離子色譜樣品前處理柱應遵循如下原則。

1. 在使用手動進行樣品預處理時，為了對樣品前處理柱提供必要的壓力，應該使用5mL大小規格的注射器。
2. 為了除去樣品前處理柱上的微量離子性污染物并對柱填料進行預處理，應該在使用前按照表2所列的合適體積的去離子水或其他適當的溶劑對樣品前處理柱進行沖洗。
3. 為了使柱床的處理效果理想化，應該按照表2*的流速使樣品溶液通過樣品前處理柱。對于基于吸附原理的樣品前處理過程，只有當樣品溶液的流速小于4.0mL/min時前處理柱的柱床才能獲得有效的利用；而對于基于離子交換原理的樣品前處理過程，只有當樣品溶液的流速小于2.0mL/min時，前處理柱的柱床才能獲得有效的利用。而當處理的樣品溶液的量小于大容量時，則過樣速度可適當加大。
4. 不管是處理樣品溶液還是標準溶液，都應該將初的流出液棄去不用。例如，將樣品溶液加入5mL的注射器中后，應該將早流出的3mL流出液棄去后，再收集下邊的2mL流出液,用來進樣進行離子色譜測定。
5. 如果要被除去的物質為有色物資或其他人眼可觀察到的物質（如AgCl沉淀），則樣品前處理柱一直可使用到有色帶擴展至距離樣品前處理柱出口3/4處。在某些特殊應用情況下，如果想得到該前處理柱的大上樣容量，則可讓樣品溶液一直通過該前處理柱，并用適當的檢測方法進行連續檢測，直到觀察到柱的穿透為止。
6. 應該注意前處理柱 必須在垂直的情況下使用，這樣對于樣品的前處理才會取得理想的結果。