DIA蛋白質組學
- 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產地
- 廠商性質 經銷商
- 更新時間 2024/3/11 13:53:04
- 訪問次數 59
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實驗介紹
DIA(data-independent acquisition,數據非依賴性采集)技術是近年來發展起來的一種新的質譜技術,屬于非標記蛋白質組學方法。采用數據非依賴性掃描模式:將質譜整個全掃描范圍分為若干個窗口,然后對每個窗口中的所有離子進行檢測、碎裂,從而無遺漏、無差異地獲得樣本中所有離子的信息。從而降低樣本檢測的缺失值,同時提高定量準確性和重復性,實現大樣本隊列中高穩定,高精準的蛋白質組定量分析。 與DDA技術相比,DIA技術的優勢包括:(1)采集所有的離子信息,實現更高的數據覆蓋度;(2)減少采集的隨機性,實現的檢測重現性、穩定性;(3)采用碎片離子定量,定量精密度、準確性、線性范圍大大提高。基于上述技術優勢,DIA技術尤其適用于大規模樣本的高度覆蓋、穩定和可追溯地分析。
實驗流程
應用方向
DIA專為大樣本量分析應用而生:
? 疾病精準分型、品系研究比較:DIA實現更加準確的定量結果,從而更精確反映疾病亞型、品系間的差異;
? 生物標志物發現:DIA接近MRM的定量能力,實現標志物篩選與初步驗證過程合二為一;
? 生物樣本信息庫構建:DIA可實現生物信息的完整保存,為后續回溯分析提供保障。
數據分析
標準數據分析內容 | |
鑒定結果統計與分析 | 樣本蛋白質及肽段鑒定柱狀圖、PCA分布圖、定量差異統計分析 |
生物信息學分析 | GO及GO富集、KEGG及KEGG富集分析、PPI互作網絡與module分析 |
差異上下調蛋白KEGG蝴蝶圖、KEGG通路功能歸屬等 | |
高級數據分析內容 | |
標志物篩選 | 集成機器學習、LASSO回歸分析、標志物panel、ROC分析 |
分子分型分析 | 無監督聚類分型分析、蛋白質組+轉錄組聯合分析、激酶分析 |
臨床表征與組學結果聯合分析 | |
疾病相關功能模塊分析 | WGCNA共表達分析 |
生存曲線分析 | 臨床分型與生存曲線分析 |
技術優勢
? 全掃描模式:數據非依賴性采集模式,大大減少高豐度干擾,全面采集高低豐度信號,數據覆蓋度提高近40%
? 超高重現性、穩定性:大樣本鑒定重復率提升近40%,定量精密度提升近1倍
? 超高定量準確度:定量能力接近金標準SRM/MRM靶向技術