高效液相色譜柱以乙烯醇共聚物為基質的色譜柱，即使其載炭量很高也能保持表面的濕潤。多孔結構具有足夠大的平均孔徑，對小分子化合物、多肽和小分子蛋白能夠產生理想的分離效果。
在有機溶劑比例較高的流動相中，該柱具有與硅膠基質色譜柱相同的柱效，但在堿性緩沖溶液為流動相條件下，其分離效率則超過硅膠色譜柱。顯著的特點之一是基質被烷基化的填料的洗脫順序，其保留能力與碳鏈長度成正比。
高效液相色譜柱堵塞要怎么辦?
如果是遇到堵塞的情況，先要確定堵塞是由于什么原因引起的，如果是由于色譜柱中殘留的緩沖鹽引起的，這是輕微的堵塞了，可以嘗試用高比例的水相在較高的溫度下沖洗色譜柱。
如果是由于樣品原因導致色譜柱堵塞，又要考慮另外的辦法，如果是樣品中含有太多吸附性很強的物質(有時是復雜樣品中的某些雜質，無法通過過濾離心等辦法去除)沉積吸附在柱頭導致堵塞，可以嘗試使用不同的溶劑(對此類物質有較好溶解性的)慢慢沖洗。
如果是由于樣品過濾不當或者樣品在色譜柱上析出導致某些顆粒雜質堵塞了色譜柱，除了嘗試尋找合適溶劑沖洗之外，只能考慮反沖了，通常，不建議反沖色譜柱，因為可能對色譜柱造成較大損害，所以反沖是迫不得已的死馬當活馬醫的辦法，一定要慎用。做好樣品的前處理并使用預柱或在線過濾器才是保護色譜柱的好辦法!
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