儀器的高靈敏度，而且會延長色譜柱，整臺儀器（氣路控制部件，氣體過濾器）的壽命。實踐證實，作為中儀器，長期使用較低純度的氣體氣源，一旦要求分析低濃度的樣品時，要想恢復儀器的高靈敏度有時十分困難。對于低檔儀器，作常量或半微量分析，選用高純度的氣體，不但增加了運行本錢，有時還增加了氣路的復雜性，更輕易出現漏氣或其他的題目而影響儀器的正常操縱。
另外，為了某些特殊的分析目的要求特地在載氣中加進某些“不純物”，如：分析極性化合物添加適量的水蒸氣，操縱火焰光度檢測器時，為了進步分析硫化物的靈敏度，而添加微量硫。氣體純度低的不良影響
根據分析對象，色譜柱的類型，操縱儀器的擋次和具體檢測器，若使用分歧要求的低純度氣體，不良影響有以下幾種可能：
1.樣品失真或消失：如H2O氣使氯硅樣品水解；
2.色譜柱失效：H2O，CO2使分子篩柱失往活性，H2O氣使聚脂類固定液分解，O2使PEG固定液斷鏈。
3.有時某些氣體雜質和固定液相互作用而產生假峰；
4.對柱保存特性的影響：如：H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保存指數會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或是非極性固定液柱的保存特性，都會產生變化，使用時間越長影響越大；
5.檢測器：TCD：信噪比減小，無法調另，線性變窄，文獻中的校正因子不能使用，氧含量過大，使元件在高溫時加速老化，減少壽命；
通常用于常規分析,對于特殊高靈敏度的痕量分析應采用高一級純度的氣體,假如不在意色譜柱和儀器的使用壽命,或分析樣品組分濃度很高時,也可以不使用過高純度的氣體,由于各個制氣廠設置不同，其雜質含量將有所不同;為滿足不同的使用要求,選用不同廠家不同純度的氣源后,可以通過氣體凈化處理滿足分析要求。
